More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2335 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  100 
 
 
474 aa  976    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  60.93 
 
 
461 aa  605  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  58.52 
 
 
461 aa  591  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  59.57 
 
 
464 aa  585  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  60.57 
 
 
463 aa  585  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.94 
 
 
461 aa  584  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  56.45 
 
 
479 aa  566  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.99 
 
 
461 aa  556  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.03 
 
 
479 aa  548  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.09 
 
 
472 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  52.54 
 
 
479 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  59.65 
 
 
462 aa  535  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  51.27 
 
 
479 aa  532  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  59.6 
 
 
462 aa  525  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  57.99 
 
 
465 aa  516  1.0000000000000001e-145  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  49.79 
 
 
473 aa  484  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  52.74 
 
 
465 aa  477  1e-133  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  43.62 
 
 
473 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  46.05 
 
 
469 aa  402  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  44.62 
 
 
459 aa  396  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  43.48 
 
 
465 aa  376  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  43.02 
 
 
499 aa  371  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  42.64 
 
 
470 aa  369  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  42.35 
 
 
602 aa  371  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  44.42 
 
 
477 aa  369  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  41.47 
 
 
478 aa  371  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.78 
 
 
465 aa  359  7e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  41.99 
 
 
468 aa  354  2e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.68 
 
 
478 aa  348  9e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  42.23 
 
 
476 aa  344  2e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  41.89 
 
 
463 aa  343  4e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  40.7 
 
 
458 aa  342  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  42.76 
 
 
477 aa  339  7e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  42.83 
 
 
465 aa  338  9.999999999999999e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  43.14 
 
 
461 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  41.2 
 
 
456 aa  336  5e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  41.1 
 
 
460 aa  330  3e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  43.08 
 
 
456 aa  325  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.5 
 
 
444 aa  322  9.999999999999999e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  40.53 
 
 
461 aa  318  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  41.48 
 
 
466 aa  315  8e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  42.15 
 
 
456 aa  315  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11743  oxidoreductase  39.65 
 
 
461 aa  312  7.999999999999999e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0117669  normal  0.752588 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  35.17 
 
 
473 aa  307  3e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  41.28 
 
 
466 aa  289  9e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  37.15 
 
 
465 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.46 
 
 
448 aa  269  7e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  35.64 
 
 
469 aa  253  6e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.04 
 
 
472 aa  218  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.54 
 
 
466 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  34.96 
 
 
449 aa  202  8e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4344  FAD linked oxidase domain protein  36.36 
 
 
450 aa  200  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.577793 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.06 
 
 
490 aa  199  9e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  31.02 
 
 
462 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2149  FAD linked oxidase domain protein  37.45 
 
 
458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.99 
 
 
492 aa  196  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  34.51 
 
 
446 aa  196  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  29.41 
 
 
444 aa  195  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2435  oxidoreductase, FAD-binding, putative  30.07 
 
 
471 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0684957  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  28.23 
 
 
444 aa  187  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  28.07 
 
 
448 aa  187  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.03 
 
 
481 aa  187  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3943  FAD linked oxidase domain protein  29.21 
 
 
448 aa  183  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.07 
 
 
460 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  32.29 
 
 
596 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.51 
 
 
734 aa  179  7e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.83 
 
 
726 aa  179  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  28.98 
 
 
436 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.11 
 
 
474 aa  170  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  27.9 
 
 
705 aa  168  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  32.75 
 
 
447 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  30.09 
 
 
459 aa  165  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  29.76 
 
 
752 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.7 
 
 
462 aa  164  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.29 
 
 
462 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  27.29 
 
 
462 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09308  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G00730)  31.36 
 
 
473 aa  163  6e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4792  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.81 
 
 
462 aa  162  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  27.99 
 
 
459 aa  162  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.07 
 
 
484 aa  161  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  31.92 
 
 
764 aa  159  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  29.25 
 
 
467 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.86 
 
 
462 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2404  FAD linked oxidase domain protein  32.29 
 
 
495 aa  157  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  hitchhiker  0.00629594 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  30.07 
 
 
753 aa  157  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  30.93 
 
 
487 aa  157  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.6 
 
 
490 aa  156  6e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  30.48 
 
 
758 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0127  FAD linked oxidase domain protein  27.62 
 
 
775 aa  154  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.48716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  29.26 
 
 
474 aa  154  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  26.37 
 
 
448 aa  154  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05846  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14630)  29.3 
 
 
472 aa  153  7e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  32.13 
 
 
480 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.22 
 
 
449 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2907  FAD linked oxidase domain protein  29.65 
 
 
470 aa  147  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.777851  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3628  FAD linked oxidase domain protein  28.76 
 
 
451 aa  143  6e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  30.04 
 
 
754 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2448  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.36 
 
 
476 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.370857  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  25.71 
 
 
448 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0518  histidine kinase  28.96 
 
 
501 aa  139  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>