More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3907 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3907  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 489 aa  1020    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3765  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.6 
 
 		 495 aa  219  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4807  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.94 
 
 		 507 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.658991  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  29.8 
 
 		 459 aa  206  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4792  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.89 
 
 		 462 aa  196  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.11 
 
 		 805 aa  190  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.258933  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2963  FAD binding domain-containing protein  29.81 
 
 		 805 aa  189  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000276895 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  28.13 
 
 		 461 aa  168  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11802  oxidoreductase  29.61 
 
 		 446 aa  164  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547261 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2543  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.02 
 
 		 456 aa  159  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0639  FAD linked oxidase domain protein  36.5 
 
 		 454 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03399  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17690)  26.28 
 
 		 461 aa  151  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.31125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0156  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.98 
 
 		 444 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.932448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  24.3 
 
 		 461 aa  143  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  25.35 
 
 		 473 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  26.38 
 
 		 474 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.03 
 
 		 461 aa  139  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.54 
 
 		 461 aa  139  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  24.36 
 
 		 479 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  24.58 
 
 		 479 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.26 
 
 		 472 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.6 
 
 		 464 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  24.65 
 
 		 479 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  32.86 
 
 		 462 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.86 
 
 		 444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.1 
 
 		 479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  23.64 
 
 		 463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  24.77 
 
 		 465 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  32.98 
 
 		 462 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  25.32 
 
 		 473 aa  120  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  22.32 
 
 		 461 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  23.71 
 
 		 463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  30.26 
 
 		 478 aa  115  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.67 
 
 		 474 aa  113  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.38 
 
 		 449 aa  113  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  28.09 
 
 		 448 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  30.58 
 
 		 470 aa  109  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  22.76 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  31.05 
 
 		 469 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  25.49 
 
 		 602 aa  106  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  30.14 
 
 		 458 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  25.94 
 
 		 465 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  34.3 
 
 		 499 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  29.65 
 
 		 473 aa  103  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  25.93 
 
 		 448 aa  103  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  33.83 
 
 		 466 aa  102  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  31.31 
 
 		 477 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1671  FAD linked oxidase domain protein  26.55 
 
 		 435 aa  101  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.012602  normal  0.541261 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  28.02 
 
 		 705 aa  101  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000469  probable oxidoreductase  32.76 
 
 		 563 aa  100  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0940249  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  29.09 
 
 		 465 aa  100  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1510  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.25 
 
 		 614 aa  100  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1694  FAD-binding protein  25.51 
 
 		 894 aa  100  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2842  FAD linked oxidase domain protein  31.25 
 
 		 864 aa  100  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0215386 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.86 
 
 		 466 aa  99.8  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.83 
 
 		 448 aa  99.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1539  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.68 
 
 		 864 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1503  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.68 
 
 		 864 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.44 
 
 		 481 aa  98.6  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2583  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.75 
 
 		 896 aa  97.8  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.15241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.16 
 
 		 478 aa  97.4  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  28.36 
 
 		 444 aa  97.1  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10062  oxidoreductase  25.57 
 
 		 479 aa  97.1  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761932 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2650  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.55 
 
 		 896 aa  97.1  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  31.91 
 
 		 456 aa  96.7  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.85 
 
 		 490 aa  96.7  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2758  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.75 
 
 		 896 aa  96.7  9e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  28.06 
 
 		 477 aa  95.5  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  28.06 
 
 		 462 aa  95.5  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  22.7 
 
 		 487 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  24.62 
 
 		 460 aa  94.7  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  28.36 
 
 		 444 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.7 
 
 		 492 aa  94.4  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.08 
 
 		 469 aa  93.6  7e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3854  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.1 
 
 		 574 aa  93.6  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  25.93 
 
 		 448 aa  93.2  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  20.75 
 
 		 465 aa  90.5  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  27.58 
 
 		 456 aa  90.1  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  24.79 
 
 		 468 aa  89.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  28.9 
 
 		 465 aa  89  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02387  conserved hypothetical protein  24.05 
 
 		 502 aa  88.6  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.870175 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.86 
 
 		 490 aa  88.6  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.96 
 
 		 465 aa  88.6  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1411  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.65 
 
 		 891 aa  88.6  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  27.4 
 
 		 446 aa  87.4  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  22.92 
 
 		 476 aa  87.4  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1620  FAD linked oxidase domain protein  32.98 
 
 		 465 aa  87.4  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2448  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.32 
 
 		 476 aa  86.7  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.370857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7882  FAD/FMN-containing dehydrogenase  33.77 
 
 		 436 aa  86.7  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0318  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  27.94 
 
 		 491 aa  86.7  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000970405  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  27.14 
 
 		 436 aa  86.7  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01787  conserved hypothetical protein  26.5 
 
 		 479 aa  84.3  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.433483  normal  0.55935 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  29.52 
 
 		 764 aa  84.3  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  24.47 
 
 		 456 aa  84  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3628  FAD linked oxidase domain protein  27.48 
 
 		 451 aa  83.6  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3156  FAD linked oxidase-like protein  27.01 
 
 		 577 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.22 
 
 		 460 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.94 
 
 		 451 aa  82.4  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  29.58 
 
 		 532 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  29.32 
 
 		 752 aa  81.6  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>