35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0701 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0701  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 652 aa  1308    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308289  normal  0.494324 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1177  glycoside hydrolase family protein  24.92 
 
 		 599 aa  87  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1238  glycosy hydrolase family protein  22.71 
 
 		 610 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.247532  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1051  glycosy hydrolase family protein  22.71 
 
 		 610 aa  85.1  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0315037  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3616  glycoside hydrolase family protein  25.26 
 
 		 619 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.748752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0071  N-acetyl-beta-hexosaminidase  24.75 
 
 		 711 aa  72.8  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0519  glycoside hydrolase family protein  25.26 
 
 		 619 aa  71.6  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3112  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  21.11 
 
 		 843 aa  70.5  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1226  glycoside hydrolase family protein  23.91 
 
 		 641 aa  67.4  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.459632  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3944  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  25.94 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.055877  normal  0.867275 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1723  hypothetical protein  24.89 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3073  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  26.1 
 
 		 591 aa  61.2  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0607  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  22.68 
 
 		 699 aa  60.8  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0569988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0488  glycoside hydrolase family protein  20.79 
 
 		 626 aa  57.8  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1661  glycoside hydrolase family protein  23.91 
 
 		 556 aa  56.2  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0521911  hitchhiker  0.0032281 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1297  glycoside hydrolase family protein  26.07 
 
 		 557 aa  56.2  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00968279  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3043  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  26.67 
 
 		 589 aa  55.5  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805232 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3571  glycoside hydrolase family protein  23.59 
 
 		 631 aa  53.5  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.475227  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0222  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  22.29 
 
 		 571 aa  53.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0607  glycoside hydrolase family protein  22.48 
 
 		 606 aa  52  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0686  glycoside hydrolase family protein  24.73 
 
 		 673 aa  50.4  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0317867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0390  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  21.29 
 
 		 503 aa  50.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.584277 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1725  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  21.95 
 
 		 758 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3733  glycoside hydrolase family 20  24.9 
 
 		 595 aa  49.7  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0925128  decreased coverage  0.00246755 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0959  glycosyl hydrolase family 20 protein  22.09 
 
 		 640 aa  49.7  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00497875  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.28 
 
 		 493 aa  48.5  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.53 
 
 		 756 aa  48.5  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1103  glycosy hydrolase family protein  21.51 
 
 		 640 aa  48.1  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00087575  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3239  glycoside hydrolase family protein  22.61 
 
 		 635 aa  47  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1300  transcriptional regulator  40.2 
 
 		 106 aa  45.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.223469  normal  0.471432 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.39 
 
 		 593 aa  45.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  25.37 
 
 		 639 aa  45.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.58 
 
 		 504 aa  44.7  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32069  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  23.63 
 
 		 614 aa  44.3  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.28283 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  25.68 
 
 		 639 aa  44.3  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>