More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00332 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  100 
 
 
705 aa  1465    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  29.33 
 
 
461 aa  196  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.66 
 
 
449 aa  192  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.21 
 
 
461 aa  192  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  28.63 
 
 
476 aa  187  8e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  28.7 
 
 
479 aa  186  9e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  30.88 
 
 
470 aa  179  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  28.31 
 
 
463 aa  177  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  28.38 
 
 
469 aa  177  8e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  26.68 
 
 
479 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.27 
 
 
479 aa  176  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.67 
 
 
444 aa  176  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.31 
 
 
472 aa  174  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  27.97 
 
 
448 aa  173  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  29.89 
 
 
465 aa  172  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  26.61 
 
 
479 aa  172  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.61 
 
 
464 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  27.9 
 
 
474 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  26.7 
 
 
461 aa  168  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  28.19 
 
 
459 aa  167  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  28.34 
 
 
463 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  27.02 
 
 
448 aa  163  9e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  26.86 
 
 
477 aa  160  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.4 
 
 
461 aa  160  6e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  27.77 
 
 
456 aa  159  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  27.62 
 
 
469 aa  158  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  29.42 
 
 
468 aa  158  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  25.99 
 
 
473 aa  157  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  26.17 
 
 
473 aa  157  9e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  28.94 
 
 
477 aa  155  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  27.33 
 
 
465 aa  155  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  26.73 
 
 
499 aa  155  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  27.05 
 
 
462 aa  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  28.29 
 
 
473 aa  151  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  26.83 
 
 
462 aa  150  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  26.97 
 
 
465 aa  150  7e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  26.59 
 
 
461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  26.55 
 
 
458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.71 
 
 
474 aa  148  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  26.85 
 
 
448 aa  147  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  30.04 
 
 
461 aa  144  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  28.85 
 
 
460 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  26.23 
 
 
602 aa  141  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  28.42 
 
 
487 aa  141  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  29.16 
 
 
466 aa  140  7e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.72 
 
 
481 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  27.25 
 
 
465 aa  138  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  25.48 
 
 
478 aa  137  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.35 
 
 
466 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  25 
 
 
444 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  24.77 
 
 
444 aa  134  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  25.27 
 
 
459 aa  134  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  27.53 
 
 
466 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  27.53 
 
 
465 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  27.05 
 
 
456 aa  132  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.41 
 
 
478 aa  130  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.99 
 
 
484 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  27.49 
 
 
480 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2435  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.75 
 
 
471 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0684957  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2448  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.81 
 
 
476 aa  125  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.370857  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.4 
 
 
490 aa  125  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  26.48 
 
 
456 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1620  FAD linked oxidase domain protein  36.04 
 
 
465 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  24.68 
 
 
462 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.02 
 
 
465 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2404  FAD linked oxidase domain protein  25.99 
 
 
495 aa  119  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  hitchhiker  0.00629594 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0518  histidine kinase  27.57 
 
 
501 aa  118  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000469  probable oxidoreductase  30.35 
 
 
563 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0940249  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  24.45 
 
 
474 aa  114  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  30.84 
 
 
436 aa  114  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.04 
 
 
448 aa  114  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1824  FAD linked oxidase domain protein  28.69 
 
 
439 aa  110  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5613  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.39 
 
 
445 aa  110  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  26.44 
 
 
764 aa  110  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.53 
 
 
490 aa  109  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  23.5 
 
 
449 aa  108  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2583  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.7 
 
 
896 aa  108  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.15241 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  24.94 
 
 
758 aa  108  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2650  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.7 
 
 
896 aa  108  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  24.53 
 
 
734 aa  107  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.77 
 
 
260 aa  107  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.278227  normal  0.338656 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.47 
 
 
726 aa  107  9e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2758  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.7 
 
 
896 aa  107  9e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.22 
 
 
805 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.258933  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0009  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.45 
 
 
257 aa  106  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.247011  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.42 
 
 
492 aa  106  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0747  hypothetical protein  30.71 
 
 
253 aa  106  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4792  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.17 
 
 
462 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0765  hypothetical protein  30.71 
 
 
253 aa  105  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2963  FAD binding domain-containing protein  25.44 
 
 
805 aa  105  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000276895 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7882  FAD/FMN-containing dehydrogenase  30 
 
 
436 aa  104  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.67 
 
 
462 aa  104  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  33.67 
 
 
462 aa  104  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4807  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.57 
 
 
507 aa  103  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.658991  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.67 
 
 
462 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03399  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17690)  31.47 
 
 
461 aa  103  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.31125 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2543  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.99 
 
 
456 aa  103  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  24.72 
 
 
459 aa  101  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11743  oxidoreductase  26.61 
 
 
461 aa  101  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0117669  normal  0.752588 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09308  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G00730)  24.34 
 
 
473 aa  101  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.898615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>