69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0686 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0686  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 673 aa  1346    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0317867 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2590  glycoside hydrolase family protein  26.58 
 
 		 956 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3052  glycoside hydrolase family protein  31.2 
 
 		 348 aa  103  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0607  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  25.61 
 
 		 699 aa  86.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0569988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0071  N-acetyl-beta-hexosaminidase  22.86 
 
 		 711 aa  80.1  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3616  glycoside hydrolase family protein  22.97 
 
 		 619 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.748752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0519  glycoside hydrolase family protein  23.16 
 
 		 619 aa  78.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0488  glycoside hydrolase family protein  23.68 
 
 		 626 aa  77.8  0.0000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1238  glycosy hydrolase family protein  21.29 
 
 		 610 aa  70.9  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.247532  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1226  glycoside hydrolase family protein  20.14 
 
 		 641 aa  70.1  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.459632  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1051  glycosy hydrolase family protein  21.29 
 
 		 610 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0315037  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3112  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  21.26 
 
 		 843 aa  67  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0607  glycoside hydrolase family protein  21.11 
 
 		 606 aa  65.1  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.8 
 
 		 527 aa  62  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.48 
 
 		 673 aa  61.6  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1177  glycoside hydrolase family protein  21.81 
 
 		 599 aa  61.2  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3944  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  26.4 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.055877  normal  0.867275 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.68 
 
 		 584 aa  58.5  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32069  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  22.89 
 
 		 614 aa  58.5  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.28283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.43 
 
 		 863 aa  58.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0390  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  28.77 
 
 		 503 aa  57.8  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.584277 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.56 
 
 		 627 aa  57  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.68 
 
 		 546 aa  56.6  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.87 
 
 		 526 aa  56.2  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.4 
 
 		 605 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.59 
 
 		 688 aa  55.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.86 
 
 		 593 aa  54.7  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  27.38 
 
 		 543 aa  54.7  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3571  glycoside hydrolase family protein  24.39 
 
 		 631 aa  55.1  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.475227  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.36 
 
 		 542 aa  54.7  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  26.69 
 
 		 614 aa  54.7  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.9 
 
 		 534 aa  53.9  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.27 
 
 		 505 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.14 
 
 		 905 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1815  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.07 
 
 		 728 aa  53.5  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0101329  normal  0.0951479 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.06 
 
 		 665 aa  53.9  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.63 
 
 		 868 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  25.65 
 
 		 777 aa  51.6  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1723  hypothetical protein  27.4 
 
 		 354 aa  51.6  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0959  glycosyl hydrolase family 20 protein  23.39 
 
 		 640 aa  52  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00497875  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1924  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.71 
 
 		 664 aa  51.6  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.234624  decreased coverage  0.00104389 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  28.85 
 
 		 558 aa  50.4  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0701  glycoside hydrolase family protein  24.73 
 
 		 652 aa  50.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308289  normal  0.494324 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.9 
 
 		 673 aa  50.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3239  glycoside hydrolase family protein  25.81 
 
 		 635 aa  49.3  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.67 
 
 		 834 aa  48.9  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  23.78 
 
 		 816 aa  49.3  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.17 
 
 		 504 aa  48.5  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1103  glycosy hydrolase family protein  24.57 
 
 		 640 aa  48.5  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00087575  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.15 
 
 		 618 aa  48.1  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.75 
 
 		 547 aa  47.4  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.41 
 
 		 790 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  24.48 
 
 		 637 aa  47  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.83 
 
 		 821 aa  46.6  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  24.56 
 
 		 807 aa  46.6  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  24.89 
 
 		 639 aa  46.2  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.42 
 
 		 779 aa  46.2  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.68 
 
 		 785 aa  46.6  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.55 
 
 		 493 aa  45.8  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.53 
 
 		 683 aa  45.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01502  N-acetylglucosaminidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HGI3]  23.81 
 
 		 603 aa  45.1  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000172563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1424  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.97 
 
 		 643 aa  45.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0451  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  31.87 
 
 		 836 aa  44.7  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899024  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.67 
 
 		 528 aa  44.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.13 
 
 		 779 aa  44.3  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.34 
 
 		 811 aa  44.3  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.11 
 
 		 533 aa  44.3  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.49 
 
 		 545 aa  44.3  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  24.78 
 
 		 602 aa  43.9  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>