More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1360 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  100 
 
 		 473 aa  962    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  46.1 
 
 		 465 aa  375  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  41.09 
 
 		 473 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  43.83 
 
 		 477 aa  368  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  40.34 
 
 		 461 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  42.24 
 
 		 602 aa  357  2.9999999999999997e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  41.05 
 
 		 479 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  41.74 
 
 		 479 aa  352  5.9999999999999994e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  40.04 
 
 		 461 aa  350  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  40.47 
 
 		 479 aa  350  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.86 
 
 		 472 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.62 
 
 		 479 aa  342  5.999999999999999e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.61 
 
 		 461 aa  341  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  40.17 
 
 		 470 aa  336  5e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.48 
 
 		 464 aa  335  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  41.27 
 
 		 477 aa  330  2e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  39.26 
 
 		 459 aa  326  5e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  42.7 
 
 		 465 aa  326  7e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.79 
 
 		 461 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  40.39 
 
 		 469 aa  316  5e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.27 
 
 		 465 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  38.41 
 
 		 462 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  39.83 
 
 		 465 aa  312  7.999999999999999e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  37.86 
 
 		 463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  35.17 
 
 		 474 aa  307  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  39.39 
 
 		 463 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  36.13 
 
 		 478 aa  305  9.000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  37.2 
 
 		 462 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  39.83 
 
 		 461 aa  302  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  40.04 
 
 		 465 aa  302  1e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  37.18 
 
 		 473 aa  299  6e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.87 
 
 		 478 aa  299  7e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  40.35 
 
 		 461 aa  298  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  39.73 
 
 		 456 aa  295  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  37.39 
 
 		 458 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  37.86 
 
 		 476 aa  286  5.999999999999999e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  37.04 
 
 		 456 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  38.21 
 
 		 460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  37.53 
 
 		 468 aa  268  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11743  oxidoreductase  38.85 
 
 		 461 aa  263  6.999999999999999e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0117669  normal  0.752588 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  33.71 
 
 		 499 aa  262  8e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  37.47 
 
 		 466 aa  254  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.3 
 
 		 444 aa  249  8e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  35.62 
 
 		 466 aa  249  9e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  36.02 
 
 		 456 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  34.05 
 
 		 469 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  34.9 
 
 		 465 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.57 
 
 		 448 aa  212  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  34.46 
 
 		 467 aa  202  7e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  28.73 
 
 		 448 aa  195  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3943  FAD linked oxidase domain protein  30.8 
 
 		 448 aa  180  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.35 
 
 		 481 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  30.68 
 
 		 462 aa  178  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.39 
 
 		 490 aa  176  7e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.44 
 
 		 449 aa  176  8e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  27.52 
 
 		 448 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.36 
 
 		 466 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.42 
 
 		 472 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  32.4 
 
 		 446 aa  172  9e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.57 
 
 		 492 aa  171  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  27.73 
 
 		 444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  31.56 
 
 		 449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  31.72 
 
 		 752 aa  164  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  32.98 
 
 		 447 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.77 
 
 		 734 aa  162  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  27.51 
 
 		 444 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  28.35 
 
 		 436 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.04 
 
 		 490 aa  159  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  27.58 
 
 		 448 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  29.93 
 
 		 758 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  26.17 
 
 		 705 aa  157  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4344  FAD linked oxidase domain protein  30.8 
 
 		 450 aa  157  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.577793 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4792  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.94 
 
 		 462 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  29.5 
 
 		 753 aa  154  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.32 
 
 		 460 aa  153  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2404  FAD linked oxidase domain protein  31.91 
 
 		 495 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  hitchhiker  0.00629594 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2435  oxidoreductase, FAD-binding, putative  29.89 
 
 		 471 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0684957  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.74 
 
 		 474 aa  152  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  28.95 
 
 		 764 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09308  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G00730)  30.21 
 
 		 473 aa  150  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.93 
 
 		 726 aa  147  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  29.93 
 
 		 474 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  29.74 
 
 		 487 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05846  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14630)  32.88 
 
 		 472 aa  144  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 754 aa  143  5e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.9 
 
 		 462 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  30.02 
 
 		 459 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  28.48 
 
 		 459 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.45 
 
 		 484 aa  137  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0042  FAD linked oxidase domain protein  28.18 
 
 		 545 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5613  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.41 
 
 		 445 aa  133  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.28 
 
 		 462 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  30.28 
 
 		 462 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2149  FAD linked oxidase domain protein  31.85 
 
 		 458 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.28 
 
 		 462 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1145  FAD/FMN-containing dehydrogenase  32.94 
 
 		 456 aa  129  8.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  29.76 
 
 		 480 aa  129  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.57 
 
 		 451 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2448  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.25 
 
 		 476 aa  127  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.370857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  29.67 
 
 		 532 aa  127  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>