279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000469 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000469  probable oxidoreductase  100 
 
 
563 aa  1183    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0940249  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1510  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.34 
 
 
614 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2842  FAD linked oxidase domain protein  45.34 
 
 
864 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0215386 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1539  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.98 
 
 
864 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416598  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1503  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.98 
 
 
864 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1411  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.41 
 
 
891 aa  425  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2583  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.8 
 
 
896 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.15241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2650  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.8 
 
 
896 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2758  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.67 
 
 
896 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1694  FAD-binding protein  41.57 
 
 
894 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3854  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.36 
 
 
574 aa  323  6e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3156  FAD linked oxidase-like protein  32.79 
 
 
577 aa  273  7e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  27.11 
 
 
448 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.53 
 
 
449 aa  128  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.15 
 
 
474 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  30.35 
 
 
705 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.17 
 
 
444 aa  113  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  36.75 
 
 
480 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  26.91 
 
 
487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  33.69 
 
 
463 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  32.28 
 
 
463 aa  107  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  31.14 
 
 
479 aa  107  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  24.22 
 
 
448 aa  107  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  30.69 
 
 
462 aa  107  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  33.33 
 
 
461 aa  106  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  28.15 
 
 
462 aa  106  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2448  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.95 
 
 
476 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.370857  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  23.63 
 
 
479 aa  104  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  34.2 
 
 
461 aa  103  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.39 
 
 
451 aa  103  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  31.14 
 
 
479 aa  103  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 
466 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.46 
 
 
461 aa  102  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.44 
 
 
464 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  31.58 
 
 
459 aa  101  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  31.63 
 
 
473 aa  101  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.53 
 
 
484 aa  100  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  29.53 
 
 
474 aa  100  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.92 
 
 
481 aa  99.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  24.63 
 
 
448 aa  99.8  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 
461 aa  98.2  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  33.16 
 
 
465 aa  98.6  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  30.34 
 
 
478 aa  98.6  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0518  histidine kinase  32.21 
 
 
501 aa  97.4  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10062  oxidoreductase  36.22 
 
 
479 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.761932 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  31.88 
 
 
465 aa  95.9  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.07 
 
 
479 aa  95.9  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  32.35 
 
 
444 aa  95.5  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  27.82 
 
 
474 aa  94.7  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  29.06 
 
 
532 aa  94.7  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  29.51 
 
 
499 aa  94  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  32.23 
 
 
446 aa  93.6  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  33.5 
 
 
458 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2404  FAD linked oxidase domain protein  34.42 
 
 
495 aa  92.8  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  hitchhiker  0.00629594 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  30.88 
 
 
444 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2543  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.16 
 
 
456 aa  92.4  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.55 
 
 
465 aa  92.8  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  26.74 
 
 
459 aa  92.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.64 
 
 
472 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  31.22 
 
 
459 aa  91.7  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  30.16 
 
 
468 aa  91.3  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33 
 
 
469 aa  91.3  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3943  FAD linked oxidase domain protein  28.99 
 
 
448 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.68 
 
 
461 aa  90.1  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.78 
 
 
462 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09231  FAD binding oxidoreductase CpoX1 (AFU_orthologue; AFUA_2G18050)  33.88 
 
 
575 aa  89.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  30 
 
 
758 aa  89  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  30.85 
 
 
456 aa  89  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1145  FAD/FMN-containing dehydrogenase  30.27 
 
 
456 aa  89  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10388  glucooligosaccharide oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14340)  29.26 
 
 
471 aa  88.2  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451589  normal  0.284571 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  33.13 
 
 
764 aa  88.2  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2435  oxidoreductase, FAD-binding, putative  32.97 
 
 
471 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0684957  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  32.49 
 
 
462 aa  87.8  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10930  FAD-dependent oxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00840)  32.96 
 
 
501 aa  87  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.304326 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  27.83 
 
 
752 aa  87.4  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  32.12 
 
 
754 aa  87  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06807  conserved hypothetical protein  31.16 
 
 
982 aa  86.7  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.522291  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6967  oxidoreductase, FAD-dependent  27.56 
 
 
460 aa  86.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.581883 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  26.18 
 
 
473 aa  86.3  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7882  FAD/FMN-containing dehydrogenase  32.67 
 
 
436 aa  86.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  31.14 
 
 
469 aa  85.9  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  30.72 
 
 
465 aa  86.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4807  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.69 
 
 
507 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.658991  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2915  FAD linked oxidase domain protein  32.97 
 
 
455 aa  85.5  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000548663  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02387  conserved hypothetical protein  32.16 
 
 
502 aa  84.3  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.870175 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0639  FAD linked oxidase domain protein  31.46 
 
 
454 aa  84.3  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3765  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.32 
 
 
495 aa  83.6  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378557  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.45 
 
 
478 aa  83.6  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.59 
 
 
460 aa  83.6  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.65 
 
 
462 aa  83.6  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05417  isoamyl alcohol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00430)  32.77 
 
 
590 aa  82.4  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1620  FAD linked oxidase domain protein  33.81 
 
 
465 aa  82.4  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.15 
 
 
462 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  29.15 
 
 
462 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3907  twin-arginine translocation pathway signal  32.24 
 
 
489 aa  82  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 
449 aa  80.9  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7289  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.55 
 
 
542 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0772845  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1824  FAD linked oxidase domain protein  37.14 
 
 
439 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0318  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  25.52 
 
 
491 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000970405  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.56 
 
 
726 aa  80.1  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>