More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6057 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
451 aa  900    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.72 
 
 
474 aa  277  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  38.56 
 
 
480 aa  246  8e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  37.97 
 
 
532 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2448  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.41 
 
 
476 aa  233  5e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.370857  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  33.93 
 
 
487 aa  219  8.999999999999998e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7289  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.18 
 
 
542 aa  212  9e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0772845  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.71 
 
 
466 aa  212  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  30.36 
 
 
444 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3628  FAD linked oxidase domain protein  38.51 
 
 
451 aa  196  7e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  30 
 
 
444 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  33.91 
 
 
458 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  30.94 
 
 
448 aa  187  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  33.11 
 
 
461 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  34.43 
 
 
479 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  33.91 
 
 
479 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.16 
 
 
461 aa  177  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  33.76 
 
 
499 aa  176  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  33.98 
 
 
479 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.95 
 
 
479 aa  171  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.76 
 
 
492 aa  170  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0518  histidine kinase  30.4 
 
 
501 aa  169  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2404  FAD linked oxidase domain protein  34.58 
 
 
495 aa  168  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  hitchhiker  0.00629594 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.53 
 
 
464 aa  167  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  35.48 
 
 
446 aa  166  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.76 
 
 
490 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  32.89 
 
 
477 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  32.2 
 
 
478 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  32.18 
 
 
463 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  30.23 
 
 
461 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.65 
 
 
449 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  31.96 
 
 
602 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  31.17 
 
 
459 aa  160  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0042  FAD linked oxidase domain protein  30.59 
 
 
545 aa  157  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.05 
 
 
472 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  33.91 
 
 
465 aa  156  8e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  33.41 
 
 
468 aa  155  9e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  33.48 
 
 
469 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  29.57 
 
 
473 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  31.02 
 
 
462 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  35.49 
 
 
754 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  34.12 
 
 
753 aa  152  8.999999999999999e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0479  hypothetical protein  31.02 
 
 
328 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0479005  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  25.18 
 
 
448 aa  150  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  30.43 
 
 
462 aa  150  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  31.43 
 
 
463 aa  150  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  28.48 
 
 
474 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  32.31 
 
 
758 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  32.4 
 
 
460 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.63 
 
 
461 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  31.53 
 
 
470 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.29 
 
 
478 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  29.34 
 
 
473 aa  144  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.82 
 
 
469 aa  144  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4048  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.49 
 
 
476 aa  143  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225855  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.32 
 
 
490 aa  143  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  33.12 
 
 
476 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  36.99 
 
 
465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  34.45 
 
 
764 aa  141  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  32.49 
 
 
465 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  30.89 
 
 
461 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  29.71 
 
 
456 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  24.67 
 
 
448 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  33.19 
 
 
466 aa  137  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  33.77 
 
 
467 aa  137  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  32.68 
 
 
456 aa  137  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  35.73 
 
 
447 aa  136  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  30.18 
 
 
461 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.46 
 
 
465 aa  134  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  29.61 
 
 
474 aa  131  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000469  probable oxidoreductase  34.82 
 
 
563 aa  131  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0940249  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10062  oxidoreductase  31.19 
 
 
479 aa  130  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.761932 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  28.23 
 
 
462 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  31.7 
 
 
477 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.48 
 
 
734 aa  130  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  31.31 
 
 
473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  31.62 
 
 
752 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.29 
 
 
444 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.08 
 
 
484 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  25 
 
 
705 aa  123  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  30.7 
 
 
465 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.62 
 
 
726 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0127  FAD linked oxidase domain protein  29.32 
 
 
775 aa  121  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.48716 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  30.91 
 
 
466 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5613  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.78 
 
 
445 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2149  FAD linked oxidase domain protein  35.18 
 
 
458 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.02 
 
 
481 aa  120  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  29.93 
 
 
456 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.5 
 
 
448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.1 
 
 
460 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1539  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.42 
 
 
864 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416598  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1503  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.42 
 
 
864 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1510  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.9 
 
 
614 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1411  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.57 
 
 
891 aa  113  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2842  FAD linked oxidase domain protein  34.9 
 
 
864 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0215386 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10388  glucooligosaccharide oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14340)  28.84 
 
 
471 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451589  normal  0.284571 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09308  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G00730)  29.66 
 
 
473 aa  109  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  29.78 
 
 
465 aa  110  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.84 
 
 
462 aa  109  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  36.04 
 
 
459 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>