102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3073 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3073  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  100 
 
 
591 aa  1199    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3043  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  46.68 
 
 
589 aa  471  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805232 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3733  glycoside hydrolase family 20  41.31 
 
 
595 aa  394  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0925128  decreased coverage  0.00246755 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1177  glycoside hydrolase family protein  36.96 
 
 
599 aa  337  2.9999999999999997e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3616  glycoside hydrolase family protein  37.06 
 
 
619 aa  317  5e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.748752  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1226  glycoside hydrolase family protein  32.08 
 
 
641 aa  310  5.9999999999999995e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.459632  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0519  glycoside hydrolase family protein  37.07 
 
 
619 aa  310  5.9999999999999995e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0488  glycoside hydrolase family protein  33.81 
 
 
626 aa  297  3e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1238  glycosy hydrolase family protein  33.97 
 
 
610 aa  233  5e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.247532  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1051  glycosy hydrolase family protein  33.7 
 
 
610 aa  229  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0315037  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0607  glycoside hydrolase family protein  33.01 
 
 
606 aa  228  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0071  N-acetyl-beta-hexosaminidase  34.39 
 
 
711 aa  206  1e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3112  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  25.79 
 
 
843 aa  128  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054438  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1661  glycoside hydrolase family protein  25.36 
 
 
556 aa  111  5e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0521911  hitchhiker  0.0032281 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0222  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  24.82 
 
 
571 aa  99.8  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1297  glycoside hydrolase family protein  27.84 
 
 
557 aa  92.4  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00968279  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0607  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  22.8 
 
 
699 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0569988  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3571  glycoside hydrolase family protein  23.61 
 
 
631 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.475227  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0959  glycosyl hydrolase family 20 protein  22.82 
 
 
640 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00497875  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1103  glycosy hydrolase family protein  23.12 
 
 
640 aa  67.8  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00087575  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0701  glycoside hydrolase family protein  26.1 
 
 
652 aa  61.2  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308289  normal  0.494324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.42 
 
 
505 aa  59.7  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1924  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.54 
 
 
664 aa  58.2  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.234624  decreased coverage  0.00104389 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1396  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.47 
 
 
913 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2949  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.53 
 
 
913 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0525073  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1725  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  22.5 
 
 
758 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1405  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.47 
 
 
910 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1432  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.47 
 
 
915 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.46 
 
 
518 aa  55.5  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0390  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  24.92 
 
 
503 aa  55.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.584277 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.19 
 
 
584 aa  55.1  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  34 
 
 
868 aa  54.3  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  20.66 
 
 
504 aa  54.3  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.34 
 
 
779 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3250  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.38 
 
 
651 aa  53.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0167827  decreased coverage  0.00105641 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.35 
 
 
760 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  36 
 
 
639 aa  52.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.34 
 
 
493 aa  52.4  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.1 
 
 
636 aa  52.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  29.47 
 
 
602 aa  52  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.41 
 
 
790 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.1 
 
 
811 aa  51.2  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.74 
 
 
546 aa  51.2  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2590  glycoside hydrolase family protein  21.78 
 
 
956 aa  50.8  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01265  hypothetical protein  30.43 
 
 
883 aa  50.4  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  32.99 
 
 
736 aa  50.4  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.47 
 
 
422 aa  50.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.16 
 
 
605 aa  50.4  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.81 
 
 
863 aa  50.4  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  33.04 
 
 
558 aa  50.4  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.06 
 
 
447 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7462  hypothetical protein  32.58 
 
 
449 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.510583 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  23.58 
 
 
1471 aa  49.7  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3239  glycoside hydrolase family protein  22.32 
 
 
635 aa  49.7  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2136  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  27.18 
 
 
756 aa  49.3  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.386965  normal  0.21464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.46 
 
 
528 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.17 
 
 
534 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  39.29 
 
 
639 aa  48.9  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.48 
 
 
526 aa  48.9  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004191  beta-hexosaminidase  29.57 
 
 
883 aa  48.9  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.540073  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.67 
 
 
593 aa  48.1  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.23 
 
 
781 aa  48.1  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.69 
 
 
812 aa  47.8  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.69 
 
 
812 aa  48.1  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.63 
 
 
634 aa  47.8  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00650  N-acetyl-beta-hexosaminidase  22.46 
 
 
473 aa  47.8  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735936  normal  0.194133 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  27.72 
 
 
777 aa  47.4  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.41 
 
 
533 aa  47.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  31.01 
 
 
469 aa  47.4  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1815  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.37 
 
 
728 aa  47  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0101329  normal  0.0951479 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.48 
 
 
866 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.29 
 
 
628 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  26.8 
 
 
795 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  32 
 
 
905 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  21.25 
 
 
525 aa  46.2  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.44 
 
 
481 aa  45.8  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0451  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  29.51 
 
 
836 aa  45.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899024  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.22 
 
 
683 aa  45.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2206  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.64 
 
 
837 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.993622  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2880  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.27 
 
 
827 aa  45.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2820  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.64 
 
 
837 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2831  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.64 
 
 
828 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.79 
 
 
821 aa  45.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2738  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.27 
 
 
827 aa  45.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.03 
 
 
785 aa  45.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.5 
 
 
515 aa  45.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  27.55 
 
 
816 aa  45.1  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  29 
 
 
820 aa  45.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.94 
 
 
688 aa  44.7  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.82 
 
 
545 aa  44.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0556  glycosy hydrolase family protein  28.69 
 
 
833 aa  44.3  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02424  beta-N-hexosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00640)  25.23 
 
 
773 aa  43.9  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0398118 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0725  chitinase  28.69 
 
 
856 aa  44.3  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.540847  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3173  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  28.69 
 
 
833 aa  43.9  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0143  putative beta-N-acetylhexosaminidase  28.69 
 
 
833 aa  43.9  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1445  putative beta-N-acetylhexosaminidase  28.69 
 
 
833 aa  43.9  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0540  glycosy hydrolase family protein  28.69 
 
 
833 aa  43.9  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152646  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2873  putative beta-N-acetylhexosaminidase  28.69 
 
 
833 aa  43.9  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.98 
 
 
852 aa  43.9  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.84 
 
 
553 aa  43.9  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>