100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4057 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4057  carbohydrate-binding family V/XII protein  100 
 
 		 600 aa  1221    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  34.64 
 
 		 855 aa  100  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  32.6 
 
 		 848 aa  97.4  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  27.4 
 
 		 972 aa  90.9  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.5 
 
 		 699 aa  88.6  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  36.5 
 
 		 848 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  27.92 
 
 		 861 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0636  carbohydrate-binding family V/XII protein  27.6 
 
 		 765 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393474  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  30 
 
 		 1057 aa  75.1  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  50.85 
 
 		 486 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1686  Beta-galactosidase  33.33 
 
 		 780 aa  70.1  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00233252  normal  0.321684 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.59 
 
 		 1264 aa  67.4  0.0000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  27.03 
 
 		 863 aa  67  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2925  Beta-galactosidase  36 
 
 		 799 aa  66.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  32.93 
 
 		 634 aa  65.1  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  27.95 
 
 		 1750 aa  64.3  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  28.97 
 
 		 867 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  28.24 
 
 		 869 aa  62.8  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  38.3 
 
 		 1289 aa  61.2  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  26.09 
 
 		 868 aa  60.8  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  28.77 
 
 		 868 aa  60.5  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  28.77 
 
 		 868 aa  60.5  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7366  phospholipase C, phosphocholine-specific  34.55 
 
 		 805 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  28.77 
 
 		 868 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  28.08 
 
 		 868 aa  58.5  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  26.44 
 
 		 868 aa  58.5  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  29.93 
 
 		 985 aa  58.2  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  30.94 
 
 		 816 aa  58.2  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  27.38 
 
 		 727 aa  58.2  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  50 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  44.64 
 
 		 763 aa  56.2  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1885  S-layer domain protein  40 
 
 		 591 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.726885  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  45.9 
 
 		 675 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0201  chitinase like protein  29.27 
 
 		 1204 aa  55.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  29.1 
 
 		 1053 aa  55.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  33.09 
 
 		 623 aa  55.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3717  Carbohydrate-binding family V/XII  40.35 
 
 		 436 aa  55.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609198  normal  0.0379459 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0255  endochitinase  29.66 
 
 		 587 aa  54.7  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.931196 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2033  glycosyl hydrolase family chitinase  42.86 
 
 		 591 aa  54.7  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.635984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5624  Chitinase  46.15 
 
 		 421 aa  54.7  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0260  basic endochitinase  29.66 
 
 		 553 aa  54.3  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2924  PKD domain containing protein  27.92 
 
 		 521 aa  54.3  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  37.88 
 
 		 904 aa  53.9  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  40.98 
 
 		 420 aa  53.9  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  37.35 
 
 		 699 aa  53.9  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.07 
 
 		 709 aa  53.5  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0255  endochitinase  29.66 
 
 		 587 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.942643 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0274  endochitinase  29.66 
 
 		 587 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0271  endochitinase  29.66 
 
 		 587 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.527688  normal  0.775272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  31 
 
 		 687 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1101  chitinase  27.15 
 
 		 565 aa  52  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0431  Carbohydrate-binding family V/XII  40.68 
 
 		 353 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  39.62 
 
 		 855 aa  51.6  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  35.58 
 
 		 833 aa  51.6  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  29.24 
 
 		 563 aa  51.2  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02195  chitinase  32.28 
 
 		 182 aa  50.8  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  35.48 
 
 		 729 aa  50.8  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  35.48 
 
 		 729 aa  50.8  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  28.86 
 
 		 704 aa  50.8  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7461  Ig family protein  48.08 
 
 		 672 aa  50.4  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.65 
 
 		 1212 aa  50.8  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1415  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.43 
 
 		 698 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  45.28 
 
 		 772 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3141  protease domain-containing protein  28.16 
 
 		 1393 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  27.61 
 
 		 1471 aa  50.4  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  48.28 
 
 		 626 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5348  peptidase M36 fungalysin  35.56 
 
 		 950 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2125  protein of unknown function DUF1593  30.95 
 
 		 477 aa  48.9  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  35.56 
 
 		 3197 aa  48.9  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  29.24 
 
 		 1054 aa  48.5  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5452  Chitinase  35.71 
 
 		 296 aa  48.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0310454  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1301  glycosyl hydrolase family 31 protein  34.44 
 
 		 1965 aa  48.1  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.449133  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0879  fibronectin type III domain-containing protein  40 
 
 		 751 aa  47.8  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  35.14 
 
 		 393 aa  47.8  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1442  putative hyaluronidase  36.05 
 
 		 1001 aa  47.8  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.980629  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  27.82 
 
 		 1011 aa  47.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  33.06 
 
 		 1258 aa  47.4  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  56.25 
 
 		 481 aa  47.4  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  41.07 
 
 		 651 aa  47.4  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2390  Carbohydrate-binding family V/XII  30.59 
 
 		 523 aa  47.4  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.254143  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2735  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  58.06 
 
 		 669 aa  46.6  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.637714 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2953  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  32.67 
 
 		 1004 aa  47  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.5475 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0590  PE-PGRS family protein  33.33 
 
 		 665 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  50 
 
 		 540 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003394  putative trypsin  43.9 
 
 		 443 aa  47  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1500  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.17 
 
 		 1293 aa  46.2  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0751  cold-active alkaline serine protease  30.23 
 
 		 789 aa  45.8  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4405  chitinase  40 
 
 		 353 aa  46.2  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0797  protease domain-containing protein  26.72 
 
 		 1393 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0992  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.21 
 
 		 1056 aa  46.2  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1472  putative alpha-N-acetylgalactosaminidase  30.23 
 
 		 1588 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2205  glycosyl hydrolase family chitinase  36.21 
 
 		 492 aa  46.2  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  43.75 
 
 		 402 aa  45.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5623  Lysozyme  40.38 
 
 		 426 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.700904  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1329  Chitinase  40.43 
 
 		 295 aa  45.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  30.61 
 
 		 1051 aa  45.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  29.59 
 
 		 3278 aa  44.7  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  38.3 
 
 		 1242 aa  43.9  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  53.12 
 
 		 451 aa  43.9  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  44.74 
 
 		 586 aa  43.5  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>