21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5708 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5708  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
664 aa  1355    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03654  hypothetical protein  66.4 
 
 
661 aa  838    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2451  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.94 
 
 
581 aa  379  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0875  putative hyaluronoglucosaminidase  28.6 
 
 
1296 aa  272  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.316601  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0472  hyalurononglucosaminidase  32.16 
 
 
561 aa  252  2e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.779925  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1442  putative hyaluronidase  30.09 
 
 
1001 aa  250  8e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.980629  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0052  Hyalurononglucosaminidase  31.76 
 
 
953 aa  228  4e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.110511  normal  0.10576 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0116  Hyaluronidase  30.75 
 
 
474 aa  189  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1487  putative hyaluronoglucosaminidase  26.93 
 
 
1172 aa  164  7e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0184  hyaluronidase  25.36 
 
 
1627 aa  140  7e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0148  Hyaluronidase  32.28 
 
 
431 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3474  hyaluronidase  29.32 
 
 
355 aa  127  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1649  hyaluronidase  30.32 
 
 
355 aa  111  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0839085  normal  0.600926 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0607  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  24.08 
 
 
699 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0569988  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.27 
 
 
634 aa  56.6  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.4 
 
 
533 aa  51.6  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0488  glycoside hydrolase family protein  43.48 
 
 
626 aa  48.9  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.16 
 
 
605 aa  47.4  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.9 
 
 
515 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.54 
 
 
618 aa  44.7  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.02 
 
 
760 aa  44.3  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>