176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0400 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  100 
 
 		 598 aa  1232    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  69.8 
 
 		 803 aa  749    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  56.92 
 
 		 483 aa  500  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  55.68 
 
 		 483 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  53.7 
 
 		 484 aa  493  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3568  glycosyl hydrolase family chitinase  61.97 
 
 		 353 aa  445  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0611  glycosy hydrolase family protein  48.24 
 
 		 471 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0693  glycoside hydrolase family protein  48.83 
 
 		 471 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2205  glycosyl hydrolase family chitinase  47.2 
 
 		 492 aa  391  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  52.01 
 
 		 727 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  51.44 
 
 		 699 aa  350  3e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  49.59 
 
 		 565 aa  345  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  49.72 
 
 		 729 aa  340  5.9999999999999996e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  49.72 
 
 		 729 aa  340  5.9999999999999996e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl347  chitinase  33.03 
 
 		 1113 aa  157  6e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  28.39 
 
 		 1362 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3571  extracellular exochitinase Chi36  27.6 
 
 		 360 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.297633  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3854  extracellular exochitinase Chi36  27.6 
 
 		 360 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.063231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3469  chitinase  27.67 
 
 		 360 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  31.58 
 
 		 464 aa  116  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3753  extracellular exochitinase Chi36  28.69 
 
 		 360 aa  115  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.007807  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3483  chitinase  27.4 
 
 		 360 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.219436  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3824  extracellular exochitinase Chi36  28.69 
 
 		 360 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3490  glycoside hydrolase family protein  28.96 
 
 		 360 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.678093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3775  extracellular exochitinase Chi36  28.42 
 
 		 360 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  31.45 
 
 		 465 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  27.32 
 
 		 551 aa  110  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1478  extracellular exochitinase Chi36  28.42 
 
 		 360 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17366  hitchhiker  0.000283046 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  27.61 
 
 		 846 aa  107  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  39.36 
 
 		 6885 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  28.1 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  33.33 
 
 		 445 aa  105  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1704  glycosyl hydrolase family chitinase  27.14 
 
 		 543 aa  103  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.861913 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1220  Carbohydrate-binding CenC domain protein  28.41 
 
 		 510 aa  103  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  26.4 
 
 		 648 aa  99.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  31.38 
 
 		 459 aa  99.4  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  26.04 
 
 		 846 aa  99.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  24 
 
 		 1578 aa  97.8  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  31.15 
 
 		 455 aa  97.8  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  30.74 
 
 		 455 aa  96.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  27.95 
 
 		 846 aa  95.9  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  30.45 
 
 		 455 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  30.33 
 
 		 455 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  34.72 
 
 		 762 aa  95.1  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  26.67 
 
 		 848 aa  94.7  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  28.8 
 
 		 456 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  29.92 
 
 		 455 aa  93.6  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  29.92 
 
 		 455 aa  93.6  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  29.64 
 
 		 458 aa  93.6  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  29.51 
 
 		 455 aa  93.2  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  28 
 
 		 456 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  29.07 
 
 		 458 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  28.8 
 
 		 455 aa  92.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  32.96 
 
 		 973 aa  90.5  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  29.1 
 
 		 455 aa  89  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  29.92 
 
 		 455 aa  88.2  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  26.13 
 
 		 680 aa  87.8  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  33.85 
 
 		 2170 aa  87.8  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  29.51 
 
 		 455 aa  87.4  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0735  glycoside hydrolase family 18  27.65 
 
 		 341 aa  87.4  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  26.39 
 
 		 468 aa  86.7  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3776  putative oxidoreductase, FAD-binding  34.75 
 
 		 685 aa  85.5  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3866  berberine/berberine domain-containing protein  34.75 
 
 		 685 aa  85.5  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0676  putative oxidoreductase, FAD-binding  34.75 
 
 		 685 aa  85.5  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  30.39 
 
 		 743 aa  84.7  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  24.93 
 
 		 613 aa  83.6  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4053  glycoside hydrolase family 18  24.47 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7432  Chitinase-like protein  26.13 
 
 		 516 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1458  glycosyl hydrolase family chitinase  27.34 
 
 		 460 aa  79.3  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4225  Carbohydrate-binding CenC domain protein  25.63 
 
 		 551 aa  77  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  36.16 
 
 		 1050 aa  76.3  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  33.33 
 
 		 854 aa  72.8  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  31.35 
 
 		 1160 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  33.87 
 
 		 1221 aa  71.6  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.14 
 
 		 809 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  26.84 
 
 		 467 aa  68.9  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  30.89 
 
 		 1887 aa  68.2  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  33.33 
 
 		 749 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  28.42 
 
 		 680 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.94 
 
 		 729 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5622  fibronectin type III domain-containing protein  31.58 
 
 		 660 aa  65.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  30.48 
 
 		 1004 aa  64.7  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3735  extracellular exochitinase Chi36  28.8 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.72466e-18 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  28.9 
 
 		 539 aa  63.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5472  fibronectin type III domain-containing protein  31.75 
 
 		 787 aa  63.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000573168  decreased coverage  0.000436266 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  33.71 
 
 		 1462 aa  62  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  40.51 
 
 		 1121 aa  60.1  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  43.01 
 
 		 655 aa  60.1  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  42.39 
 
 		 900 aa  59.3  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  37.35 
 
 		 1137 aa  59.3  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  30.6 
 
 		 836 aa  59.3  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  42.47 
 
 		 608 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  33.5 
 
 		 3802 aa  58.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 		 1230 aa  58.2  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  37.97 
 
 		 1209 aa  58.2  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  38.78 
 
 		 614 aa  57.8  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  29.89 
 
 		 1628 aa  57.8  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  30.85 
 
 		 768 aa  55.8  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  33.75 
 
 		 1017 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  31.11 
 
 		 1735 aa  55.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>