More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1621 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1621  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
468 aa  917    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.89 
 
 
460 aa  396  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.21 
 
 
462 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.32 
 
 
462 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  47.32 
 
 
462 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7186  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.12 
 
 
473 aa  357  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.66 
 
 
462 aa  352  7e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2915  FAD linked oxidase domain protein  44.94 
 
 
455 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000548663  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  38.26 
 
 
596 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  39.78 
 
 
459 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  34.81 
 
 
462 aa  244  3e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3564  FAD linked oxidase domain protein  40.86 
 
 
460 aa  239  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.293473  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.02 
 
 
484 aa  231  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  38.98 
 
 
474 aa  220  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2907  FAD linked oxidase domain protein  36.24 
 
 
470 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.777851  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  37.56 
 
 
467 aa  213  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  34.99 
 
 
436 aa  209  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6967  oxidoreductase, FAD-dependent  37.35 
 
 
460 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.581883 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1620  FAD linked oxidase domain protein  38.38 
 
 
465 aa  199  6e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7882  FAD/FMN-containing dehydrogenase  36.4 
 
 
436 aa  196  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2688  FAD linked oxidase domain protein  35.91 
 
 
452 aa  187  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.70388  normal  0.409872 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0394  FAD linked oxidase domain protein  37.95 
 
 
441 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  27.89 
 
 
461 aa  174  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1824  FAD linked oxidase domain protein  35.79 
 
 
439 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  29.49 
 
 
478 aa  168  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  33.41 
 
 
449 aa  166  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  29.25 
 
 
479 aa  162  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.73 
 
 
478 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  28.02 
 
 
479 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  30.24 
 
 
473 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.67 
 
 
461 aa  160  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  29.89 
 
 
468 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  26.58 
 
 
461 aa  158  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  28.7 
 
 
465 aa  158  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  27.77 
 
 
474 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  28.76 
 
 
479 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  29.53 
 
 
499 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  31.71 
 
 
465 aa  154  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  28.98 
 
 
463 aa  152  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.11 
 
 
479 aa  148  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  34.27 
 
 
446 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  29.32 
 
 
465 aa  148  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  30.31 
 
 
476 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  28.67 
 
 
459 aa  147  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.51 
 
 
472 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  30.5 
 
 
456 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  31.04 
 
 
460 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  30.72 
 
 
477 aa  143  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  33.49 
 
 
754 aa  141  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  29.05 
 
 
469 aa  141  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  28.09 
 
 
465 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.34 
 
 
444 aa  139  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  26.81 
 
 
458 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  30 
 
 
461 aa  138  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.54 
 
 
461 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.26 
 
 
469 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  29.12 
 
 
473 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1990  FAD linked oxidase domain protein  34.06 
 
 
424 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.29 
 
 
464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  26.3 
 
 
602 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  28.06 
 
 
477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  26.93 
 
 
461 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  29.21 
 
 
752 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.3 
 
 
448 aa  124  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.28 
 
 
465 aa  124  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.96 
 
 
474 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  28.73 
 
 
466 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  29.89 
 
 
466 aa  121  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  25.06 
 
 
448 aa  121  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  25.78 
 
 
470 aa  121  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  31.45 
 
 
447 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  38.42 
 
 
463 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4344  FAD linked oxidase domain protein  29.32 
 
 
450 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.577793 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.89 
 
 
466 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.69 
 
 
472 aa  117  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  28.01 
 
 
465 aa  117  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  27.51 
 
 
753 aa  117  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.08 
 
 
481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.59 
 
 
734 aa  114  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  25.45 
 
 
473 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  29.76 
 
 
758 aa  113  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.88 
 
 
726 aa  111  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2207  FAD linked oxidase domain protein  31.93 
 
 
456 aa  110  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0127  FAD linked oxidase domain protein  27.06 
 
 
775 aa  110  7.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.48716 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  26.45 
 
 
456 aa  109  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2149  FAD linked oxidase domain protein  33.04 
 
 
458 aa  109  9.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  26.91 
 
 
462 aa  107  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  25.56 
 
 
456 aa  106  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  30.46 
 
 
764 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.57 
 
 
451 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  31.84 
 
 
705 aa  103  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  23.56 
 
 
444 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  24 
 
 
444 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.04 
 
 
449 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  22.22 
 
 
448 aa  100  8e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3245  FAD linked oxidase domain protein  35.86 
 
 
324 aa  99  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00827345  hitchhiker  0.0000991055 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  31.1 
 
 
532 aa  97.1  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  24.3 
 
 
462 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  27.79 
 
 
480 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  27.58 
 
 
487 aa  91.3  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>