148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1297 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1297  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
557 aa  1105    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00968279  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0222  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  49.29 
 
 
571 aa  586  1e-166  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1661  glycoside hydrolase family protein  49.63 
 
 
556 aa  542  1e-153  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0521911  hitchhiker  0.0032281 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0959  glycosyl hydrolase family 20 protein  29.34 
 
 
640 aa  160  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00497875  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1103  glycosy hydrolase family protein  29.38 
 
 
640 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00087575  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0071  N-acetyl-beta-hexosaminidase  30.63 
 
 
711 aa  146  8.000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3112  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  29.31 
 
 
843 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054438  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1238  glycosy hydrolase family protein  25.65 
 
 
610 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.247532  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3239  glycoside hydrolase family protein  27.64 
 
 
635 aa  131  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1051  glycosy hydrolase family protein  25.65 
 
 
610 aa  131  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0315037  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3616  glycoside hydrolase family protein  27.2 
 
 
619 aa  131  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.748752  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0519  glycoside hydrolase family protein  26.4 
 
 
619 aa  131  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0607  glycoside hydrolase family protein  28.05 
 
 
606 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1177  glycoside hydrolase family protein  25.17 
 
 
599 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3571  glycoside hydrolase family protein  26.01 
 
 
631 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.475227  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0488  glycoside hydrolase family protein  25.08 
 
 
626 aa  120  6e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1226  glycoside hydrolase family protein  25.35 
 
 
641 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.459632  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3043  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  30.66 
 
 
589 aa  111  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805232 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0607  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  24.84 
 
 
699 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0569988  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3073  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  27.84 
 
 
591 aa  100  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3733  glycoside hydrolase family 20  24.31 
 
 
595 aa  90.1  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0925128  decreased coverage  0.00246755 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.96 
 
 
515 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.57 
 
 
785 aa  75.9  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  27.92 
 
 
637 aa  74.7  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  25.53 
 
 
736 aa  73.2  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  25.57 
 
 
469 aa  72  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  25.83 
 
 
639 aa  71.6  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.64 
 
 
795 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  23.87 
 
 
816 aa  70.9  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.26 
 
 
794 aa  70.1  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  25.21 
 
 
1471 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.8 
 
 
422 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.03 
 
 
673 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.48 
 
 
790 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  22.63 
 
 
525 aa  69.3  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0390  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  28.64 
 
 
503 aa  68.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.584277 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.51 
 
 
500 aa  68.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.44 
 
 
905 aa  69.3  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  25.32 
 
 
558 aa  68.6  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  24.25 
 
 
639 aa  68.2  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03620  Beta-hexosaminidase precursor, putative  22.6 
 
 
586 aa  67.8  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  26.97 
 
 
602 aa  67.4  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.84 
 
 
481 aa  67.4  0.0000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.46 
 
 
779 aa  67  0.0000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.17 
 
 
584 aa  67  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  24.26 
 
 
777 aa  66.6  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.52 
 
 
609 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.2 
 
 
762 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  25 
 
 
766 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.61 
 
 
821 aa  65.1  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.91 
 
 
772 aa  65.1  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.52 
 
 
593 aa  65.1  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.39 
 
 
533 aa  65.1  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0701  glycoside hydrolase family protein  26.07 
 
 
652 aa  65.1  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308289  normal  0.494324 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.2 
 
 
779 aa  64.7  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.42 
 
 
812 aa  64.3  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01502  N-acetylglucosaminidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HGI3]  26.11 
 
 
603 aa  63.5  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000172563  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.02 
 
 
797 aa  63.5  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.38 
 
 
811 aa  63.5  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.41 
 
 
618 aa  63.5  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.48 
 
 
781 aa  63.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.69 
 
 
493 aa  63.2  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.62 
 
 
673 aa  63.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.28 
 
 
820 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2737  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.69 
 
 
530 aa  62.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.28 
 
 
528 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.46 
 
 
546 aa  61.6  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  25 
 
 
549 aa  62  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.3 
 
 
504 aa  61.2  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.91 
 
 
774 aa  60.8  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.88 
 
 
613 aa  60.8  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.89 
 
 
636 aa  60.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  24.36 
 
 
776 aa  59.7  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.24 
 
 
775 aa  59.7  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.19 
 
 
527 aa  60.1  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0397  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.5 
 
 
722 aa  60.1  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.571244  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.43 
 
 
526 aa  60.1  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0842  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.42 
 
 
489 aa  58.9  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  24 
 
 
812 aa  59.3  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.26 
 
 
518 aa  58.9  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.63 
 
 
525 aa  58.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  23.95 
 
 
807 aa  58.2  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.4 
 
 
534 aa  58.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.67 
 
 
542 aa  58.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  27.96 
 
 
1140 aa  57.8  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.53 
 
 
534 aa  57.4  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1424  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.38 
 
 
643 aa  57.4  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.98 
 
 
634 aa  57.4  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32069  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  23.05 
 
 
614 aa  57  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.28283 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.81 
 
 
688 aa  57  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.13 
 
 
605 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.13 
 
 
613 aa  56.2  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.9 
 
 
760 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06345  N-acetyl-beta-hexosaminidase  27.84 
 
 
778 aa  57  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.27 
 
 
688 aa  56.2  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.27 
 
 
665 aa  55.5  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.23 
 
 
636 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1725  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  24.17 
 
 
758 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.75 
 
 
756 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.56 
 
 
765 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>