173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0607 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0607  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
606 aa  1265    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1238  glycosy hydrolase family protein  40.78 
 
 
610 aa  489  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.247532  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1051  glycosy hydrolase family protein  40.78 
 
 
610 aa  485  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0315037  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0071  N-acetyl-beta-hexosaminidase  37.41 
 
 
711 aa  389  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0488  glycoside hydrolase family protein  39.01 
 
 
626 aa  311  2e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1226  glycoside hydrolase family protein  31.1 
 
 
641 aa  287  4e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.459632  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3616  glycoside hydrolase family protein  33.72 
 
 
619 aa  282  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.748752  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0519  glycoside hydrolase family protein  33.71 
 
 
619 aa  270  5e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1177  glycoside hydrolase family protein  32.04 
 
 
599 aa  259  7e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3073  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  33.01 
 
 
591 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3043  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  30.77 
 
 
589 aa  224  4e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805232 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3733  glycoside hydrolase family 20  28.12 
 
 
595 aa  202  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0925128  decreased coverage  0.00246755 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3112  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  26.89 
 
 
843 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054438  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0222  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  27.23 
 
 
571 aa  134  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1297  glycoside hydrolase family protein  28.05 
 
 
557 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00968279  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1661  glycoside hydrolase family protein  26.22 
 
 
556 aa  120  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0521911  hitchhiker  0.0032281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0607  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  26.7 
 
 
699 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0569988  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0390  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  27.89 
 
 
503 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.584277 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2136  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  24.44 
 
 
756 aa  98.2  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.386965  normal  0.21464 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1725  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  23.35 
 
 
758 aa  94  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  23.48 
 
 
469 aa  89.7  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.47 
 
 
553 aa  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  23 
 
 
905 aa  88.2  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.9 
 
 
534 aa  87.4  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.88 
 
 
765 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02424  beta-N-hexosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00640)  23.6 
 
 
773 aa  85.9  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0398118 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.1 
 
 
545 aa  85.9  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.95 
 
 
527 aa  86.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  24.59 
 
 
777 aa  85.1  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.95 
 
 
504 aa  84.7  0.000000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.39 
 
 
515 aa  84.7  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.57 
 
 
529 aa  82.8  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.28 
 
 
683 aa  82  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.56 
 
 
756 aa  82  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  22.32 
 
 
525 aa  81.6  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  23.27 
 
 
543 aa  81.3  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.94 
 
 
760 aa  81.3  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.97 
 
 
655 aa  80.9  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.18 
 
 
605 aa  80.9  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.29 
 
 
774 aa  80.5  0.00000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  21.95 
 
 
1471 aa  80.5  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.01 
 
 
542 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.25 
 
 
447 aa  79  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.04 
 
 
790 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.21 
 
 
628 aa  79  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.06 
 
 
493 aa  78.6  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  20.89 
 
 
821 aa  78.2  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.66 
 
 
534 aa  78.2  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.08 
 
 
526 aa  77.4  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  20.74 
 
 
781 aa  77  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.72 
 
 
795 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3250  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.88 
 
 
651 aa  75.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0167827  decreased coverage  0.00105641 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  22.52 
 
 
602 aa  75.9  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.18 
 
 
505 aa  74.7  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  21.49 
 
 
816 aa  73.9  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0397  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.15 
 
 
722 aa  73.9  0.000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.571244  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7462  hypothetical protein  22.67 
 
 
449 aa  73.9  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.510583 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.63 
 
 
500 aa  73.6  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1405  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.22 
 
 
910 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  23.42 
 
 
639 aa  73.2  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2949  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.29 
 
 
913 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0525073  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  22.98 
 
 
639 aa  73.6  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.48 
 
 
775 aa  72.4  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.8 
 
 
422 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.45 
 
 
609 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.93 
 
 
797 aa  72  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1396  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.2 
 
 
913 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  23.12 
 
 
558 aa  71.2  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1432  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.66 
 
 
915 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.45 
 
 
613 aa  70.9  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.31 
 
 
794 aa  70.5  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.89 
 
 
533 aa  70.5  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.36 
 
 
546 aa  69.7  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.44 
 
 
584 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  23.6 
 
 
614 aa  69.3  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  20.5 
 
 
772 aa  68.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.45 
 
 
688 aa  69.3  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.96 
 
 
549 aa  69.3  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  21.97 
 
 
736 aa  69.3  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.88 
 
 
779 aa  68.9  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  22.89 
 
 
807 aa  68.6  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.19 
 
 
639 aa  68.2  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  24.68 
 
 
639 aa  67.8  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.36 
 
 
593 aa  67.4  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  20.59 
 
 
785 aa  67.4  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  22.14 
 
 
776 aa  67  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.45 
 
 
762 aa  66.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.89 
 
 
618 aa  66.6  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.02 
 
 
634 aa  66.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.42 
 
 
779 aa  65.5  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3571  glycoside hydrolase family protein  22.04 
 
 
631 aa  65.9  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.475227  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.97 
 
 
688 aa  65.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1815  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.46 
 
 
728 aa  65.9  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0101329  normal  0.0951479 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0686  glycoside hydrolase family protein  21.11 
 
 
673 aa  65.1  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0317867 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.19 
 
 
866 aa  65.1  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.34 
 
 
525 aa  64.7  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.3 
 
 
528 aa  64.7  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  20.37 
 
 
795 aa  64.3  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0556  glycosy hydrolase family protein  33.96 
 
 
833 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3173  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  33.96 
 
 
833 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>