28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0875 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0875  putative hyaluronoglucosaminidase  100 
 
 		 1296 aa  2596    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.316601  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1442  putative hyaluronidase  37.96 
 
 		 1001 aa  546  1e-154  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.980629  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0052  Hyalurononglucosaminidase  32.51 
 
 		 953 aa  341  5e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.110511  normal  0.10576 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2451  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.88 
 
 		 581 aa  310  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03654  hypothetical protein  29.12 
 
 		 661 aa  281  7e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5708  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.6 
 
 		 664 aa  272  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0472  hyalurononglucosaminidase  40.52 
 
 		 561 aa  261  6e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.779925  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1487  putative hyaluronoglucosaminidase  26.54 
 
 		 1172 aa  260  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0184  hyaluronidase  23.32 
 
 		 1627 aa  200  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0116  Hyaluronidase  34.77 
 
 		 474 aa  179  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0148  Hyaluronidase  33.55 
 
 		 431 aa  159  4e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3474  hyaluronidase  29.61 
 
 		 355 aa  115  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1649  hyaluronidase  28.16 
 
 		 355 aa  108  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0839085  normal  0.600926 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  25.91 
 
 		 777 aa  59.7  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.88 
 
 		 613 aa  57.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.19 
 
 		 866 aa  55.1  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0607  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  25.67 
 
 		 699 aa  52.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0569988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0488  glycoside hydrolase family protein  27.74 
 
 		 626 aa  50.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1424  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.29 
 
 		 643 aa  50.4  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3112  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  24.04 
 
 		 843 aa  50.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0285  endo-beta-N-acetylglucosaminidase  60 
 
 		 1135 aa  50.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.09 
 
 		 526 aa  47.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.4 
 
 		 609 aa  47.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.66 
 
 		 868 aa  47  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  26.19 
 
 		 816 aa  46.6  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004191  beta-hexosaminidase  25.65 
 
 		 883 aa  45.8  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.540073  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  26 
 
 		 905 aa  45.4  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.74 
 
 		 863 aa  45.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>