More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4161 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 481 aa  947    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  31.39 
 
 		 479 aa  206  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  30.95 
 
 		 479 aa  202  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  31.21 
 
 		 473 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  33.78 
 
 		 463 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.89 
 
 		 464 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  30.85 
 
 		 479 aa  196  7e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.28 
 
 		 461 aa  190  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  29.64 
 
 		 461 aa  187  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  33.48 
 
 		 477 aa  187  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  29.03 
 
 		 474 aa  187  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  31.15 
 
 		 477 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.93 
 
 		 479 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  30.64 
 
 		 458 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  32.13 
 
 		 461 aa  180  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  28.29 
 
 		 462 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  30.84 
 
 		 468 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  29.35 
 
 		 473 aa  178  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  30.97 
 
 		 465 aa  177  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  30.18 
 
 		 456 aa  176  8e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  30.84 
 
 		 499 aa  176  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  28.39 
 
 		 461 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.76 
 
 		 472 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  30.91 
 
 		 459 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  30.11 
 
 		 463 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  28.73 
 
 		 462 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  31.32 
 
 		 465 aa  170  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  29.7 
 
 		 470 aa  166  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  30.89 
 
 		 466 aa  164  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  30.7 
 
 		 465 aa  163  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  30.56 
 
 		 469 aa  163  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.63 
 
 		 448 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.08 
 
 		 465 aa  160  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  30.8 
 
 		 456 aa  160  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  31.42 
 
 		 465 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  30.3 
 
 		 478 aa  158  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  29.34 
 
 		 460 aa  153  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.21 
 
 		 444 aa  150  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.45 
 
 		 461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  30.99 
 
 		 602 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.51 
 
 		 478 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.19 
 
 		 449 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  31.24 
 
 		 476 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  29.74 
 
 		 461 aa  144  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  29.67 
 
 		 465 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  29 
 
 		 456 aa  141  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  30.24 
 
 		 466 aa  139  8.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  27.42 
 
 		 473 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  27.72 
 
 		 705 aa  139  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  31.74 
 
 		 446 aa  139  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.49 
 
 		 734 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  40.43 
 
 		 758 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  23.76 
 
 		 448 aa  134  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  45.41 
 
 		 764 aa  131  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.05 
 
 		 466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  42.5 
 
 		 752 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  31.03 
 
 		 462 aa  127  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.03 
 
 		 462 aa  127  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.29 
 
 		 726 aa  127  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  28.91 
 
 		 469 aa  126  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  32.63 
 
 		 444 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  34.23 
 
 		 444 aa  124  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.32 
 
 		 474 aa  124  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09308  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G00730)  27.29 
 
 		 473 aa  123  6e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.75 
 
 		 462 aa  123  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.43 
 
 		 460 aa  123  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  29 
 
 		 596 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3943  FAD linked oxidase domain protein  27.77 
 
 		 448 aa  121  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  37.74 
 
 		 753 aa  121  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  35.94 
 
 		 462 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  24.41 
 
 		 448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  32.99 
 
 		 459 aa  118  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05846  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14630)  35.53 
 
 		 472 aa  117  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11743  oxidoreductase  27.65 
 
 		 461 aa  117  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0117669  normal  0.752588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  33.63 
 
 		 480 aa  116  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  30.43 
 
 		 449 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  35.48 
 
 		 754 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  35.56 
 
 		 467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.54 
 
 		 492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  32.5 
 
 		 448 aa  114  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2583  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.52 
 
 		 896 aa  114  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.15241 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1510  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.71 
 
 		 614 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1503  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.2 
 
 		 864 aa  113  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.15 
 
 		 462 aa  113  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1539  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.2 
 
 		 864 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0127  FAD linked oxidase domain protein  28.38 
 
 		 775 aa  113  7.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.48716 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2842  FAD linked oxidase domain protein  31.71 
 
 		 864 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0215386 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2650  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.38 
 
 		 896 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02387  conserved hypothetical protein  31.69 
 
 		 502 aa  111  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.870175 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  30.51 
 
 		 436 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.63 
 
 		 490 aa  111  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2758  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.96 
 
 		 896 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0639  FAD linked oxidase domain protein  28.6 
 
 		 454 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1694  FAD-binding protein  30.81 
 
 		 894 aa  110  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2404  FAD linked oxidase domain protein  30.41 
 
 		 495 aa  110  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  hitchhiker  0.00629594 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2435  oxidoreductase, FAD-binding, putative  25.87 
 
 		 471 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0684957  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  27.98 
 
 		 459 aa  109  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.97 
 
 		 490 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1411  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.22 
 
 		 891 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  36.76 
 
 		 487 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>