More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4422 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 479 aa  982    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  74.63 
 
 		 479 aa  741    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  76.11 
 
 		 479 aa  751    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  75.57 
 
 		 479 aa  769    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  58.7 
 
 		 461 aa  579  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  63.76 
 
 		 472 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.42 
 
 		 464 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  57.17 
 
 		 461 aa  567  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.33 
 
 		 461 aa  558  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  54.03 
 
 		 474 aa  548  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  56.07 
 
 		 463 aa  535  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.36 
 
 		 461 aa  529  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  59.04 
 
 		 465 aa  516  1.0000000000000001e-145  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  57.77 
 
 		 462 aa  511  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  56.67 
 
 		 462 aa  510  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  52.74 
 
 		 473 aa  497  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  52.3 
 
 		 465 aa  466  9.999999999999999e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  50 
 
 		 469 aa  435  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  46.27 
 
 		 473 aa  432  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  48.68 
 
 		 465 aa  411  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  46.8 
 
 		 459 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  44.06 
 
 		 602 aa  384  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  45.51 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  44.25 
 
 		 477 aa  367  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  43.67 
 
 		 470 aa  367  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  40.95 
 
 		 478 aa  362  8e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  43.61 
 
 		 476 aa  360  3e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  44.44 
 
 		 461 aa  359  6e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.79 
 
 		 465 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  41.81 
 
 		 499 aa  357  3.9999999999999996e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  45.47 
 
 		 460 aa  352  7e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  42.41 
 
 		 477 aa  350  4e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  43.58 
 
 		 468 aa  347  3e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.03 
 
 		 478 aa  344  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  43.43 
 
 		 456 aa  343  4e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  39.62 
 
 		 473 aa  342  5.999999999999999e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  43.74 
 
 		 463 aa  342  8e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  43.97 
 
 		 465 aa  339  5e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  43.14 
 
 		 461 aa  339  7e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  44.18 
 
 		 456 aa  333  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.33 
 
 		 444 aa  332  1e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  44.97 
 
 		 466 aa  331  2e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11743  oxidoreductase  43.5 
 
 		 461 aa  331  2e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0117669  normal  0.752588 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  44.84 
 
 		 456 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  39.05 
 
 		 466 aa  280  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  36.19 
 
 		 465 aa  274  3e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  38.78 
 
 		 469 aa  272  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  40 
 
 		 448 aa  251  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.92 
 
 		 472 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  33.55 
 
 		 462 aa  220  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.53 
 
 		 492 aa  216  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4344  FAD linked oxidase domain protein  38.41 
 
 		 450 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.577793 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2435  oxidoreductase, FAD-binding, putative  33.26 
 
 		 471 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0684957  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.48 
 
 		 490 aa  207  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3943  FAD linked oxidase domain protein  31.99 
 
 		 448 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  30.06 
 
 		 448 aa  203  7e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2149  FAD linked oxidase domain protein  35.06 
 
 		 458 aa  200  3.9999999999999996e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.36 
 
 		 466 aa  194  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.22 
 
 		 484 aa  187  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.93 
 
 		 481 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  31.75 
 
 		 467 aa  185  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  33.26 
 
 		 449 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  27.92 
 
 		 444 aa  179  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.42 
 
 		 449 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09308  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G00730)  32.89 
 
 		 473 aa  177  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  35.18 
 
 		 446 aa  177  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  32.56 
 
 		 487 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  27.92 
 
 		 444 aa  176  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  27.27 
 
 		 705 aa  176  8e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  31.29 
 
 		 436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.39 
 
 		 462 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  33.91 
 
 		 447 aa  170  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.02 
 
 		 462 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  29.02 
 
 		 462 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5613  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.22 
 
 		 445 aa  169  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  32.25 
 
 		 752 aa  168  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.21 
 
 		 460 aa  166  9e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  31.42 
 
 		 596 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  31.1 
 
 		 753 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2404  FAD linked oxidase domain protein  33.99 
 
 		 495 aa  163  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  hitchhiker  0.00629594 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.7 
 
 		 726 aa  159  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  29.42 
 
 		 459 aa  159  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  25.85 
 
 		 448 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  29.5 
 
 		 474 aa  157  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.52 
 
 		 734 aa  153  8e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3628  FAD linked oxidase domain protein  32.68 
 
 		 451 aa  153  8e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.33 
 
 		 462 aa  149  9e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  32.18 
 
 		 480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0127  FAD linked oxidase domain protein  27.46 
 
 		 775 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.48716 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  30.42 
 
 		 459 aa  149  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  25.64 
 
 		 448 aa  147  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.94 
 
 		 474 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05846  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14630)  30.24 
 
 		 472 aa  142  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  30.52 
 
 		 764 aa  142  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.66 
 
 		 451 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  30.07 
 
 		 758 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.87 
 
 		 490 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4792  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.66 
 
 		 462 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4807  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.79 
 
 		 507 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.658991  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0042  FAD linked oxidase domain protein  29.75 
 
 		 545 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>