More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1775 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  100 
 
 		 463 aa  942    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.96 
 
 		 461 aa  396  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  44.08 
 
 		 461 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  43.08 
 
 		 479 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  41.27 
 
 		 461 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.2 
 
 		 464 aa  368  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  48.53 
 
 		 461 aa  364  2e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.81 
 
 		 472 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  42.64 
 
 		 479 aa  362  8e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  44.18 
 
 		 462 aa  362  9e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.74 
 
 		 479 aa  360  3e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  42.89 
 
 		 479 aa  359  6e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  42.64 
 
 		 462 aa  354  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  41.89 
 
 		 474 aa  352  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  41.58 
 
 		 463 aa  349  7e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  45.01 
 
 		 469 aa  345  1e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  41.32 
 
 		 473 aa  345  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  42.48 
 
 		 459 aa  341  1e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  44.01 
 
 		 602 aa  339  7e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  44.91 
 
 		 465 aa  335  7e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  41.28 
 
 		 468 aa  333  4e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  43.29 
 
 		 477 aa  331  2e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.12 
 
 		 461 aa  329  6e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  42.54 
 
 		 465 aa  324  2e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  42.22 
 
 		 458 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  39.39 
 
 		 473 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  40.62 
 
 		 465 aa  315  9.999999999999999e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  43.18 
 
 		 465 aa  313  4.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  40.97 
 
 		 476 aa  311  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  42.76 
 
 		 466 aa  304  2.0000000000000002e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  41.48 
 
 		 461 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  38.07 
 
 		 499 aa  301  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  40.4 
 
 		 456 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  40.53 
 
 		 470 aa  299  6e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  41.26 
 
 		 456 aa  297  3e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  42.31 
 
 		 456 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.82 
 
 		 465 aa  288  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  38.86 
 
 		 478 aa  286  5.999999999999999e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  37.58 
 
 		 473 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.58 
 
 		 444 aa  282  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.61 
 
 		 478 aa  275  9e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  37.42 
 
 		 477 aa  272  1e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  37.42 
 
 		 460 aa  267  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  37.77 
 
 		 465 aa  264  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  37.77 
 
 		 469 aa  261  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11743  oxidoreductase  39.96 
 
 		 461 aa  258  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0117669  normal  0.752588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.82 
 
 		 448 aa  257  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  37.31 
 
 		 466 aa  256  5e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  31.53 
 
 		 448 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.86 
 
 		 466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.46 
 
 		 481 aa  217  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  31.22 
 
 		 444 aa  209  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.35 
 
 		 472 aa  207  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  30.87 
 
 		 444 aa  205  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3943  FAD linked oxidase domain protein  33.65 
 
 		 448 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4344  FAD linked oxidase domain protein  36.3 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.577793 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  32.96 
 
 		 446 aa  192  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.79 
 
 		 490 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.27 
 
 		 449 aa  188  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.79 
 
 		 492 aa  187  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  30.55 
 
 		 462 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  28.34 
 
 		 705 aa  183  6e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  32.13 
 
 		 436 aa  179  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  33.83 
 
 		 487 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2149  FAD linked oxidase domain protein  38.03 
 
 		 458 aa  177  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.26 
 
 		 484 aa  177  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  33.04 
 
 		 467 aa  176  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.25 
 
 		 490 aa  171  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2435  oxidoreductase, FAD-binding, putative  30.47 
 
 		 471 aa  171  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0684957  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  34.15 
 
 		 447 aa  170  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  30.95 
 
 		 459 aa  169  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5613  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.07 
 
 		 445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.11 
 
 		 474 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4792  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.53 
 
 		 462 aa  166  9e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  34.3 
 
 		 752 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.65 
 
 		 460 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09308  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G00730)  30.3 
 
 		 473 aa  164  4.0000000000000004e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  32.39 
 
 		 758 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0127  FAD linked oxidase domain protein  33.56 
 
 		 775 aa  160  4e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.48716 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  25.61 
 
 		 448 aa  159  7e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  32.31 
 
 		 532 aa  159  8e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  32.02 
 
 		 480 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  33.04 
 
 		 449 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  33.41 
 
 		 764 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  32.03 
 
 		 474 aa  150  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1620  FAD linked oxidase domain protein  31.57 
 
 		 465 aa  149  8e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.87 
 
 		 734 aa  149  9e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4807  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.84 
 
 		 507 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.658991  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2448  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.21 
 
 		 476 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.370857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7289  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.49 
 
 		 542 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0772845  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  25.5 
 
 		 448 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  30.74 
 
 		 753 aa  144  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.31 
 
 		 451 aa  142  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  29.89 
 
 		 596 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.2 
 
 		 462 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  31.26 
 
 		 459 aa  140  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  30.86 
 
 		 754 aa  140  7e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3628  FAD linked oxidase domain protein  30.59 
 
 		 451 aa  139  7e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05846  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14630)  29.68 
 
 		 472 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  29.8 
 
 		 462 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>