13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1649 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1649  hyaluronidase  100 
 
 
355 aa  729    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0839085  normal  0.600926 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3474  hyaluronidase  56.62 
 
 
355 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0116  Hyaluronidase  29.77 
 
 
474 aa  169  7e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03654  hypothetical protein  29.35 
 
 
661 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5708  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.32 
 
 
664 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1442  putative hyaluronidase  27.56 
 
 
1001 aa  116  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.980629  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0875  putative hyaluronoglucosaminidase  28.57 
 
 
1296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.316601  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0052  Hyalurononglucosaminidase  28.04 
 
 
953 aa  113  6e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.110511  normal  0.10576 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2451  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.02 
 
 
581 aa  113  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0472  hyalurononglucosaminidase  25.38 
 
 
561 aa  107  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.779925  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0148  Hyaluronidase  25.8 
 
 
431 aa  94.7  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1487  putative hyaluronoglucosaminidase  27.31 
 
 
1172 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0184  hyaluronidase  24.19 
 
 
1627 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>