121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_3897 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2895  oxidoreductase, FAD-binding, putative  98.37 
 
 
553 aa  1113    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0685436  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0113  hexose oxidase  99.1 
 
 
553 aa  1120    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.258284  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3218  oxidoreductase, FAD-binding, putative  88.77 
 
 
554 aa  970    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3473  putative oxidoreductase, FAD-binding  98.55 
 
 
553 aa  1116    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1646  putative oxidoreductase, FAD-binding  98.55 
 
 
553 aa  1116    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3897  FAD/FMN-containing dehydrogenases  100 
 
 
553 aa  1128    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3978  FAD/FMN-containing dehydrogenases  99.27 
 
 
550 aa  1117    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3077  putative oxidoreductase, FAD-binding  98.55 
 
 
553 aa  1116    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0676  putative oxidoreductase, FAD-binding  54.25 
 
 
685 aa  555  1e-156  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3776  putative oxidoreductase, FAD-binding  54.43 
 
 
685 aa  546  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3866  berberine/berberine domain-containing protein  54.43 
 
 
685 aa  546  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3700  Berberine/berberine domain protein  43.17 
 
 
508 aa  352  7e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0050  hypothetical protein  42.86 
 
 
508 aa  347  4e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3377  Berberine/berberine domain protein  41.86 
 
 
508 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4988  Berberine/berberine domain protein  38.15 
 
 
529 aa  259  7e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332344  hitchhiker  0.00488458 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4665  Berberine/berberine domain protein  37.19 
 
 
529 aa  258  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.293743  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0997  Berberine/berberine domain-containing protein  29.44 
 
 
539 aa  167  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367258  normal  0.977331 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.39 
 
 
449 aa  97.8  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.74 
 
 
490 aa  87.4  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.95 
 
 
466 aa  87.8  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.67 
 
 
461 aa  87  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  24.57 
 
 
461 aa  87  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  28.97 
 
 
444 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  22.68 
 
 
448 aa  84  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  25 
 
 
461 aa  83.2  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  30.26 
 
 
444 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  26.17 
 
 
463 aa  78.2  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.37 
 
 
492 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  31.63 
 
 
478 aa  71.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  23.78 
 
 
479 aa  71.6  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  22.87 
 
 
448 aa  71.2  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0479  hypothetical protein  40.54 
 
 
328 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0479005  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  32.63 
 
 
479 aa  69.3  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2758  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.73 
 
 
896 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.56 
 
 
479 aa  66.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.62 
 
 
472 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  30.77 
 
 
468 aa  63.9  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1411  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.87 
 
 
891 aa  64.3  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  32.82 
 
 
499 aa  64.3  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  31.05 
 
 
448 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  30.04 
 
 
473 aa  63.5  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  30.3 
 
 
459 aa  63.5  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  29.44 
 
 
463 aa  63.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  24.47 
 
 
479 aa  63.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.88 
 
 
474 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  29.07 
 
 
458 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1694  FAD-binding protein  26.05 
 
 
894 aa  62.4  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  29.89 
 
 
487 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10388  glucooligosaccharide oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14340)  26.59 
 
 
471 aa  62  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451589  normal  0.284571 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  24.27 
 
 
456 aa  61.6  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3854  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.59 
 
 
574 aa  60.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  31.43 
 
 
462 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  30.95 
 
 
462 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1510  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.54 
 
 
614 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1503  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.89 
 
 
864 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1539  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.89 
 
 
864 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416598  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2842  FAD linked oxidase domain protein  24.54 
 
 
864 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0215386 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  31.63 
 
 
459 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2583  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.88 
 
 
896 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.15241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2650  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.88 
 
 
896 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0639  FAD linked oxidase domain protein  29.84 
 
 
454 aa  58.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07081  conserved hypothetical protein  32.76 
 
 
574 aa  57.8  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.206599 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  34.22 
 
 
764 aa  57.8  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0318  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  29.01 
 
 
491 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000970405  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.32 
 
 
451 aa  56.6  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.32 
 
 
444 aa  56.2  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11802  oxidoreductase  31.05 
 
 
446 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547261 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000469  probable oxidoreductase  24.32 
 
 
563 aa  55.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0940249  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.94 
 
 
478 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08405  FAD-dependent monooxygenase (Eurofung)  33.93 
 
 
596 aa  55.1  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  34.31 
 
 
474 aa  54.7  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.51 
 
 
490 aa  54.7  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  30.99 
 
 
466 aa  55.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02648  isoamyl alcohol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01180)  26.82 
 
 
566 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.908923 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.39 
 
 
484 aa  53.5  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  28 
 
 
461 aa  52.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  32.48 
 
 
465 aa  53.5  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0042  FAD linked oxidase domain protein  32.86 
 
 
545 aa  53.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  29.47 
 
 
532 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3156  FAD linked oxidase-like protein  23.89 
 
 
577 aa  51.2  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03399  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17690)  27.39 
 
 
461 aa  50.8  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.31125 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  35.65 
 
 
459 aa  50.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  29.41 
 
 
480 aa  50.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  31.44 
 
 
465 aa  50.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.28 
 
 
464 aa  50.8  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  32.16 
 
 
752 aa  49.7  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4792  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.15 
 
 
462 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  30.14 
 
 
469 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  32.92 
 
 
602 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.47 
 
 
462 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  24.71 
 
 
461 aa  48.9  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  27.04 
 
 
705 aa  48.5  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2543  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.32 
 
 
456 aa  48.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.84 
 
 
481 aa  48.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  28.86 
 
 
446 aa  48.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1145  FAD/FMN-containing dehydrogenase  26 
 
 
456 aa  47.8  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.45 
 
 
460 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06807  conserved hypothetical protein  23.05 
 
 
982 aa  47.4  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.522291  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  30.88 
 
 
753 aa  47  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10062  oxidoreductase  29.26 
 
 
479 aa  46.6  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.761932 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>