62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1103 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1103  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 		 640 aa  1316    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00087575  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0959  glycosyl hydrolase family 20 protein  96.88 
 
 		 640 aa  1286    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00497875  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3239  glycoside hydrolase family protein  49.3 
 
 		 635 aa  630  1e-179  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3571  glycoside hydrolase family protein  36.7 
 
 		 631 aa  377  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.475227  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1297  glycoside hydrolase family protein  29.38 
 
 		 557 aa  151  4e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00968279  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1661  glycoside hydrolase family protein  30.19 
 
 		 556 aa  142  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0521911  hitchhiker  0.0032281 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0222  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  27.89 
 
 		 571 aa  134  6e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3112  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  22.93 
 
 		 843 aa  99.4  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1238  glycosy hydrolase family protein  24.29 
 
 		 610 aa  95.9  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.247532  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1051  glycosy hydrolase family protein  24.56 
 
 		 610 aa  95.5  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0315037  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1177  glycoside hydrolase family protein  21.17 
 
 		 599 aa  82.8  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0071  N-acetyl-beta-hexosaminidase  23.19 
 
 		 711 aa  79  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0488  glycoside hydrolase family protein  24.09 
 
 		 626 aa  77  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1226  glycoside hydrolase family protein  22.51 
 
 		 641 aa  74.3  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.459632  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3073  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  23.12 
 
 		 591 aa  67.8  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.76 
 
 		 772 aa  66.6  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0607  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  21.45 
 
 		 699 aa  65.1  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0569988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3733  glycoside hydrolase family 20  23.46 
 
 		 595 aa  63.9  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0925128  decreased coverage  0.00246755 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.16 
 
 		 481 aa  63.5  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0607  glycoside hydrolase family protein  21.68 
 
 		 606 aa  60.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0519  glycoside hydrolase family protein  22.85 
 
 		 619 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3616  glycoside hydrolase family protein  21.98 
 
 		 619 aa  58.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.748752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.69 
 
 		 774 aa  57.8  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.21 
 
 		 794 aa  55.5  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3043  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  22.27 
 
 		 589 aa  55.1  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805232 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.71 
 
 		 775 aa  55.1  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.81 
 
 		 673 aa  54.3  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.29 
 
 		 549 aa  54.3  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.6 
 
 		 493 aa  53.9  0.000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.1 
 
 		 779 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.31 
 
 		 779 aa  52.4  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.16 
 
 		 613 aa  52.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.17 
 
 		 504 aa  52  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  25 
 
 		 1471 aa  51.6  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.12 
 
 		 673 aa  50.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.35 
 
 		 618 aa  50.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.63 
 
 		 760 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.15 
 
 		 515 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.12 
 
 		 533 aa  48.5  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  25 
 
 		 777 aa  48.1  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0686  glycoside hydrolase family protein  22.37 
 
 		 673 aa  48.5  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0317867 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  23.92 
 
 		 637 aa  48.5  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01502  N-acetylglucosaminidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HGI3]  25.31 
 
 		 603 aa  48.1  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000172563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0701  glycoside hydrolase family protein  21.51 
 
 		 652 aa  48.1  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308289  normal  0.494324 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.51 
 
 		 542 aa  47.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  25 
 
 		 609 aa  47.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.41 
 
 		 529 aa  47.4  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.25 
 
 		 525 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.6 
 
 		 790 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  23.26 
 
 		 602 aa  47  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.05 
 
 		 905 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.61 
 
 		 766 aa  46.2  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.75 
 
 		 665 aa  46.2  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  25.58 
 
 		 558 aa  45.8  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  21.36 
 
 		 795 aa  46.2  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.74 
 
 		 683 aa  45.8  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1723  hypothetical protein  25.84 
 
 		 354 aa  45.4  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.63 
 
 		 785 aa  45.8  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.24 
 
 		 547 aa  45.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.53 
 
 		 821 aa  44.7  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.19 
 
 		 549 aa  43.9  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  21.92 
 
 		 525 aa  43.5  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>