289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2614 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2963  FAD binding domain-containing protein  99.5 
 
 		 805 aa  1656    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000276895 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 805 aa  1664    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.258933  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4807  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.17 
 
 		 507 aa  276  9e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.658991  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3765  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.87 
 
 		 495 aa  259  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  34.47 
 
 		 459 aa  215  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4792  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.53 
 
 		 462 aa  211  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2543  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.88 
 
 		 456 aa  203  8e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0639  FAD linked oxidase domain protein  31.44 
 
 		 454 aa  192  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3907  twin-arginine translocation pathway signal  30.11 
 
 		 489 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11802  oxidoreductase  31.91 
 
 		 446 aa  177  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547261 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03399  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17690)  28.13 
 
 		 461 aa  169  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.31125 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.96 
 
 		 461 aa  162  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  29.09 
 
 		 462 aa  159  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  27.29 
 
 		 461 aa  154  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2313  protein of unknown function DUF482  29.39 
 
 		 340 aa  153  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0391405 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  28.45 
 
 		 474 aa  152  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  26.54 
 
 		 461 aa  148  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0156  FAD linked oxidase domain-containing protein  32 
 
 		 444 aa  147  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.932448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.57 
 
 		 472 aa  147  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  28.51 
 
 		 477 aa  146  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  26.48 
 
 		 478 aa  145  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.41 
 
 		 464 aa  146  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.95 
 
 		 479 aa  145  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  29.61 
 
 		 465 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.19 
 
 		 461 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  27.13 
 
 		 462 aa  139  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  27.25 
 
 		 479 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  27 
 
 		 479 aa  137  9e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  27.19 
 
 		 479 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.66 
 
 		 478 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  28.6 
 
 		 465 aa  133  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  26.29 
 
 		 463 aa  134  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  25.85 
 
 		 470 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  26.86 
 
 		 477 aa  130  9.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  27.13 
 
 		 463 aa  125  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  25.66 
 
 		 473 aa  125  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  28.27 
 
 		 602 aa  124  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  28.07 
 
 		 473 aa  124  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  27.98 
 
 		 499 aa  124  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  26.91 
 
 		 459 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  25.22 
 
 		 705 aa  123  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  28.85 
 
 		 465 aa  122  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  37.15 
 
 		 469 aa  121  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  24.45 
 
 		 473 aa  120  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  26.88 
 
 		 476 aa  120  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  29.18 
 
 		 461 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  24.48 
 
 		 468 aa  118  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  25.71 
 
 		 448 aa  118  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1671  FAD linked oxidase domain protein  29.98 
 
 		 435 aa  117  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.012602  normal  0.541261 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  26.92 
 
 		 458 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  27.25 
 
 		 469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.97 
 
 		 449 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.49 
 
 		 465 aa  114  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  23.43 
 
 		 448 aa  110  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.6 
 
 		 490 aa  110  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.57 
 
 		 444 aa  108  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  28.5 
 
 		 753 aa  107  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.28 
 
 		 481 aa  107  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  27.47 
 
 		 466 aa  106  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.2 
 
 		 492 aa  105  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  23.52 
 
 		 448 aa  104  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2583  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.73 
 
 		 896 aa  104  8e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.15241 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.21 
 
 		 466 aa  103  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  27.31 
 
 		 466 aa  103  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1694  FAD-binding protein  31.4 
 
 		 894 aa  103  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  38.89 
 
 		 459 aa  103  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.11 
 
 		 472 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  23.56 
 
 		 456 aa  102  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1411  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.14 
 
 		 891 aa  102  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.43 
 
 		 448 aa  101  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  25.99 
 
 		 460 aa  102  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2650  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.23 
 
 		 896 aa  101  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.71 
 
 		 474 aa  101  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2758  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.4 
 
 		 896 aa  100  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.16 
 
 		 460 aa  94.7  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.52 
 
 		 462 aa  94.4  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  33.52 
 
 		 462 aa  94.4  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  23.39 
 
 		 444 aa  94  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02387  conserved hypothetical protein  27.19 
 
 		 502 aa  94  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.870175 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.52 
 
 		 462 aa  94  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4344  FAD linked oxidase domain protein  27.56 
 
 		 450 aa  92.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.577793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  39.13 
 
 		 596 aa  92  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  26.22 
 
 		 487 aa  92  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2842  FAD linked oxidase domain protein  29.65 
 
 		 864 aa  90.9  9e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0215386 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1510  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.65 
 
 		 614 aa  90.5  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.58 
 
 		 462 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1503  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.65 
 
 		 864 aa  90.1  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1539  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.65 
 
 		 864 aa  90.5  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  22.43 
 
 		 444 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  29.64 
 
 		 446 aa  89.7  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  25.53 
 
 		 461 aa  89.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6967  oxidoreductase, FAD-dependent  35.39 
 
 		 460 aa  88.6  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.581883 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2907  FAD linked oxidase domain protein  35.39 
 
 		 470 aa  88.2  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.777851  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  26.85 
 
 		 449 aa  87.8  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  25.52 
 
 		 456 aa  87.4  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  25.12 
 
 		 465 aa  86.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  34.1 
 
 		 465 aa  85.5  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  24.88 
 
 		 764 aa  85.1  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  30.67 
 
 		 462 aa  84.7  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7882  FAD/FMN-containing dehydrogenase  32.34 
 
 		 436 aa  84.3  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>