172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1177 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1177  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
599 aa  1231    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3616  glycoside hydrolase family protein  47.41 
 
 
619 aa  509  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.748752  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0519  glycoside hydrolase family protein  47.67 
 
 
619 aa  502  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0488  glycoside hydrolase family protein  38.61 
 
 
626 aa  429  1e-119  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1226  glycoside hydrolase family protein  35.44 
 
 
641 aa  384  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.459632  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3073  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  36.96 
 
 
591 aa  337  2.9999999999999997e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3043  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  37.63 
 
 
589 aa  336  7.999999999999999e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805232 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3733  glycoside hydrolase family 20  36.76 
 
 
595 aa  326  6e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0925128  decreased coverage  0.00246755 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1238  glycosy hydrolase family protein  36.08 
 
 
610 aa  290  6e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.247532  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1051  glycosy hydrolase family protein  36.08 
 
 
610 aa  289  8e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0315037  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0607  glycoside hydrolase family protein  32.04 
 
 
606 aa  259  7e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0071  N-acetyl-beta-hexosaminidase  37.89 
 
 
711 aa  246  8e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3112  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  24.84 
 
 
843 aa  171  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054438  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0607  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  29.2 
 
 
699 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0569988  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1297  glycoside hydrolase family protein  24.71 
 
 
557 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00968279  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1661  glycoside hydrolase family protein  24.02 
 
 
556 aa  110  6e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0521911  hitchhiker  0.0032281 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0222  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  23.38 
 
 
571 aa  109  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1725  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  24.95 
 
 
758 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3571  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 
631 aa  107  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.475227  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.1 
 
 
526 aa  98.2  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.62 
 
 
905 aa  95.1  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7462  hypothetical protein  30.89 
 
 
449 aa  91.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.510583 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.64 
 
 
821 aa  90.1  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.52 
 
 
584 aa  87.4  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0701  glycoside hydrolase family protein  24.92 
 
 
652 aa  87  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308289  normal  0.494324 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.27 
 
 
542 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.26 
 
 
553 aa  85.5  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.96 
 
 
422 aa  84  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1103  glycosy hydrolase family protein  21.17 
 
 
640 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00087575  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0959  glycosyl hydrolase family 20 protein  20.55 
 
 
640 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00497875  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.47 
 
 
593 aa  83.2  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.35 
 
 
762 aa  83.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.53 
 
 
781 aa  82.8  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0540  glycosy hydrolase family protein  26.99 
 
 
833 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152646  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0725  chitinase  26.7 
 
 
856 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.540847  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0143  putative beta-N-acetylhexosaminidase  26.7 
 
 
833 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1445  putative beta-N-acetylhexosaminidase  26.7 
 
 
833 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0556  glycosy hydrolase family protein  26.7 
 
 
833 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2873  putative beta-N-acetylhexosaminidase  26.7 
 
 
833 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3173  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  26.7 
 
 
833 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  24.35 
 
 
637 aa  80.5  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2880  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.92 
 
 
827 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.09 
 
 
545 aa  80.1  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0390  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  27.92 
 
 
503 aa  79.7  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.584277 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.94 
 
 
634 aa  79  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.86 
 
 
534 aa  79.3  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.52 
 
 
812 aa  79.3  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2738  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.51 
 
 
827 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  26.78 
 
 
558 aa  78.6  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.66 
 
 
688 aa  79  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.33 
 
 
688 aa  78.6  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.11 
 
 
505 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.52 
 
 
775 aa  76.6  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.2 
 
 
812 aa  77  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6150  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.12 
 
 
827 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0451  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  25.6 
 
 
836 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899024  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2136  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  38.38 
 
 
756 aa  75.9  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.386965  normal  0.21464 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  27.5 
 
 
816 aa  75.1  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2206  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.51 
 
 
837 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.993622  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2820  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.51 
 
 
837 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2831  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.51 
 
 
828 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.11 
 
 
794 aa  74.3  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.63 
 
 
533 aa  73.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.29 
 
 
760 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.57 
 
 
525 aa  73.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  25.3 
 
 
736 aa  73.6  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.64 
 
 
857 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  27.16 
 
 
543 aa  72.8  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3239  glycoside hydrolase family protein  20 
 
 
635 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.97 
 
 
504 aa  72.4  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  21.15 
 
 
602 aa  72.4  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.02 
 
 
493 aa  72  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.63 
 
 
790 aa  71.6  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2737  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.54 
 
 
530 aa  71.2  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536035  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.24 
 
 
797 aa  70.9  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.82 
 
 
884 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  29.28 
 
 
525 aa  70.9  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.79 
 
 
785 aa  70.5  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  25.38 
 
 
777 aa  70.1  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.8 
 
 
628 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01265  hypothetical protein  30.49 
 
 
883 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.88 
 
 
853 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.63 
 
 
546 aa  69.3  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  25 
 
 
447 aa  69.3  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1396  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.11 
 
 
913 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.95 
 
 
534 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004191  beta-hexosaminidase  30.49 
 
 
883 aa  68.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.540073  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00650  N-acetyl-beta-hexosaminidase  24.91 
 
 
473 aa  68.2  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735936  normal  0.194133 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1924  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.83 
 
 
664 aa  67.4  0.0000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.234624  decreased coverage  0.00104389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.48 
 
 
605 aa  67  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.08 
 
 
529 aa  67  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.16 
 
 
834 aa  66.6  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2949  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.11 
 
 
913 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0525073  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.02 
 
 
863 aa  66.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0397  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.64 
 
 
722 aa  66.2  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.571244  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1025  beta-hexosaminidase  27.5 
 
 
879 aa  65.9  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.12 
 
 
868 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1405  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.08 
 
 
910 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.33 
 
 
766 aa  65.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1432  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.08 
 
 
915 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>