More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4344 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4344  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
450 aa  904    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.577793 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.59 
 
 
472 aa  437  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2149  FAD linked oxidase domain protein  46.71 
 
 
458 aa  299  7e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.2 
 
 
461 aa  297  3e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  36.56 
 
 
461 aa  296  7e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  37.64 
 
 
461 aa  293  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  39.33 
 
 
463 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  38.75 
 
 
459 aa  286  5e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.89 
 
 
479 aa  286  5.999999999999999e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.22 
 
 
464 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.82 
 
 
472 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  40.27 
 
 
462 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  36.95 
 
 
479 aa  277  4e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  37.72 
 
 
479 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  37.89 
 
 
499 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  36.48 
 
 
474 aa  273  6e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  37.78 
 
 
458 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  38.36 
 
 
462 aa  270  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  36.61 
 
 
479 aa  266  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.53 
 
 
461 aa  265  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  38.79 
 
 
469 aa  263  4e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  39.11 
 
 
456 aa  263  6e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  38.96 
 
 
468 aa  262  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  40.22 
 
 
466 aa  251  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  34.15 
 
 
473 aa  250  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.37 
 
 
444 aa  248  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  38.31 
 
 
461 aa  241  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  37.56 
 
 
460 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  35.96 
 
 
465 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  36.28 
 
 
465 aa  232  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  36.34 
 
 
456 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.84 
 
 
465 aa  229  6e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  36.63 
 
 
463 aa  229  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  35.59 
 
 
456 aa  229  9e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  35.41 
 
 
461 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  37.33 
 
 
476 aa  227  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  36.55 
 
 
465 aa  225  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  35.92 
 
 
465 aa  222  8e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  33.41 
 
 
478 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  33.7 
 
 
473 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  34.74 
 
 
596 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  34.58 
 
 
477 aa  219  6e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  36.78 
 
 
469 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  32.3 
 
 
470 aa  209  7e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  33.92 
 
 
477 aa  209  9e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  32.74 
 
 
602 aa  207  4e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  30.58 
 
 
473 aa  206  8e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  32.45 
 
 
462 aa  201  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  34.22 
 
 
465 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.21 
 
 
460 aa  193  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  35.16 
 
 
466 aa  192  9e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11743  oxidoreductase  35.53 
 
 
461 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0117669  normal  0.752588 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  34.89 
 
 
446 aa  191  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.52 
 
 
478 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  37.05 
 
 
764 aa  186  9e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  34.44 
 
 
459 aa  184  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.59 
 
 
462 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  31.59 
 
 
462 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  33.85 
 
 
758 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  35.78 
 
 
752 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  34.72 
 
 
753 aa  181  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.89 
 
 
448 aa  180  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  34.85 
 
 
734 aa  180  5.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.91 
 
 
726 aa  179  8e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.29 
 
 
462 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  35.87 
 
 
754 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  33.56 
 
 
449 aa  172  9e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  35.21 
 
 
447 aa  169  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  31.69 
 
 
467 aa  166  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.1 
 
 
462 aa  164  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  31.51 
 
 
474 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.82 
 
 
484 aa  163  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2907  FAD linked oxidase domain protein  33.48 
 
 
470 aa  160  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.777851  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  29.74 
 
 
436 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7186  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.42 
 
 
473 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  25.92 
 
 
448 aa  153  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.94 
 
 
466 aa  150  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2688  FAD linked oxidase domain protein  33.9 
 
 
452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.70388  normal  0.409872 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0127  FAD linked oxidase domain protein  32.36 
 
 
775 aa  147  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.48716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.09 
 
 
474 aa  146  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5613  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.04 
 
 
445 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1620  FAD linked oxidase domain protein  31.19 
 
 
465 aa  144  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1824  FAD linked oxidase domain protein  28.73 
 
 
439 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  31.18 
 
 
480 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  31.86 
 
 
487 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1621  FAD linked oxidase domain protein  29.32 
 
 
468 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  25.33 
 
 
444 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.29 
 
 
490 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.1 
 
 
492 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  25.55 
 
 
444 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2404  FAD linked oxidase domain protein  32.56 
 
 
495 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  hitchhiker  0.00629594 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.92 
 
 
449 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.42 
 
 
490 aa  126  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.021743 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09308  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G00730)  28.35 
 
 
473 aa  123  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7882  FAD/FMN-containing dehydrogenase  29.67 
 
 
436 aa  123  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  24.83 
 
 
705 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.65 
 
 
805 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.258933  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3628  FAD linked oxidase domain protein  31.01 
 
 
451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.49 
 
 
451 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2448  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.56 
 
 
476 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.370857  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>