54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3571 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3571  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 631 aa  1310    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.475227  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1103  glycosy hydrolase family protein  36.7 
 
 		 640 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00087575  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0959  glycosyl hydrolase family 20 protein  36.24 
 
 		 640 aa  376  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00497875  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3239  glycoside hydrolase family protein  34.39 
 
 		 635 aa  352  8e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1661  glycoside hydrolase family protein  25.81 
 
 		 556 aa  117  6.9999999999999995e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0521911  hitchhiker  0.0032281 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1297  glycoside hydrolase family protein  26.01 
 
 		 557 aa  114  5e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00968279  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1177  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 599 aa  107  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0222  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  25.07 
 
 		 571 aa  103  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3112  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  25.09 
 
 		 843 aa  98.6  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3043  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  23.5 
 
 		 589 aa  97.1  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805232 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3616  glycoside hydrolase family protein  23.47 
 
 		 619 aa  96.7  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.748752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0519  glycoside hydrolase family protein  23.2 
 
 		 619 aa  96.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0071  N-acetyl-beta-hexosaminidase  26.22 
 
 		 711 aa  96.3  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1051  glycosy hydrolase family protein  23.23 
 
 		 610 aa  95.5  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0315037  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1238  glycosy hydrolase family protein  23.23 
 
 		 610 aa  95.9  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.247532  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1226  glycoside hydrolase family protein  22.82 
 
 		 641 aa  94.7  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.459632  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0488  glycoside hydrolase family protein  23.34 
 
 		 626 aa  93.6  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3733  glycoside hydrolase family 20  23.89 
 
 		 595 aa  85.9  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0925128  decreased coverage  0.00246755 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3073  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  23.61 
 
 		 591 aa  83.2  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0607  glycoside hydrolase family protein  22.04 
 
 		 606 aa  65.9  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0607  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  22.52 
 
 		 699 aa  63.9  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0569988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.63 
 
 		 834 aa  57  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.16 
 
 		 774 aa  55.5  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0686  glycoside hydrolase family protein  24.39 
 
 		 673 aa  54.7  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0317867 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.91 
 
 		 772 aa  54.3  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0701  glycoside hydrolase family protein  23.59 
 
 		 652 aa  53.5  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308289  normal  0.494324 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  23.36 
 
 		 639 aa  53.5  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0397  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.07 
 
 		 722 aa  52.8  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.571244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  21.79 
 
 		 639 aa  52  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  22.27 
 
 		 639 aa  51.6  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  22.84 
 
 		 602 aa  49.7  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.21 
 
 		 605 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.86 
 
 		 549 aa  49.3  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.65 
 
 		 665 aa  48.9  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.44 
 
 		 613 aa  48.5  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.63 
 
 		 481 aa  48.9  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.87 
 
 		 673 aa  48.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.26 
 
 		 766 aa  47.8  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  25.32 
 
 		 637 aa  47.4  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  21.62 
 
 		 1140 aa  47.4  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1725  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  24.08 
 
 		 758 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.36 
 
 		 673 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.68 
 
 		 811 aa  45.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1723  hypothetical protein  21.86 
 
 		 354 aa  45.8  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  21.55 
 
 		 1471 aa  45.4  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.69 
 
 		 639 aa  45.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.13 
 
 		 618 aa  45.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  21.33 
 
 		 558 aa  45.1  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.08 
 
 		 785 aa  45.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0390  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  24.87 
 
 		 503 aa  45.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.584277 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  21.98 
 
 		 777 aa  45.1  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.56 
 
 		 779 aa  44.7  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.9 
 
 		 613 aa  44.7  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.55 
 
 		 688 aa  44.3  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>