23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03654 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5708  Beta-N-acetylhexosaminidase  66.4 
 
 
664 aa  848    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03654  hypothetical protein  100 
 
 
661 aa  1327    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2451  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.88 
 
 
581 aa  374  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0875  putative hyaluronoglucosaminidase  29.12 
 
 
1296 aa  281  3e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.316601  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0472  hyalurononglucosaminidase  31.17 
 
 
561 aa  274  3e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.779925  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1442  putative hyaluronidase  31.19 
 
 
1001 aa  249  1e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.980629  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0052  Hyalurononglucosaminidase  33.05 
 
 
953 aa  235  2.0000000000000002e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.110511  normal  0.10576 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1487  putative hyaluronoglucosaminidase  26.72 
 
 
1172 aa  182  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0116  Hyaluronidase  26.64 
 
 
474 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0184  hyaluronidase  25.14 
 
 
1627 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0148  Hyaluronidase  30.96 
 
 
431 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3474  hyaluronidase  29.32 
 
 
355 aa  133  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1649  hyaluronidase  29.35 
 
 
355 aa  122  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0839085  normal  0.600926 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0607  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  24.43 
 
 
699 aa  62.4  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0569988  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0488  glycoside hydrolase family protein  46.03 
 
 
626 aa  58.2  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.4 
 
 
533 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.92 
 
 
609 aa  52  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.2 
 
 
618 aa  48.5  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0397  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.82 
 
 
722 aa  47.4  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.571244  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.21 
 
 
905 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.26 
 
 
542 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.48 
 
 
634 aa  45.8  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00650  N-acetyl-beta-hexosaminidase  32.74 
 
 
473 aa  44.3  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735936  normal  0.194133 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>