14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0116 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0116  Hyaluronidase  100 
 
 
474 aa  990    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0472  hyalurononglucosaminidase  34.92 
 
 
561 aa  231  2e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.779925  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2451  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.6 
 
 
581 aa  227  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1442  putative hyaluronidase  36.09 
 
 
1001 aa  189  8e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.980629  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5708  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.75 
 
 
664 aa  189  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0052  Hyalurononglucosaminidase  29.79 
 
 
953 aa  180  4e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.110511  normal  0.10576 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0875  putative hyaluronoglucosaminidase  34.77 
 
 
1296 aa  179  9e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.316601  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03654  hypothetical protein  28.47 
 
 
661 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1649  hyaluronidase  29.77 
 
 
355 aa  159  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0839085  normal  0.600926 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3474  hyaluronidase  31.33 
 
 
355 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1487  putative hyaluronoglucosaminidase  30.79 
 
 
1172 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0148  Hyaluronidase  26.82 
 
 
431 aa  143  7e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0184  hyaluronidase  27.21 
 
 
1627 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  38.24 
 
 
657 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>