More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2448 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2448  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
476 aa  937    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.370857  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.1 
 
 
474 aa  355  1e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.19 
 
 
451 aa  229  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  36.64 
 
 
480 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  35.52 
 
 
532 aa  203  6e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  33.99 
 
 
487 aa  186  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2404  FAD linked oxidase domain protein  34.38 
 
 
495 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  hitchhiker  0.00629594 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7289  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.4 
 
 
542 aa  171  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0772845  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.85 
 
 
461 aa  171  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0518  histidine kinase  29.69 
 
 
501 aa  168  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  29.31 
 
 
448 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  29.89 
 
 
461 aa  163  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.39 
 
 
449 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3628  FAD linked oxidase domain protein  33.12 
 
 
451 aa  159  9e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  34.49 
 
 
465 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.43 
 
 
464 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  29.36 
 
 
474 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  29.64 
 
 
463 aa  154  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  29.38 
 
 
479 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  30.61 
 
 
479 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  29.27 
 
 
444 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  29.89 
 
 
479 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.14 
 
 
466 aa  151  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  28.82 
 
 
444 aa  150  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  28.45 
 
 
458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  28.12 
 
 
461 aa  148  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.76 
 
 
472 aa  146  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  25.29 
 
 
448 aa  144  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  25.81 
 
 
705 aa  143  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  31.91 
 
 
463 aa  143  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.72 
 
 
461 aa  142  9e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  30.28 
 
 
465 aa  141  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  29.25 
 
 
473 aa  138  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.24 
 
 
479 aa  137  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  31.49 
 
 
461 aa  136  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  32.69 
 
 
456 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  32.74 
 
 
764 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.04 
 
 
492 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  31.45 
 
 
468 aa  133  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  25.52 
 
 
448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  29.74 
 
 
459 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.57 
 
 
444 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4048  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.13 
 
 
476 aa  131  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225855  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  30.67 
 
 
754 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  31.22 
 
 
478 aa  130  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  30.15 
 
 
477 aa  130  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  29.15 
 
 
499 aa  129  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  28.51 
 
 
476 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  28.94 
 
 
456 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.39 
 
 
490 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.39 
 
 
490 aa  127  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  26.98 
 
 
462 aa  126  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  31.71 
 
 
758 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  29.34 
 
 
465 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.04 
 
 
726 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  29.3 
 
 
477 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10388  glucooligosaccharide oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14340)  27.23 
 
 
471 aa  124  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451589  normal  0.284571 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  27.29 
 
 
462 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.79 
 
 
469 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  27.23 
 
 
473 aa  121  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000469  probable oxidoreductase  24.95 
 
 
563 aa  121  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0940249  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.39 
 
 
734 aa  120  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  29.57 
 
 
461 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  30.37 
 
 
465 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5613  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.45 
 
 
445 aa  118  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  31.53 
 
 
446 aa  118  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10062  oxidoreductase  29.98 
 
 
479 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.761932 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  29.74 
 
 
469 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  28.21 
 
 
470 aa  116  6.9999999999999995e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  29.55 
 
 
753 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  27.37 
 
 
602 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  27.75 
 
 
456 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.08 
 
 
481 aa  114  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2149  FAD linked oxidase domain protein  31.98 
 
 
458 aa  113  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.62 
 
 
478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0042  FAD linked oxidase domain protein  29.47 
 
 
545 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  28.39 
 
 
460 aa  109  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3943  FAD linked oxidase domain protein  27.01 
 
 
448 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2435  oxidoreductase, FAD-binding, putative  27.33 
 
 
471 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0684957  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  28.95 
 
 
752 aa  108  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  26.12 
 
 
473 aa  107  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.93 
 
 
465 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1510  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.38 
 
 
614 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0639  FAD linked oxidase domain protein  40.37 
 
 
454 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2842  FAD linked oxidase domain protein  34.38 
 
 
864 aa  104  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0215386 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1503  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.38 
 
 
864 aa  104  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1539  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.38 
 
 
864 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416598  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.77 
 
 
472 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0479  hypothetical protein  28.87 
 
 
328 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0479005  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3854  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.99 
 
 
574 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  29.81 
 
 
474 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  30.94 
 
 
466 aa  101  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.42 
 
 
448 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09308  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G00730)  28.72 
 
 
473 aa  99.4  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4344  FAD linked oxidase domain protein  30.28 
 
 
450 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.577793 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3156  FAD linked oxidase-like protein  29.82 
 
 
577 aa  99.8  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11743  oxidoreductase  30.35 
 
 
461 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0117669  normal  0.752588 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.39 
 
 
460 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  29.2 
 
 
447 aa  97.8  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  32.98 
 
 
436 aa  96.7  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>