More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1506 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  100 
 
 
461 aa  947    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  80.04 
 
 
461 aa  783    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  62.83 
 
 
461 aa  634  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  63.34 
 
 
464 aa  622  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  62.47 
 
 
461 aa  615  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  60.93 
 
 
474 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  62.12 
 
 
463 aa  606  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.7 
 
 
479 aa  579  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  58.82 
 
 
479 aa  579  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  57.73 
 
 
479 aa  568  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  56.86 
 
 
479 aa  566  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  62.47 
 
 
462 aa  567  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  60.95 
 
 
462 aa  559  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.1 
 
 
472 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  56.07 
 
 
465 aa  512  1e-144  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  51.33 
 
 
465 aa  470  1.0000000000000001e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  48.36 
 
 
473 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  49.78 
 
 
473 aa  444  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  47.8 
 
 
459 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  45.71 
 
 
602 aa  402  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  46.12 
 
 
465 aa  398  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  45.92 
 
 
469 aa  397  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.17 
 
 
465 aa  394  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  45.55 
 
 
470 aa  389  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  45.41 
 
 
468 aa  390  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  45.3 
 
 
458 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  47.44 
 
 
456 aa  385  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  42.89 
 
 
478 aa  377  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  42.14 
 
 
499 aa  374  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  44.08 
 
 
463 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  45.63 
 
 
461 aa  373  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  46.96 
 
 
461 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  43.1 
 
 
476 aa  369  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  45.73 
 
 
477 aa  368  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.41 
 
 
478 aa  364  2e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  44.15 
 
 
465 aa  355  7.999999999999999e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  42.95 
 
 
477 aa  352  8e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  40.04 
 
 
473 aa  350  2e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  44.71 
 
 
460 aa  347  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  46.46 
 
 
456 aa  345  8e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.76 
 
 
444 aa  332  9e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  43.95 
 
 
456 aa  329  6e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  42.01 
 
 
466 aa  329  8e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11743  oxidoreductase  40.85 
 
 
461 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0117669  normal  0.752588 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  41.43 
 
 
466 aa  303  5.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  38.95 
 
 
469 aa  293  3e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  38.01 
 
 
465 aa  290  3e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.91 
 
 
448 aa  279  8e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.28 
 
 
472 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  37.47 
 
 
446 aa  227  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  36.4 
 
 
449 aa  227  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.28 
 
 
492 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4344  FAD linked oxidase domain protein  37.64 
 
 
450 aa  220  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.577793 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2149  FAD linked oxidase domain protein  37.12 
 
 
458 aa  219  7e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  32.37 
 
 
462 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.87 
 
 
490 aa  216  7e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  30.77 
 
 
448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.37 
 
 
466 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3943  FAD linked oxidase domain protein  31.78 
 
 
448 aa  205  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  29.11 
 
 
444 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  29.33 
 
 
444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  29.33 
 
 
705 aa  196  6e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.77 
 
 
460 aa  195  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  36.03 
 
 
447 aa  194  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.44 
 
 
484 aa  192  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2435  oxidoreductase, FAD-binding, putative  31.8 
 
 
471 aa  189  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0684957  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.57 
 
 
449 aa  189  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.64 
 
 
481 aa  187  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  31.58 
 
 
487 aa  187  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  29.18 
 
 
448 aa  187  5e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.84 
 
 
490 aa  186  7e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.78 
 
 
462 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  30 
 
 
462 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  30 
 
 
462 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  31.39 
 
 
474 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  33.41 
 
 
764 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  31.91 
 
 
596 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  29.65 
 
 
448 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  30 
 
 
467 aa  181  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  29.07 
 
 
436 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  32.24 
 
 
752 aa  177  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.24 
 
 
474 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.09 
 
 
462 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  31.15 
 
 
459 aa  173  6.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  31.4 
 
 
753 aa  172  7.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.36 
 
 
726 aa  171  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09308  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G00730)  32.1 
 
 
473 aa  167  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  32.11 
 
 
532 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4792  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.23 
 
 
462 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  30.15 
 
 
459 aa  161  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3628  FAD linked oxidase domain protein  30.6 
 
 
451 aa  160  6e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  30.92 
 
 
758 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4807  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.51 
 
 
507 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.658991  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1620  FAD linked oxidase domain protein  30.44 
 
 
465 aa  156  7e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  32.04 
 
 
480 aa  156  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05846  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14630)  30.48 
 
 
472 aa  152  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.11 
 
 
451 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2404  FAD linked oxidase domain protein  33.49 
 
 
495 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  hitchhiker  0.00629594 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5613  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.79 
 
 
445 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  30.2 
 
 
754 aa  150  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>