More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1824 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1824  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
439 aa  863    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  53.56 
 
 
436 aa  430  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7882  FAD/FMN-containing dehydrogenase  50.23 
 
 
436 aa  342  8e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0394  FAD linked oxidase domain protein  48.84 
 
 
441 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  37.33 
 
 
467 aa  206  8e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  35.9 
 
 
596 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7186  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.94 
 
 
473 aa  194  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  35.01 
 
 
449 aa  186  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.21 
 
 
460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.48 
 
 
484 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  31.09 
 
 
462 aa  173  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.2 
 
 
462 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  34.44 
 
 
474 aa  167  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2907  FAD linked oxidase domain protein  31.36 
 
 
470 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.777851  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  32.43 
 
 
462 aa  163  7e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.43 
 
 
462 aa  163  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1621  FAD linked oxidase domain protein  35.6 
 
 
468 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  29.8 
 
 
459 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 
462 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.61 
 
 
461 aa  160  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  33.49 
 
 
459 aa  157  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  39.1 
 
 
499 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  28.54 
 
 
479 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  32.35 
 
 
462 aa  153  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  37.14 
 
 
468 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.16 
 
 
444 aa  152  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  36.33 
 
 
462 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  27.35 
 
 
461 aa  151  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6967  oxidoreductase, FAD-dependent  31.44 
 
 
460 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.581883 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  33.09 
 
 
461 aa  149  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  29.52 
 
 
465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.78 
 
 
464 aa  147  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  31.38 
 
 
461 aa  146  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  29.1 
 
 
473 aa  146  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  32 
 
 
476 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.69 
 
 
472 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1620  FAD linked oxidase domain protein  34.89 
 
 
465 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  32.05 
 
 
474 aa  144  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  29.14 
 
 
463 aa  144  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  28.09 
 
 
479 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  27.63 
 
 
448 aa  142  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  27.89 
 
 
469 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  31.24 
 
 
456 aa  138  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  27.07 
 
 
479 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  28 
 
 
473 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.84 
 
 
465 aa  137  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  34.97 
 
 
466 aa  136  8e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  39.91 
 
 
463 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.35 
 
 
479 aa  133  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  37.22 
 
 
465 aa  133  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  30.3 
 
 
460 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  28.51 
 
 
478 aa  127  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3564  FAD linked oxidase domain protein  35.65 
 
 
460 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.293473  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  28.19 
 
 
477 aa  126  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  27.59 
 
 
602 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  35.9 
 
 
465 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  30.69 
 
 
473 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2915  FAD linked oxidase domain protein  35.37 
 
 
455 aa  124  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000548663  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  28.48 
 
 
465 aa  123  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4344  FAD linked oxidase domain protein  31.53 
 
 
450 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.577793 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  34.93 
 
 
461 aa  121  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  28.69 
 
 
705 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.37 
 
 
461 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  27.87 
 
 
470 aa  120  6e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  26.75 
 
 
458 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  34.02 
 
 
456 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  27.86 
 
 
466 aa  118  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  27.92 
 
 
469 aa  116  8.999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.31 
 
 
478 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.09 
 
 
448 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10930  FAD-dependent oxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00840)  30.6 
 
 
501 aa  113  6e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.304326 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  32.26 
 
 
456 aa  113  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  33.57 
 
 
477 aa  113  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2688  FAD linked oxidase domain protein  33.24 
 
 
452 aa  112  9e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.70388  normal  0.409872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.34 
 
 
472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  35.47 
 
 
446 aa  111  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.36 
 
 
466 aa  111  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.2 
 
 
474 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.9 
 
 
449 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.32 
 
 
481 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  27.61 
 
 
444 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  31.52 
 
 
487 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  26.44 
 
 
758 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
754 aa  100  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  26.12 
 
 
444 aa  100  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  26.12 
 
 
465 aa  97.1  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  22.76 
 
 
448 aa  94.4  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2207  FAD linked oxidase domain protein  29.75 
 
 
456 aa  94.7  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09308  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G00730)  29.37 
 
 
473 aa  94.4  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1510  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.84 
 
 
614 aa  94  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  27.71 
 
 
764 aa  93.2  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07081  conserved hypothetical protein  36.36 
 
 
574 aa  92.8  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.206599 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2842  FAD linked oxidase domain protein  31.84 
 
 
864 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0215386 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1503  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.28 
 
 
864 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1539  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.28 
 
 
864 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416598  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  30.49 
 
 
447 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2543  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.47 
 
 
456 aa  90.9  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4792  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.18 
 
 
462 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1411  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.56 
 
 
891 aa  90.9  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3628  FAD linked oxidase domain protein  32.35 
 
 
451 aa  89.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>