More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1085 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  87.45 
 
 		 478 aa  816    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  100 
 
 		 478 aa  966    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  47.31 
 
 		 602 aa  414  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  47.1 
 
 		 465 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.01 
 
 		 461 aa  389  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  43.97 
 
 		 479 aa  387  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  43.45 
 
 		 461 aa  385  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  43.88 
 
 		 473 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  47.22 
 
 		 477 aa  381  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  41.81 
 
 		 474 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  45.99 
 
 		 469 aa  372  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  41.65 
 
 		 479 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  41.44 
 
 		 479 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.16 
 
 		 479 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  40.65 
 
 		 461 aa  356  3.9999999999999996e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.7 
 
 		 472 aa  349  6e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  41.47 
 
 		 470 aa  348  1e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  42.06 
 
 		 459 aa  347  3e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.34 
 
 		 464 aa  346  6e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  41.24 
 
 		 463 aa  345  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  42.08 
 
 		 465 aa  337  1.9999999999999998e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.39 
 
 		 461 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.15 
 
 		 465 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  38.88 
 
 		 462 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  42.32 
 
 		 477 aa  318  1e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  41.78 
 
 		 465 aa  318  1e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  40.43 
 
 		 499 aa  316  5e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  41.65 
 
 		 468 aa  316  6e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  39.01 
 
 		 462 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  42.27 
 
 		 465 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  37.47 
 
 		 473 aa  311  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  42.7 
 
 		 456 aa  307  3e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  36.13 
 
 		 473 aa  305  9.000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  41.81 
 
 		 476 aa  304  3.0000000000000004e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  41.47 
 
 		 460 aa  298  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  40.6 
 
 		 461 aa  292  7e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  39.96 
 
 		 461 aa  290  4e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  38.1 
 
 		 458 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  39.43 
 
 		 463 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  40.44 
 
 		 456 aa  268  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  40.77 
 
 		 466 aa  267  4e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.63 
 
 		 444 aa  259  6e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  38.9 
 
 		 456 aa  248  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  36.77 
 
 		 465 aa  243  5e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  37.34 
 
 		 466 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  36.74 
 
 		 469 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11743  oxidoreductase  36 
 
 		 461 aa  226  8e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0117669  normal  0.752588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.94 
 
 		 448 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  30.32 
 
 		 462 aa  203  5e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.41 
 
 		 449 aa  192  8e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.26 
 
 		 472 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.59 
 
 		 466 aa  189  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  29.49 
 
 		 448 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  31.51 
 
 		 467 aa  186  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  28.91 
 
 		 444 aa  181  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  34.89 
 
 		 446 aa  178  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.7 
 
 		 484 aa  176  8e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  27.8 
 
 		 444 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  32.68 
 
 		 449 aa  170  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  32.22 
 
 		 459 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4344  FAD linked oxidase domain protein  33.85 
 
 		 450 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.577793 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2435  oxidoreductase, FAD-binding, putative  31.66 
 
 		 471 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0684957  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  31.45 
 
 		 753 aa  166  6.9999999999999995e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 		 474 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.3 
 
 		 481 aa  163  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.63 
 
 		 490 aa  162  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.63 
 
 		 492 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  27.75 
 
 		 448 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  32.1 
 
 		 752 aa  161  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.19 
 
 		 734 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  32.29 
 
 		 758 aa  156  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09308  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G00730)  32.62 
 
 		 473 aa  154  5e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2907  FAD linked oxidase domain protein  29.26 
 
 		 470 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.777851  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  31.42 
 
 		 487 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1621  FAD linked oxidase domain protein  29.49 
 
 		 468 aa  151  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  27.11 
 
 		 448 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  34.43 
 
 		 764 aa  150  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.42 
 
 		 462 aa  150  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.22 
 
 		 726 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05846  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14630)  29.75 
 
 		 472 aa  146  7.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  32.98 
 
 		 447 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  29.65 
 
 		 596 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  30.15 
 
 		 436 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.53 
 
 		 462 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1620  FAD linked oxidase domain protein  30 
 
 		 465 aa  144  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  30.53 
 
 		 462 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  28.84 
 
 		 459 aa  144  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3943  FAD linked oxidase domain protein  29.59 
 
 		 448 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.4 
 
 		 474 aa  141  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  25.79 
 
 		 705 aa  140  7e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.05 
 
 		 451 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  31.52 
 
 		 532 aa  139  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.13 
 
 		 490 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  32.42 
 
 		 480 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.85 
 
 		 460 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.32 
 
 		 462 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0479  hypothetical protein  29.43 
 
 		 328 aa  130  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0479005  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2149  FAD linked oxidase domain protein  31.26 
 
 		 458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7186  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.28 
 
 		 473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.65 
 
 		 805 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.258933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>