39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3239 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3239  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 635 aa  1311    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1103  glycosy hydrolase family protein  49.3 
 
 		 640 aa  630  1e-179  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00087575  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0959  glycosyl hydrolase family 20 protein  49.53 
 
 		 640 aa  630  1e-179  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00497875  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3571  glycoside hydrolase family protein  34.39 
 
 		 631 aa  352  8e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.475227  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1297  glycoside hydrolase family protein  27.55 
 
 		 557 aa  128  3e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00968279  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1661  glycoside hydrolase family protein  25.85 
 
 		 556 aa  109  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0521911  hitchhiker  0.0032281 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0222  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  23.71 
 
 		 571 aa  100  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3112  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  24.65 
 
 		 843 aa  76.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1177  glycoside hydrolase family protein  20 
 
 		 599 aa  72.4  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1238  glycosy hydrolase family protein  21.73 
 
 		 610 aa  67.8  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.247532  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1051  glycosy hydrolase family protein  21.73 
 
 		 610 aa  67.4  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0315037  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0071  N-acetyl-beta-hexosaminidase  20.24 
 
 		 711 aa  62.4  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0607  glycoside hydrolase family protein  20.75 
 
 		 606 aa  58.2  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0488  glycoside hydrolase family protein  21.54 
 
 		 626 aa  57.4  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3733  glycoside hydrolase family 20  23.9 
 
 		 595 aa  57  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0925128  decreased coverage  0.00246755 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1226  glycoside hydrolase family protein  18.4 
 
 		 641 aa  56.2  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.459632  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3616  glycoside hydrolase family protein  20.11 
 
 		 619 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.748752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0607  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  23.57 
 
 		 699 aa  55.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0569988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0519  glycoside hydrolase family protein  20.81 
 
 		 619 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.02 
 
 		 481 aa  51.6  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.67 
 
 		 772 aa  50.4  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3043  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  24.88 
 
 		 589 aa  50.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3073  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  22.32 
 
 		 591 aa  49.7  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.73 
 
 		 760 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0686  glycoside hydrolase family protein  25.81 
 
 		 673 aa  49.3  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0317867 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01502  N-acetylglucosaminidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HGI3]  21.2 
 
 		 603 aa  48.5  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000172563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.96 
 
 		 774 aa  48.5  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.11 
 
 		 673 aa  47.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.69 
 
 		 794 aa  47.8  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32069  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  19.13 
 
 		 614 aa  47.8  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.28283 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.77 
 
 		 504 aa  47.4  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0701  glycoside hydrolase family protein  22.61 
 
 		 652 aa  47  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308289  normal  0.494324 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.6 
 
 		 493 aa  46.2  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.11 
 
 		 533 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.33 
 
 		 775 aa  45.8  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  20.16 
 
 		 665 aa  45.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.33 
 
 		 779 aa  44.7  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  23.31 
 
 		 1471 aa  44.3  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.08 
 
 		 613 aa  43.9  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>