More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001560 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  100 
 
 		 461 aa  956    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  74.78 
 
 		 461 aa  720    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  63.26 
 
 		 461 aa  638    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  62.83 
 
 		 461 aa  634  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.13 
 
 		 464 aa  597  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  58.52 
 
 		 474 aa  591  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  59.74 
 
 		 479 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  59.51 
 
 		 479 aa  578  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  58.64 
 
 		 479 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  57.27 
 
 		 463 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.17 
 
 		 479 aa  567  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.11 
 
 		 472 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  57.39 
 
 		 462 aa  524  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  55.31 
 
 		 462 aa  518  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  55.36 
 
 		 465 aa  504  1e-141  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  49.34 
 
 		 473 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  49.45 
 
 		 465 aa  442  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  48.91 
 
 		 473 aa  434  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  44.54 
 
 		 459 aa  403  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  43.23 
 
 		 469 aa  390  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  43.6 
 
 		 477 aa  380  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  43.38 
 
 		 470 aa  376  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  42.95 
 
 		 602 aa  371  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  43.88 
 
 		 456 aa  369  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  42.33 
 
 		 465 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  40.61 
 
 		 458 aa  359  7e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  40.34 
 
 		 473 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  40.31 
 
 		 499 aa  356  3.9999999999999996e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.78 
 
 		 465 aa  352  1e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  39.31 
 
 		 478 aa  350  2e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  41.81 
 
 		 477 aa  348  2e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  39.78 
 
 		 468 aa  346  6e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  43.79 
 
 		 461 aa  345  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  41.48 
 
 		 461 aa  344  2e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  41.41 
 
 		 460 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  40.31 
 
 		 476 aa  342  8e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  41.27 
 
 		 463 aa  342  8e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.21 
 
 		 478 aa  337  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  42.2 
 
 		 465 aa  335  1e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.14 
 
 		 444 aa  325  1e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  42.41 
 
 		 456 aa  325  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  38.94 
 
 		 466 aa  311  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  41.16 
 
 		 456 aa  309  5e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11743  oxidoreductase  40.09 
 
 		 461 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0117669  normal  0.752588 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  41.21 
 
 		 466 aa  301  1e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  35.42 
 
 		 465 aa  274  3e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  36.46 
 
 		 469 aa  274  3e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.11 
 
 		 448 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.12 
 
 		 472 aa  231  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4344  FAD linked oxidase domain protein  36.56 
 
 		 450 aa  223  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.577793 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  33.62 
 
 		 462 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2149  FAD linked oxidase domain protein  35.06 
 
 		 458 aa  218  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  30.82 
 
 		 448 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  34 
 
 		 449 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.71 
 
 		 492 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.27 
 
 		 490 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3943  FAD linked oxidase domain protein  31.06 
 
 		 448 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  31.43 
 
 		 467 aa  194  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  33.62 
 
 		 446 aa  193  7e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.46 
 
 		 466 aa  193  7e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2435  oxidoreductase, FAD-binding, putative  30.26 
 
 		 471 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0684957  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  29.78 
 
 		 436 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  30 
 
 		 460 aa  190  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  32.08 
 
 		 752 aa  188  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  31.73 
 
 		 764 aa  182  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.01 
 
 		 484 aa  182  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  29.53 
 
 		 474 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.52 
 
 		 726 aa  179  5.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  28.41 
 
 		 444 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  31.78 
 
 		 487 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  28.41 
 
 		 444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.39 
 
 		 481 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  34.71 
 
 		 447 aa  173  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4792  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.48 
 
 		 462 aa  172  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  29.83 
 
 		 753 aa  172  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  27.69 
 
 		 448 aa  170  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.87 
 
 		 734 aa  170  6e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  26.7 
 
 		 705 aa  168  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.82 
 
 		 462 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.23 
 
 		 474 aa  167  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.04 
 
 		 462 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  29.04 
 
 		 462 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09308  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G00730)  31.51 
 
 		 473 aa  166  5.9999999999999996e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.75 
 
 		 449 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  29.34 
 
 		 459 aa  162  9e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.59 
 
 		 490 aa  162  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.09 
 
 		 462 aa  162  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1620  FAD linked oxidase domain protein  28.22 
 
 		 465 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  29.3 
 
 		 758 aa  157  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  27.03 
 
 		 448 aa  156  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  29.14 
 
 		 754 aa  155  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05846  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14630)  28.9 
 
 		 472 aa  153  7e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7882  FAD/FMN-containing dehydrogenase  29.87 
 
 		 436 aa  153  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4807  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.66 
 
 		 507 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.658991  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3907  twin-arginine translocation pathway signal  28.13 
 
 		 489 aa  151  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  28.1 
 
 		 596 aa  150  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  28.54 
 
 		 459 aa  149  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7186  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.7 
 
 		 473 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  29.96 
 
 		 532 aa  147  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  28.57 
 
 		 480 aa  146  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>