More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0347 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  100 
 
 
459 aa  932    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4792  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.58 
 
 
462 aa  280  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4807  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.03 
 
 
507 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.658991  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0639  FAD linked oxidase domain protein  34.85 
 
 
454 aa  228  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2543  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.54 
 
 
456 aa  219  7e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03399  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17690)  32.79 
 
 
461 aa  217  2.9999999999999998e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.31125 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3765  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.85 
 
 
495 aa  212  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378557  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2963  FAD binding domain-containing protein  34.7 
 
 
805 aa  209  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000276895 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.47 
 
 
805 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.258933  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11802  oxidoreductase  34.62 
 
 
446 aa  205  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547261 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0156  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.28 
 
 
444 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.932448  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3907  twin-arginine translocation pathway signal  29.8 
 
 
489 aa  187  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  31.96 
 
 
461 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  29.59 
 
 
479 aa  172  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  29.79 
 
 
461 aa  169  9e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  27.99 
 
 
474 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  30.24 
 
 
479 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.75 
 
 
472 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  28.88 
 
 
479 aa  163  7e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.69 
 
 
461 aa  162  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.42 
 
 
479 aa  162  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  31.02 
 
 
463 aa  159  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  30.63 
 
 
459 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  30.24 
 
 
462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  29 
 
 
464 aa  147  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.81 
 
 
461 aa  144  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  28.95 
 
 
463 aa  144  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  29.78 
 
 
499 aa  143  7e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  27.91 
 
 
473 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  37.72 
 
 
462 aa  141  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  25.82 
 
 
448 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  26.15 
 
 
705 aa  139  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  28.79 
 
 
473 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  29.64 
 
 
469 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  32.24 
 
 
456 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  30.25 
 
 
465 aa  137  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  30.43 
 
 
465 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.51 
 
 
449 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  29.83 
 
 
465 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  27.4 
 
 
468 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  25.6 
 
 
448 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  30.54 
 
 
477 aa  133  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  27.87 
 
 
473 aa  134  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  32.81 
 
 
602 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  29.03 
 
 
476 aa  132  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  27.77 
 
 
478 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.94 
 
 
444 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  29.91 
 
 
460 aa  130  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  38.75 
 
 
466 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.19 
 
 
478 aa  127  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1671  FAD linked oxidase domain protein  31.44 
 
 
435 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.012602  normal  0.541261 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  27.39 
 
 
470 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  29.45 
 
 
461 aa  121  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  24.73 
 
 
448 aa  121  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.08 
 
 
474 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  28.3 
 
 
465 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  23.31 
 
 
444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  27.77 
 
 
477 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  27.86 
 
 
456 aa  117  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0318  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  27.06 
 
 
491 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000970405  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.92 
 
 
481 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  27.45 
 
 
461 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.89 
 
 
466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  30.25 
 
 
456 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  22.44 
 
 
444 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5613  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.42 
 
 
445 aa  111  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.35 
 
 
448 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  25.27 
 
 
458 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0042  FAD linked oxidase domain protein  33.17 
 
 
545 aa  109  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2435  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.1 
 
 
471 aa  107  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0684957  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.88 
 
 
465 aa  106  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  35.06 
 
 
446 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  27.9 
 
 
465 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  28.42 
 
 
466 aa  103  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.29 
 
 
484 aa  103  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  34.94 
 
 
449 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.15 
 
 
469 aa  100  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.82 
 
 
492 aa  100  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 
490 aa  99.8  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3628  FAD linked oxidase domain protein  31.96 
 
 
451 aa  98.6  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11743  oxidoreductase  27.14 
 
 
461 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0117669  normal  0.752588 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2758  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.22 
 
 
896 aa  98.2  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1411  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.96 
 
 
891 aa  97.4  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3943  FAD linked oxidase domain protein  29.76 
 
 
448 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1694  FAD-binding protein  28.65 
 
 
894 aa  97.1  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2583  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.21 
 
 
896 aa  96.7  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.15241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2650  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.67 
 
 
896 aa  96.7  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.19 
 
 
462 aa  96.7  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  28.38 
 
 
532 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  38.82 
 
 
752 aa  95.5  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000469  probable oxidoreductase  26.74 
 
 
563 aa  94.7  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0940249  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2907  FAD linked oxidase domain protein  30.94 
 
 
470 aa  93.2  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.777851  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.45 
 
 
462 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.22 
 
 
460 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  30.45 
 
 
462 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  31.73 
 
 
436 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.1 
 
 
462 aa  90.9  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1620  FAD linked oxidase domain protein  35.61 
 
 
465 aa  90.5  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  29.81 
 
 
447 aa  90.5  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09308  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G00730)  25.92 
 
 
473 aa  89.7  9e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.898615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>