More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2398 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 461 aa  917    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  45.8 
 
 		 479 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  45.63 
 
 		 461 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  45.13 
 
 		 479 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  43.91 
 
 		 479 aa  399  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.91 
 
 		 472 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.44 
 
 		 479 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  45.15 
 
 		 459 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.54 
 
 		 461 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  44.57 
 
 		 473 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  41.48 
 
 		 461 aa  378  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  47.25 
 
 		 469 aa  375  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  46.75 
 
 		 602 aa  374  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  44.35 
 
 		 462 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  48.53 
 
 		 463 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  43.36 
 
 		 463 aa  372  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  43.91 
 
 		 462 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.36 
 
 		 464 aa  364  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  48.12 
 
 		 465 aa  363  2e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.92 
 
 		 461 aa  359  7e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  49.02 
 
 		 465 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  40.53 
 
 		 474 aa  351  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  43.51 
 
 		 477 aa  350  2e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  43.96 
 
 		 460 aa  348  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  43.32 
 
 		 465 aa  347  3e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  44.08 
 
 		 456 aa  346  4e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  44.37 
 
 		 465 aa  346  6e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  41.74 
 
 		 458 aa  340  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.25 
 
 		 465 aa  332  6e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  39.65 
 
 		 473 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  43.83 
 
 		 477 aa  325  1e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  44.32 
 
 		 466 aa  323  3e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  41.16 
 
 		 470 aa  324  3e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  40.71 
 
 		 473 aa  323  3e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  41.09 
 
 		 461 aa  323  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  42.57 
 
 		 468 aa  322  9.999999999999999e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  39.38 
 
 		 499 aa  319  6e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.89 
 
 		 444 aa  318  2e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  39.22 
 
 		 478 aa  317  3e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  41.52 
 
 		 476 aa  315  1.9999999999999998e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.39 
 
 		 478 aa  301  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.79 
 
 		 448 aa  296  4e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  41.44 
 
 		 456 aa  295  9e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  40.4 
 
 		 456 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  41.67 
 
 		 466 aa  276  6e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11743  oxidoreductase  39.57 
 
 		 461 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0117669  normal  0.752588 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  38.33 
 
 		 469 aa  268  1e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  38 
 
 		 465 aa  260  3e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.86 
 
 		 472 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2149  FAD linked oxidase domain protein  41.32 
 
 		 458 aa  229  7e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  29.25 
 
 		 448 aa  224  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.37 
 
 		 466 aa  223  8e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.71 
 
 		 490 aa  216  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4344  FAD linked oxidase domain protein  37.95 
 
 		 450 aa  213  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.577793 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.41 
 
 		 492 aa  212  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  36.92 
 
 		 446 aa  208  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  35.46 
 
 		 487 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  28.92 
 
 		 444 aa  203  5e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2435  oxidoreductase, FAD-binding, putative  31.85 
 
 		 471 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0684957  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3943  FAD linked oxidase domain protein  32.5 
 
 		 448 aa  199  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  28.7 
 
 		 444 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  35.4 
 
 		 532 aa  197  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.13 
 
 		 481 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  32.67 
 
 		 462 aa  193  7e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  35.12 
 
 		 447 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09308  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G00730)  31.42 
 
 		 473 aa  187  4e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  32.23 
 
 		 436 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  34.8 
 
 		 758 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  33.84 
 
 		 752 aa  182  8.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3628  FAD linked oxidase domain protein  35.16 
 
 		 451 aa  182  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7289  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.67 
 
 		 542 aa  180  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0772845  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  35.2 
 
 		 459 aa  179  9e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2404  FAD linked oxidase domain protein  34.17 
 
 		 495 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  hitchhiker  0.00629594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  33.76 
 
 		 480 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  33.41 
 
 		 596 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  34.06 
 
 		 753 aa  177  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.59 
 
 		 474 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  33.48 
 
 		 449 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  30.04 
 
 		 705 aa  171  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.39 
 
 		 726 aa  167  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05846  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14630)  30.53 
 
 		 472 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.94 
 
 		 490 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  32.68 
 
 		 467 aa  163  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  31.44 
 
 		 754 aa  162  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0127  FAD linked oxidase domain protein  32.17 
 
 		 775 aa  160  4e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.48716 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  31.59 
 
 		 764 aa  160  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.29 
 
 		 734 aa  159  8e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.93 
 
 		 449 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2907  FAD linked oxidase domain protein  32.4 
 
 		 470 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.777851  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  23.5 
 
 		 448 aa  150  6e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1824  FAD linked oxidase domain protein  35.09 
 
 		 439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0042  FAD linked oxidase domain protein  31.22 
 
 		 545 aa  143  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.96 
 
 		 484 aa  144  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5613  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.48 
 
 		 445 aa  143  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0479  hypothetical protein  28.83 
 
 		 328 aa  143  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0479005  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  39.08 
 
 		 474 aa  142  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7882  FAD/FMN-containing dehydrogenase  30.39 
 
 		 436 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2448  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.4 
 
 		 476 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.370857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  29.23 
 
 		 459 aa  141  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4807  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.79 
 
 		 507 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.658991  normal  0.754825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>