194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0676 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0676  putative oxidoreductase, FAD-binding  100 
 
 
685 aa  1419    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3866  berberine/berberine domain-containing protein  99.71 
 
 
685 aa  1417    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3776  putative oxidoreductase, FAD-binding  99.71 
 
 
685 aa  1417    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3218  oxidoreductase, FAD-binding, putative  54.68 
 
 
554 aa  551  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2895  oxidoreductase, FAD-binding, putative  53.89 
 
 
553 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0685436  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3473  putative oxidoreductase, FAD-binding  54.07 
 
 
553 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1646  putative oxidoreductase, FAD-binding  54.07 
 
 
553 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3077  putative oxidoreductase, FAD-binding  54.07 
 
 
553 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3978  FAD/FMN-containing dehydrogenases  54.07 
 
 
550 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0113  hexose oxidase  54.07 
 
 
553 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.258284  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3897  FAD/FMN-containing dehydrogenases  54.07 
 
 
553 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3700  Berberine/berberine domain protein  42.2 
 
 
508 aa  345  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0050  hypothetical protein  42.39 
 
 
508 aa  343  5e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3377  Berberine/berberine domain protein  42.2 
 
 
508 aa  342  1e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4665  Berberine/berberine domain protein  35.24 
 
 
529 aa  240  5.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.293743  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4988  Berberine/berberine domain protein  34.96 
 
 
529 aa  239  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332344  hitchhiker  0.00488458 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0997  Berberine/berberine domain-containing protein  31.36 
 
 
539 aa  160  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367258  normal  0.977331 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  44.91 
 
 
464 aa  137  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  43.79 
 
 
465 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  25 
 
 
444 aa  100  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  25.93 
 
 
444 aa  100  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.47 
 
 
466 aa  99  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  39.58 
 
 
484 aa  94.4  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  27.06 
 
 
532 aa  93.6  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.83 
 
 
461 aa  89  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0479  hypothetical protein  28.33 
 
 
328 aa  87.4  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0479005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  39.26 
 
 
455 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  39.26 
 
 
455 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10388  glucooligosaccharide oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14340)  25.67 
 
 
471 aa  85.5  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451589  normal  0.284571 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  34.75 
 
 
598 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  37.5 
 
 
483 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  38.52 
 
 
456 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.14 
 
 
449 aa  84  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  37.04 
 
 
456 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  38.52 
 
 
455 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  38.52 
 
 
455 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  36.88 
 
 
803 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  22.61 
 
 
448 aa  81.3  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  37.78 
 
 
455 aa  80.9  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  37.78 
 
 
455 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  36.11 
 
 
483 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5622  fibronectin type III domain-containing protein  34.59 
 
 
660 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  21.83 
 
 
461 aa  79  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  36.3 
 
 
455 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  33.6 
 
 
749 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  36.3 
 
 
455 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  37.88 
 
 
458 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.73 
 
 
451 aa  77.8  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  23.39 
 
 
487 aa  77.8  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  38.24 
 
 
459 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  37.04 
 
 
455 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  37.04 
 
 
455 aa  77  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5472  fibronectin type III domain-containing protein  34.4 
 
 
787 aa  77  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000573168  decreased coverage  0.000436266 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  24.47 
 
 
470 aa  76.6  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  37.8 
 
 
458 aa  77  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  38.69 
 
 
455 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  23.26 
 
 
468 aa  73.9  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  20.22 
 
 
473 aa  73.2  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  21.88 
 
 
463 aa  72.4  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  21.71 
 
 
461 aa  71.2  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  34.59 
 
 
445 aa  70.5  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.21 
 
 
474 aa  69.7  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.07 
 
 
464 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1236  fibronectin, type III  33.87 
 
 
235 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1510  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.6 
 
 
614 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0318  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  28.84 
 
 
491 aa  67  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000970405  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2842  FAD linked oxidase domain protein  27.6 
 
 
864 aa  67  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0215386 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1503  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.15 
 
 
864 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  24.76 
 
 
465 aa  65.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  39.37 
 
 
667 aa  66.6  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0611  glycosy hydrolase family protein  30.22 
 
 
471 aa  66.6  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1539  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.15 
 
 
864 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416598  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  26.8 
 
 
478 aa  64.3  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7289  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.48 
 
 
542 aa  64.7  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0772845  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  36.44 
 
 
762 aa  63.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.37 
 
 
472 aa  63.9  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  39.08 
 
 
2334 aa  61.6  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  26.34 
 
 
458 aa  61.6  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  27.27 
 
 
463 aa  61.2  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  43.33 
 
 
854 aa  61.2  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  21.24 
 
 
462 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  28.77 
 
 
446 aa  60.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  22.43 
 
 
465 aa  60.1  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  29.63 
 
 
448 aa  60.5  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.24 
 
 
6885 aa  60.1  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.06 
 
 
461 aa  60.1  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  32.19 
 
 
614 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.83 
 
 
490 aa  59.3  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2758  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.19 
 
 
896 aa  59.3  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1411  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.89 
 
 
891 aa  58.9  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  24.49 
 
 
459 aa  58.5  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  28 
 
 
484 aa  58.5  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.11 
 
 
492 aa  58.2  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  35 
 
 
637 aa  58.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.48 
 
 
444 aa  57.8  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0693  glycoside hydrolase family protein  31.65 
 
 
471 aa  57.8  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0639  FAD linked oxidase domain protein  27.52 
 
 
454 aa  58.2  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2650  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.05 
 
 
896 aa  57.4  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  24.55 
 
 
448 aa  57.4  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  34.96 
 
 
459 aa  57.4  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>