24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0052 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0052  Hyalurononglucosaminidase  100 
 
 
953 aa  1961    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.110511  normal  0.10576 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0875  putative hyaluronoglucosaminidase  32.51 
 
 
1296 aa  341  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.316601  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1442  putative hyaluronidase  35.68 
 
 
1001 aa  341  4e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.980629  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1487  putative hyaluronoglucosaminidase  28.94 
 
 
1172 aa  284  5.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2451  Beta-N-acetylhexosaminidase  34 
 
 
581 aa  236  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03654  hypothetical protein  33.05 
 
 
661 aa  235  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5708  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.76 
 
 
664 aa  228  5.0000000000000005e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0472  hyalurononglucosaminidase  31.93 
 
 
561 aa  222  3e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.779925  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0184  hyaluronidase  27.52 
 
 
1627 aa  214  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0116  Hyaluronidase  29.79 
 
 
474 aa  180  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0148  Hyaluronidase  33.22 
 
 
431 aa  171  6e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3474  hyaluronidase  26.84 
 
 
355 aa  100  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1649  hyaluronidase  28.57 
 
 
355 aa  100  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0839085  normal  0.600926 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1725  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  34.31 
 
 
758 aa  58.9  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1815  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.91 
 
 
728 aa  55.5  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0101329  normal  0.0951479 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1809  beta-N-acetylhexosaminidase  35.92 
 
 
883 aa  53.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0607  glycoside hydrolase family protein  29.19 
 
 
606 aa  53.5  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1226  glycoside hydrolase family protein  29.05 
 
 
641 aa  51.2  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.459632  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0607  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  26.37 
 
 
699 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0569988  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0488  glycoside hydrolase family protein  26.5 
 
 
626 aa  49.7  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0050  N,N'-diacetylchitobiase precursor (chitobiase)  26.95 
 
 
881 aa  49.7  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.7 
 
 
858 aa  48.1  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.2 
 
 
986 aa  46.6  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01265  hypothetical protein  32.63 
 
 
883 aa  44.7  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>