More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5365 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
464 aa  950    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  76.62 
 
 
462 aa  698    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  77.01 
 
 
462 aa  693    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  63.34 
 
 
461 aa  622  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  62.47 
 
 
461 aa  600  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  58.13 
 
 
461 aa  597  1e-169  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  59.57 
 
 
474 aa  585  1e-166  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  59.35 
 
 
479 aa  587  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  59.18 
 
 
463 aa  578  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  59.04 
 
 
479 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.42 
 
 
479 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  57.3 
 
 
479 aa  565  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.05 
 
 
461 aa  556  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.39 
 
 
472 aa  542  1e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  60.26 
 
 
465 aa  508  9.999999999999999e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  50.22 
 
 
473 aa  464  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  51.2 
 
 
465 aa  456  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  47.6 
 
 
473 aa  434  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  48.25 
 
 
469 aa  420  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  46.74 
 
 
459 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  47.99 
 
 
465 aa  390  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  44.49 
 
 
602 aa  374  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  43.84 
 
 
470 aa  368  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.11 
 
 
465 aa  368  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  42.14 
 
 
499 aa  364  1e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  44.87 
 
 
477 aa  363  3e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  43.98 
 
 
458 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  45.05 
 
 
456 aa  356  5.999999999999999e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  44.35 
 
 
476 aa  355  8.999999999999999e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  42.3 
 
 
468 aa  349  5e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  44.66 
 
 
461 aa  347  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  42.98 
 
 
463 aa  345  8e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  40.39 
 
 
478 aa  343  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  44.64 
 
 
456 aa  343  4e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  43.96 
 
 
465 aa  343  4e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  43.23 
 
 
477 aa  340  2.9999999999999998e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  39.48 
 
 
473 aa  335  1e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  42.36 
 
 
461 aa  332  1e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.81 
 
 
478 aa  329  7e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  43.2 
 
 
460 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  43.37 
 
 
456 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  42.67 
 
 
466 aa  318  2e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.27 
 
 
444 aa  311  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11743  oxidoreductase  39.78 
 
 
461 aa  298  1e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0117669  normal  0.752588 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  41.21 
 
 
466 aa  293  3e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  39.31 
 
 
469 aa  271  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  36.32 
 
 
465 aa  271  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.77 
 
 
448 aa  242  9e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.68 
 
 
472 aa  241  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2149  FAD linked oxidase domain protein  38.53 
 
 
458 aa  223  4e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4344  FAD linked oxidase domain protein  38.22 
 
 
450 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.577793 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  31.92 
 
 
462 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  30.2 
 
 
448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.89 
 
 
481 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.22 
 
 
492 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  31.94 
 
 
436 aa  187  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2435  oxidoreductase, FAD-binding, putative  30.92 
 
 
471 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0684957  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.78 
 
 
490 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  33.48 
 
 
446 aa  179  8e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  33.55 
 
 
449 aa  179  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.87 
 
 
484 aa  178  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  30.45 
 
 
467 aa  176  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  32.12 
 
 
487 aa  173  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.63 
 
 
466 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09308  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G00730)  32.05 
 
 
473 aa  172  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  26.61 
 
 
705 aa  169  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  32.04 
 
 
752 aa  169  8e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.43 
 
 
449 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  29.5 
 
 
474 aa  163  7e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  26.61 
 
 
444 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.8 
 
 
460 aa  162  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  26.61 
 
 
444 aa  162  9e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3943  FAD linked oxidase domain protein  28.71 
 
 
448 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.37 
 
 
490 aa  160  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.73 
 
 
726 aa  154  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  31.76 
 
 
596 aa  154  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.8 
 
 
474 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.95 
 
 
734 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.41 
 
 
462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  31.36 
 
 
764 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  31.36 
 
 
459 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  28.41 
 
 
462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4792  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.45 
 
 
462 aa  148  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  25 
 
 
448 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2907  FAD linked oxidase domain protein  32.32 
 
 
470 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.777851  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.19 
 
 
462 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  29.18 
 
 
753 aa  146  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2448  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.43 
 
 
476 aa  144  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.370857  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  29 
 
 
459 aa  144  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1620  FAD linked oxidase domain protein  30.63 
 
 
465 aa  143  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05846  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14630)  29.61 
 
 
472 aa  143  6e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.88 
 
 
451 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5613  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.89 
 
 
445 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.25 
 
 
462 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2404  FAD linked oxidase domain protein  32.52 
 
 
495 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  hitchhiker  0.00629594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  32.33 
 
 
447 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1824  FAD linked oxidase domain protein  32.78 
 
 
439 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  24.78 
 
 
448 aa  133  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  29.87 
 
 
754 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0042  FAD linked oxidase domain protein  28.75 
 
 
545 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>