More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3377 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  100 
 
 
473 aa  966    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  49.25 
 
 
479 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  48.3 
 
 
479 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  49.78 
 
 
461 aa  444  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.62 
 
 
461 aa  435  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.27 
 
 
479 aa  432  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  48.91 
 
 
461 aa  434  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.6 
 
 
464 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  46.6 
 
 
479 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.7 
 
 
472 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.13 
 
 
461 aa  419  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  49.34 
 
 
476 aa  414  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  47.98 
 
 
469 aa  414  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  43.62 
 
 
474 aa  409  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  46.09 
 
 
463 aa  403  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  46.26 
 
 
477 aa  402  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  46.61 
 
 
465 aa  402  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  46.46 
 
 
465 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.33 
 
 
465 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  46.48 
 
 
477 aa  388  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  44.1 
 
 
470 aa  385  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  44.7 
 
 
465 aa  381  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  45.27 
 
 
465 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  42.42 
 
 
459 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  43.34 
 
 
478 aa  378  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  44.01 
 
 
462 aa  375  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  41.09 
 
 
473 aa  373  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  44.23 
 
 
462 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  42.61 
 
 
602 aa  365  1e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  41.19 
 
 
473 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  44.57 
 
 
461 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.55 
 
 
478 aa  355  7.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  41.23 
 
 
468 aa  348  9e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  41.92 
 
 
456 aa  342  7e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11743  oxidoreductase  42.02 
 
 
461 aa  331  2e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0117669  normal  0.752588 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  40.67 
 
 
499 aa  330  2e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.96 
 
 
444 aa  329  6e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  40.7 
 
 
461 aa  326  6e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  41.32 
 
 
463 aa  325  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  40.79 
 
 
460 aa  318  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  41.43 
 
 
456 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  37.44 
 
 
458 aa  316  6e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  40.36 
 
 
456 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  40.3 
 
 
466 aa  290  3e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  42.14 
 
 
466 aa  290  3e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  34.44 
 
 
465 aa  256  5e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.2 
 
 
448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.92 
 
 
469 aa  227  5.0000000000000005e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.55 
 
 
472 aa  224  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  34.93 
 
 
467 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  30.09 
 
 
448 aa  203  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  31.84 
 
 
462 aa  202  9e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.21 
 
 
481 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  32.45 
 
 
449 aa  189  7e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.87 
 
 
462 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.26 
 
 
460 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4344  FAD linked oxidase domain protein  34.15 
 
 
450 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.577793 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.48 
 
 
462 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  32.48 
 
 
462 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  30.58 
 
 
436 aa  180  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 
462 aa  178  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09308  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G00730)  31.68 
 
 
473 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  32.54 
 
 
446 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  32.25 
 
 
596 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  29.44 
 
 
459 aa  169  9e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2149  FAD linked oxidase domain protein  34.21 
 
 
458 aa  169  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2435  oxidoreductase, FAD-binding, putative  29.96 
 
 
471 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0684957  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.38 
 
 
466 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3943  FAD linked oxidase domain protein  30.24 
 
 
448 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  29.56 
 
 
474 aa  157  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  25.99 
 
 
705 aa  157  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.63 
 
 
734 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.76 
 
 
484 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2404  FAD linked oxidase domain protein  32.56 
 
 
495 aa  154  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  hitchhiker  0.00629594 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  27.07 
 
 
444 aa  153  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.49 
 
 
449 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2907  FAD linked oxidase domain protein  29.87 
 
 
470 aa  152  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.777851  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.89 
 
 
492 aa  150  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  26.42 
 
 
444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  32.61 
 
 
447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.93 
 
 
490 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.25 
 
 
726 aa  147  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  31.13 
 
 
752 aa  146  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7186  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.83 
 
 
473 aa  146  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.89 
 
 
490 aa  145  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  24.67 
 
 
448 aa  145  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0394  FAD linked oxidase domain protein  31.36 
 
 
441 aa  144  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05846  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14630)  28.91 
 
 
472 aa  143  5e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  30.72 
 
 
753 aa  143  6e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1620  FAD linked oxidase domain protein  29.58 
 
 
465 aa  143  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7882  FAD/FMN-containing dehydrogenase  32.73 
 
 
436 aa  143  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4792  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.57 
 
 
462 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  32.01 
 
 
764 aa  142  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  30.31 
 
 
532 aa  141  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1621  FAD linked oxidase domain protein  30.24 
 
 
468 aa  140  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  32.54 
 
 
758 aa  139  7.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  24.46 
 
 
448 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0127  FAD linked oxidase domain protein  28.85 
 
 
775 aa  137  4e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.48716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1824  FAD linked oxidase domain protein  30.73 
 
 
439 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.58 
 
 
474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>