More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0404 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  97.32 
 
 
448 aa  873    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  100 
 
 
448 aa  905    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.55 
 
 
449 aa  474  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  33.48 
 
 
444 aa  249  9e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  31.69 
 
 
448 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  32.58 
 
 
444 aa  243  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.96 
 
 
466 aa  244  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.11 
 
 
492 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  30 
 
 
490 aa  209  8e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5613  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.59 
 
 
445 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.25 
 
 
461 aa  187  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  29.18 
 
 
461 aa  187  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  27.52 
 
 
473 aa  176  9e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  29.07 
 
 
458 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  27.67 
 
 
479 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2404  FAD linked oxidase domain protein  28.3 
 
 
495 aa  173  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  hitchhiker  0.00629594 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  27.69 
 
 
461 aa  170  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.83 
 
 
474 aa  169  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  25.54 
 
 
487 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  27.53 
 
 
479 aa  166  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  26.34 
 
 
477 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  27.02 
 
 
705 aa  163  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  27.55 
 
 
465 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.27 
 
 
472 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0518  histidine kinase  27.97 
 
 
501 aa  161  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  27.59 
 
 
456 aa  160  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.85 
 
 
479 aa  159  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  27.09 
 
 
478 aa  158  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  25.77 
 
 
470 aa  155  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  26.09 
 
 
477 aa  155  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  26.37 
 
 
474 aa  154  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3628  FAD linked oxidase domain protein  26.18 
 
 
451 aa  152  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  26.05 
 
 
463 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0479  hypothetical protein  29.18 
 
 
328 aa  149  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0479005  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  26.73 
 
 
602 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  25.39 
 
 
463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  25 
 
 
464 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  24.67 
 
 
473 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.11 
 
 
490 aa  144  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0042  FAD linked oxidase domain protein  24.03 
 
 
545 aa  143  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  24.39 
 
 
462 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.38 
 
 
465 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.93 
 
 
478 aa  139  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  27.05 
 
 
469 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  26.96 
 
 
465 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  24.46 
 
 
462 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  27.35 
 
 
476 aa  137  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.15 
 
 
444 aa  137  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  23.18 
 
 
468 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  25.82 
 
 
459 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  29.09 
 
 
456 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4048  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.32 
 
 
476 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225855  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  26.05 
 
 
473 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  35.57 
 
 
479 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  26.58 
 
 
460 aa  130  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  36.13 
 
 
459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  25.05 
 
 
469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  23.64 
 
 
532 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.17 
 
 
448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2448  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.29 
 
 
476 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.370857  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  23.5 
 
 
461 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  24.35 
 
 
466 aa  124  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10062  oxidoreductase  26.52 
 
 
479 aa  124  5e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.761932 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7289  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.36 
 
 
542 aa  123  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0772845  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.7 
 
 
451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  23.72 
 
 
449 aa  120  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3943  FAD linked oxidase domain protein  24.1 
 
 
448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.41 
 
 
481 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1411  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.86 
 
 
891 aa  116  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  32.66 
 
 
499 aa  116  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02648  isoamyl alcohol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01180)  26.81 
 
 
566 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.908923 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  32.99 
 
 
465 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  24.73 
 
 
466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  27.07 
 
 
461 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.94 
 
 
461 aa  114  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2842  FAD linked oxidase domain protein  31.16 
 
 
864 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0215386 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.28 
 
 
472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1510  FAD linked oxidase domain-containing protein  31 
 
 
614 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2650  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.05 
 
 
896 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2583  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.05 
 
 
896 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.15241 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2543  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.76 
 
 
456 aa  111  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3854  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.66 
 
 
574 aa  111  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1539  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.69 
 
 
864 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416598  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1503  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.69 
 
 
864 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1694  FAD-binding protein  30.54 
 
 
894 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2758  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.06 
 
 
896 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000469  probable oxidoreductase  24.22 
 
 
563 aa  107  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0940249  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4792  FAD linked oxidase domain-containing protein  32 
 
 
462 aa  106  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.944989 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03399  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17690)  23 
 
 
461 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.31125 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  32.37 
 
 
465 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.65 
 
 
462 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  22.65 
 
 
446 aa  103  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  23.73 
 
 
480 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0480  hypothetical protein  43.12 
 
 
112 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0485727  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4807  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.51 
 
 
507 aa  100  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.658991  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.42 
 
 
462 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  22.42 
 
 
462 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  20.72 
 
 
460 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0639  FAD linked oxidase domain protein  29.19 
 
 
454 aa  99.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  24.11 
 
 
465 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>