45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0815 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0815  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 		 1127 aa  2319    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1190  glycoside hydrolase family protein  36.52 
 
 		 807 aa  506  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.112997  normal  0.725074 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1083  glycoside hydrolase family protein  36.35 
 
 		 807 aa  501  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148049 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4999  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  34.23 
 
 		 834 aa  492  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.517089  normal  0.335211 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0280  glycosy hydrolase family protein  36.48 
 
 		 740 aa  456  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0285  endo-beta-N-acetylglucosaminidase  36.2 
 
 		 1135 aa  452  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0197  endo-beta-N-acetylglucosaminidase D  34.44 
 
 		 927 aa  390  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1016  glycoside hydrolase family protein  35.4 
 
 		 880 aa  372  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1714  glycoside hydrolase family protein  31.24 
 
 		 951 aa  327  6e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0126  glycoside hydrolase family protein  28.3 
 
 		 586 aa  240  9e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0534718  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0300  glycoside hydrolase family protein  29.17 
 
 		 592 aa  235  4.0000000000000004e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0685  fibronectin type III domain-containing protein  63.86 
 
 		 1686 aa  119  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0687  fibronectin type III domain-containing protein  55.1 
 
 		 159 aa  116  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  55.45 
 
 		 1173 aa  112  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1248  fibronectin type III domain-containing protein  56.63 
 
 		 205 aa  110  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1442  putative hyaluronidase  56.63 
 
 		 1001 aa  110  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.980629  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1301  glycosyl hydrolase family 31 protein  56.63 
 
 		 1965 aa  108  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.449133  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1472  putative alpha-N-acetylgalactosaminidase  56.63 
 
 		 1588 aa  107  9e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0859  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  38.03 
 
 		 2095 aa  107  9e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  57.83 
 
 		 1471 aa  107  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0850  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  37.32 
 
 		 2095 aa  105  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.871673  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1713  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  43.66 
 
 		 454 aa  97.1  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  35.92 
 
 		 899 aa  86.3  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  32.51 
 
 		 1164 aa  85.9  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2888  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.19 
 
 		 356 aa  67.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.057915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0487  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.91 
 
 		 455 aa  59.7  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.3 
 
 		 986 aa  56.2  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  31.76 
 
 		 598 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0755  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  30.2 
 
 		 344 aa  53.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00219053  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  32 
 
 		 464 aa  51.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  33.33 
 
 		 1221 aa  51.2  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  34.18 
 
 		 2334 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  33.33 
 
 		 1050 aa  50.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  30.67 
 
 		 465 aa  49.7  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  25.53 
 
 		 1581 aa  49.7  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  35.56 
 
 		 503 aa  49.3  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  27.27 
 
 		 1154 aa  48.5  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2342  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.57 
 
 		 350 aa  48.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.69185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4691  Fibronectin type III domain protein  33.78 
 
 		 544 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354116  normal  0.211382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.12 
 
 		 809 aa  47  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2392  Fibronectin type III domain protein  29.2 
 
 		 831 aa  46.6  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  30.97 
 
 		 651 aa  45.8  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  34.94 
 
 		 762 aa  45.4  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  32.29 
 
 		 803 aa  45.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  28.43 
 
 		 1439 aa  45.1  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>