174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2136 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_2136  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  100 
 
 
756 aa  1558    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.386965  normal  0.21464 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  32.66 
 
 
1471 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7462  hypothetical protein  33.76 
 
 
449 aa  235  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.510583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0390  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  27.65 
 
 
503 aa  150  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.584277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.91 
 
 
756 aa  145  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02424  beta-N-hexosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00640)  26.63 
 
 
773 aa  139  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0398118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.43 
 
 
655 aa  109  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.54 
 
 
542 aa  109  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  30.71 
 
 
525 aa  109  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.71 
 
 
781 aa  108  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.39 
 
 
493 aa  108  4e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.28 
 
 
821 aa  107  9e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.44 
 
 
683 aa  107  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.32 
 
 
593 aa  107  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.1 
 
 
549 aa  107  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.62 
 
 
762 aa  106  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.93 
 
 
812 aa  106  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.73 
 
 
613 aa  105  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.94 
 
 
584 aa  104  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.33 
 
 
812 aa  104  5e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.45 
 
 
905 aa  103  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.36 
 
 
553 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.47 
 
 
688 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1815  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.32 
 
 
728 aa  102  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0101329  normal  0.0951479 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  30.54 
 
 
558 aa  102  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.54 
 
 
852 aa  102  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.68 
 
 
504 aa  101  5e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.1 
 
 
515 aa  100  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.43 
 
 
613 aa  100  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.77 
 
 
549 aa  100  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  26.95 
 
 
816 aa  99.8  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.48 
 
 
528 aa  99.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0607  glycoside hydrolase family protein  24.44 
 
 
606 aa  98.2  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.6 
 
 
526 aa  97.8  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.99 
 
 
545 aa  97.8  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.89 
 
 
518 aa  97.8  7e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  26.25 
 
 
639 aa  97.4  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  25.96 
 
 
639 aa  97.1  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.46 
 
 
618 aa  95.9  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.2 
 
 
766 aa  95.9  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.33 
 
 
774 aa  95.1  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.96 
 
 
811 aa  94.4  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.11 
 
 
634 aa  94  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3250  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.46 
 
 
651 aa  93.2  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0167827  decreased coverage  0.00105641 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.06 
 
 
605 aa  92.8  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.61 
 
 
422 aa  93.2  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.79 
 
 
785 aa  92.8  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  25.56 
 
 
889 aa  91.7  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  24.71 
 
 
602 aa  92  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.08 
 
 
795 aa  91.7  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.99 
 
 
797 aa  91.7  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.48 
 
 
665 aa  91.7  5e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.16 
 
 
775 aa  90.9  8e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1924  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.06 
 
 
664 aa  90.9  8e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.234624  decreased coverage  0.00104389 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  28.16 
 
 
637 aa  90.9  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.18 
 
 
627 aa  90.1  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.64 
 
 
790 aa  90.1  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.9 
 
 
884 aa  90.5  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  29.14 
 
 
1140 aa  90.1  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.15 
 
 
447 aa  90.5  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.11 
 
 
676 aa  89.7  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.28 
 
 
525 aa  90.1  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.27 
 
 
760 aa  89.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  29.54 
 
 
543 aa  89.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.67 
 
 
609 aa  89  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.18 
 
 
546 aa  89  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.13 
 
 
533 aa  88.6  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.93 
 
 
820 aa  88.2  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  29.24 
 
 
469 aa  87.8  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1115  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.45 
 
 
888 aa  87.8  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0366712  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.87 
 
 
673 aa  86.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.37 
 
 
857 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.02 
 
 
618 aa  87.4  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.75 
 
 
534 aa  87.4  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.23 
 
 
765 aa  86.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.66 
 
 
794 aa  86.7  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.58 
 
 
529 aa  86.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.05 
 
 
500 aa  85.9  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.52 
 
 
688 aa  85.5  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00650  N-acetyl-beta-hexosaminidase  29.17 
 
 
473 aa  85.1  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735936  normal  0.194133 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  24.18 
 
 
736 aa  85.1  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0071  N-acetyl-beta-hexosaminidase  24.92 
 
 
711 aa  85.1  0.000000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  25.58 
 
 
639 aa  84.7  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1211  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.97 
 
 
888 aa  84.7  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000482778  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1424  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.31 
 
 
643 aa  84.7  0.000000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.55 
 
 
639 aa  84  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  27.4 
 
 
777 aa  83.6  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3509  beta-hexosaminidase b precursor  25.18 
 
 
896 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  24.19 
 
 
795 aa  84  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.85 
 
 
527 aa  83.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.25 
 
 
853 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.14 
 
 
858 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.12 
 
 
534 aa  83.2  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.86 
 
 
834 aa  83.2  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.68 
 
 
547 aa  83.2  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  27.95 
 
 
807 aa  83.2  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.12 
 
 
673 aa  83.2  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.97 
 
 
628 aa  82.4  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.9 
 
 
533 aa  82.4  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1311  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.54 
 
 
888 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>