250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7289 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7289  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 542 aa  1067    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0772845  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  59.61 
 
 		 532 aa  561  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  45.05 
 
 		 487 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.5 
 
 		 474 aa  279  9e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.81 
 
 		 466 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  31.03 
 
 		 444 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  31.03 
 
 		 444 aa  236  9e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0518  histidine kinase  34.37 
 
 		 501 aa  227  5.0000000000000005e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.18 
 
 		 451 aa  225  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2404  FAD linked oxidase domain protein  36.97 
 
 		 495 aa  225  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  hitchhiker  0.00629594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  35.85 
 
 		 480 aa  221  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  29.9 
 
 		 448 aa  209  9e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2448  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.61 
 
 		 476 aa  196  7e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.370857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  34.61 
 
 		 461 aa  193  7e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  35.91 
 
 		 468 aa  192  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3628  FAD linked oxidase domain protein  35.22 
 
 		 451 aa  190  5e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.34 
 
 		 449 aa  188  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  31.16 
 
 		 461 aa  184  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  31.81 
 
 		 479 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.67 
 
 		 461 aa  180  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  31.6 
 
 		 479 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0479  hypothetical protein  32.69 
 
 		 328 aa  176  9e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0479005  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  30.75 
 
 		 479 aa  176  9e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.02 
 
 		 472 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.88 
 
 		 479 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  31 
 
 		 490 aa  173  6.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  30.48 
 
 		 459 aa  171  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  32.55 
 
 		 465 aa  171  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  30.68 
 
 		 458 aa  170  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  25.36 
 
 		 448 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.94 
 
 		 464 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  32.86 
 
 		 460 aa  168  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  30.04 
 
 		 463 aa  167  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  32.14 
 
 		 462 aa  167  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.02 
 
 		 490 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  29.22 
 
 		 461 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  30.51 
 
 		 473 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  31.76 
 
 		 469 aa  164  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  34.19 
 
 		 456 aa  164  6e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0042  FAD linked oxidase domain protein  31.8 
 
 		 545 aa  162  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  30.58 
 
 		 499 aa  162  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.64 
 
 		 444 aa  162  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  29.88 
 
 		 462 aa  160  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10062  oxidoreductase  33.06 
 
 		 479 aa  160  8e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761932 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  32.34 
 
 		 465 aa  159  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  30.66 
 
 		 473 aa  159  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.21 
 
 		 492 aa  158  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  32.29 
 
 		 478 aa  157  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  27.5 
 
 		 474 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  25.36 
 
 		 448 aa  155  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5613  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.47 
 
 		 445 aa  150  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  32.2 
 
 		 461 aa  150  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  30.4 
 
 		 456 aa  147  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.06 
 
 		 461 aa  147  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  30.84 
 
 		 465 aa  144  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.66 
 
 		 465 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  28.04 
 
 		 602 aa  140  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  32.79 
 
 		 446 aa  137  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  38.05 
 
 		 463 aa  136  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.01 
 
 		 478 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.7 
 
 		 469 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  32.41 
 
 		 465 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  31.12 
 
 		 477 aa  131  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  28.28 
 
 		 462 aa  130  8.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  29.84 
 
 		 456 aa  130  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  28.32 
 
 		 465 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  28.35 
 
 		 470 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  28.15 
 
 		 477 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10388  glucooligosaccharide oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14340)  29.09 
 
 		 471 aa  126  9e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451589  normal  0.284571 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  26.58 
 
 		 473 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  29.98 
 
 		 476 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.05 
 
 		 448 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  32.79 
 
 		 705 aa  121  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.91 
 
 		 472 aa  120  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  30.18 
 
 		 449 aa  120  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  40.09 
 
 		 466 aa  120  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3854  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.55 
 
 		 574 aa  120  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1510  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.97 
 
 		 614 aa  117  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2842  FAD linked oxidase domain protein  33.97 
 
 		 864 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0215386 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1503  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.97 
 
 		 864 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1539  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.97 
 
 		 864 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  29.34 
 
 		 758 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1411  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.29 
 
 		 891 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  29.76 
 
 		 764 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000469  probable oxidoreductase  30.1 
 
 		 563 aa  114  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0940249  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  32.93 
 
 		 447 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  28.51 
 
 		 734 aa  110  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  29.08 
 
 		 752 aa  110  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2583  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.9 
 
 		 896 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.15241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2650  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.9 
 
 		 896 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2758  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.43 
 
 		 896 aa  108  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  30.45 
 
 		 754 aa  108  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  30.62 
 
 		 436 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07081  conserved hypothetical protein  24.64 
 
 		 574 aa  107  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.206599 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3156  FAD linked oxidase-like protein  34.45 
 
 		 577 aa  106  8e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2907  FAD linked oxidase domain protein  29.01 
 
 		 470 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.777851  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  40.19 
 
 		 466 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1694  FAD-binding protein  31.43 
 
 		 894 aa  105  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1145  FAD/FMN-containing dehydrogenase  30.13 
 
 		 456 aa  105  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0318  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  28.46 
 
 		 491 aa  103  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000970405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>