264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0042 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0042  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
545 aa  1097    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0518  histidine kinase  32.43 
 
 
501 aa  208  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4048  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.21 
 
 
476 aa  204  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225855  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2404  FAD linked oxidase domain protein  36.87 
 
 
495 aa  202  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  hitchhiker  0.00629594 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.19 
 
 
449 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  28.79 
 
 
444 aa  182  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  29.09 
 
 
444 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.6 
 
 
466 aa  177  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.16 
 
 
492 aa  173  6.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3628  FAD linked oxidase domain protein  32.83 
 
 
451 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  31.22 
 
 
470 aa  170  6e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  24.24 
 
 
448 aa  168  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  26.96 
 
 
448 aa  167  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.04 
 
 
490 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.75 
 
 
479 aa  165  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  24.89 
 
 
448 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  28.57 
 
 
461 aa  163  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  31.86 
 
 
465 aa  163  7e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.44 
 
 
474 aa  163  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  31 
 
 
477 aa  163  9e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  30.21 
 
 
479 aa  162  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  29.11 
 
 
479 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  33.26 
 
 
465 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  28.18 
 
 
473 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  29.02 
 
 
479 aa  156  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  29.11 
 
 
468 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.57 
 
 
461 aa  156  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.73 
 
 
464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  28.84 
 
 
473 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.74 
 
 
451 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  29.96 
 
 
532 aa  152  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  30.59 
 
 
478 aa  150  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  29.55 
 
 
474 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  31.83 
 
 
477 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  31.85 
 
 
461 aa  146  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  29.61 
 
 
462 aa  143  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  32.03 
 
 
463 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  31.08 
 
 
476 aa  141  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  29.14 
 
 
602 aa  141  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  27.12 
 
 
461 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.05 
 
 
472 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.46 
 
 
444 aa  140  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  29.02 
 
 
463 aa  140  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  28.81 
 
 
459 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  32.91 
 
 
460 aa  137  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  30.95 
 
 
456 aa  137  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  28.63 
 
 
462 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.08 
 
 
478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  30.44 
 
 
456 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  28.63 
 
 
465 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  30.14 
 
 
459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  29.39 
 
 
466 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  39.11 
 
 
487 aa  128  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.25 
 
 
469 aa  127  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  28.33 
 
 
458 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  42.13 
 
 
499 aa  125  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  31.36 
 
 
480 aa  124  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09308  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G00730)  29.94 
 
 
473 aa  123  8e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  24.41 
 
 
705 aa  123  9e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.46 
 
 
465 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0479  hypothetical protein  29.07 
 
 
328 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0479005  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.15 
 
 
461 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7289  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.09 
 
 
542 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0772845  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2448  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.68 
 
 
476 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.370857  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  29.3 
 
 
469 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  32.48 
 
 
446 aa  113  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.73 
 
 
481 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  30.08 
 
 
461 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  40.47 
 
 
465 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  31.33 
 
 
466 aa  110  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0639  FAD linked oxidase domain protein  37.78 
 
 
454 aa  107  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  31.82 
 
 
758 aa  107  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  29.57 
 
 
465 aa  107  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  26.87 
 
 
473 aa  106  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3943  FAD linked oxidase domain protein  25.88 
 
 
448 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.34 
 
 
726 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.37 
 
 
490 aa  103  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.33 
 
 
734 aa  103  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4792  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.38 
 
 
462 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.944989 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10388  glucooligosaccharide oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14340)  26.58 
 
 
471 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451589  normal  0.284571 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  40.87 
 
 
456 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.28 
 
 
472 aa  101  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  32.35 
 
 
764 aa  99  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10062  oxidoreductase  42.29 
 
 
479 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.761932 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2435  oxidoreductase, FAD-binding, putative  36.02 
 
 
471 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0684957  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0318  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  35.64 
 
 
491 aa  99.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000970405  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.77 
 
 
460 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2149  FAD linked oxidase domain protein  31.01 
 
 
458 aa  97.8  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.65 
 
 
462 aa  98.2  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.65 
 
 
484 aa  97.8  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  27.35 
 
 
752 aa  97.8  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5613  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.32 
 
 
445 aa  97.4  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  34.84 
 
 
467 aa  95.9  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.13941 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03399  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17690)  35.75 
 
 
461 aa  94.7  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.31125 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000469  probable oxidoreductase  29.81 
 
 
563 aa  94.4  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0940249  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11802  oxidoreductase  31.85 
 
 
446 aa  94.4  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547261 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4807  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.06 
 
 
507 aa  93.6  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.658991  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  28.25 
 
 
449 aa  93.6  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11743  oxidoreductase  27.51 
 
 
461 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0117669  normal  0.752588 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.68 
 
 
462 aa  90.5  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>