More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2583 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1694  FAD-binding protein  78.27 
 
 		 894 aa  1452    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1411  FAD linked oxidase domain-containing protein  61.88 
 
 		 891 aa  1124    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1510  FAD linked oxidase domain-containing protein  62.1 
 
 		 614 aa  794    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1503  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.47 
 
 		 864 aa  994    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2758  FAD linked oxidase domain-containing protein  91.29 
 
 		 896 aa  1727    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1539  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.58 
 
 		 864 aa  995    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2842  FAD linked oxidase domain protein  56.14 
 
 		 864 aa  1002    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0215386 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2583  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 896 aa  1872    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.15241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2650  FAD linked oxidase domain-containing protein  97.88 
 
 		 896 aa  1832    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000469  probable oxidoreductase  42.8 
 
 		 563 aa  414  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0940249  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3854  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.93 
 
 		 574 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3156  FAD linked oxidase-like protein  32.58 
 
 		 577 aa  280  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1512  FAD-binding protein  41.67 
 
 		 274 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.592661  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.6 
 
 		 449 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  36.51 
 
 		 448 aa  124  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  33.9 
 
 		 463 aa  124  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  33.5 
 
 		 479 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  31.21 
 
 		 479 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  32.98 
 
 		 461 aa  122  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  33.85 
 
 		 462 aa  121  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 		 462 aa  121  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.99 
 
 		 444 aa  120  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.69 
 
 		 464 aa  119  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  35.11 
 
 		 461 aa  118  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.62 
 
 		 461 aa  117  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  28.57 
 
 		 474 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  29.95 
 
 		 479 aa  115  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.52 
 
 		 481 aa  114  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  33.69 
 
 		 463 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  30.05 
 
 		 448 aa  112  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.57 
 
 		 461 aa  111  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.63 
 
 		 474 aa  110  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  33.52 
 
 		 458 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.95 
 
 		 479 aa  109  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  28.7 
 
 		 705 aa  108  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  28.92 
 
 		 473 aa  107  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.5 
 
 		 465 aa  105  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  32.1 
 
 		 465 aa  105  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  28.96 
 
 		 478 aa  105  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  32.26 
 
 		 461 aa  105  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  30.54 
 
 		 448 aa  103  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  33.01 
 
 		 456 aa  100  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.52 
 
 		 478 aa  100  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  29.13 
 
 		 468 aa  100  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  28.57 
 
 		 499 aa  100  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.57 
 
 		 472 aa  100  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.57 
 
 		 469 aa  98.6  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  27.81 
 
 		 473 aa  98.2  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2543  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.86 
 
 		 456 aa  98.2  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  33.5 
 
 		 532 aa  97.8  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  33.13 
 
 		 469 aa  97.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  29.78 
 
 		 459 aa  96.3  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  35.35 
 
 		 480 aa  95.9  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  31.88 
 
 		 466 aa  95.9  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  29.21 
 
 		 459 aa  95.5  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  35.96 
 
 		 446 aa  95.1  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  32.4 
 
 		 460 aa  94.7  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  30.5 
 
 		 465 aa  94.4  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  30.48 
 
 		 465 aa  94.4  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.94 
 
 		 484 aa  93.6  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10388  glucooligosaccharide oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14340)  24.8 
 
 		 471 aa  93.2  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451589  normal  0.284571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.32 
 
 		 490 aa  93.2  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0518  histidine kinase  33.33 
 
 		 501 aa  93.2  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.74 
 
 		 466 aa  92  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  30.68 
 
 		 456 aa  91.7  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  30.43 
 
 		 477 aa  91.3  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  30.32 
 
 		 444 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0639  FAD linked oxidase domain protein  29.67 
 
 		 454 aa  88.6  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  34.57 
 
 		 764 aa  87.4  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  32.2 
 
 		 461 aa  86.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  31.29 
 
 		 470 aa  85.9  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3943  FAD linked oxidase domain protein  29.05 
 
 		 448 aa  85.5  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08964  conserved hypothetical protein  34.88 
 
 		 470 aa  85.1  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  28.77 
 
 		 444 aa  84.7  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.23 
 
 		 492 aa  84.3  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  31.06 
 
 		 602 aa  84.3  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.27 
 
 		 448 aa  84  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.73 
 
 		 805 aa  84  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.258933  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  28.26 
 
 		 462 aa  82.8  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2435  oxidoreductase, FAD-binding, putative  30.65 
 
 		 471 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0684957  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2963  FAD binding domain-containing protein  27.73 
 
 		 805 aa  83.2  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000276895 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11743  oxidoreductase  29.81 
 
 		 461 aa  81.6  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0117669  normal  0.752588 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03399  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17690)  29.05 
 
 		 461 aa  81.3  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.31125 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  26.98 
 
 		 466 aa  81.3  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  26.64 
 
 		 474 aa  80.5  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  28.5 
 
 		 487 aa  80.1  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  29.05 
 
 		 752 aa  79  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1145  FAD/FMN-containing dehydrogenase  30.26 
 
 		 456 aa  79.3  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  26.71 
 
 		 465 aa  78.2  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3907  twin-arginine translocation pathway signal  25.71 
 
 		 489 aa  78.2  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  32.22 
 
 		 456 aa  78.2  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1824  FAD linked oxidase domain protein  31.47 
 
 		 439 aa  78.2  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3628  FAD linked oxidase domain protein  29.79 
 
 		 451 aa  77.8  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.4 
 
 		 451 aa  77.8  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02387  conserved hypothetical protein  28.24 
 
 		 502 aa  77  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.870175 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1620  FAD linked oxidase domain protein  25.36 
 
 		 465 aa  77  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10062  oxidoreductase  32.31 
 
 		 479 aa  77.4  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761932 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  30.92 
 
 		 449 aa  77.4  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05550  conserved hypothetical protein  30.04 
 
 		 482 aa  76.6  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4807  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.54 
 
 		 507 aa  77  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.658991  normal  0.754825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>