More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3666 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
446 aa  859    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  63.06 
 
 
447 aa  501  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  41.76 
 
 
758 aa  279  9e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  42.56 
 
 
734 aa  276  8e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  38.41 
 
 
753 aa  261  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  37.9 
 
 
461 aa  255  9e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  39.77 
 
 
752 aa  252  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.2 
 
 
461 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  39.82 
 
 
754 aa  240  4e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  42.76 
 
 
764 aa  238  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  36.25 
 
 
474 aa  237  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  37.61 
 
 
463 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2149  FAD linked oxidase domain protein  43.63 
 
 
458 aa  236  9e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.89 
 
 
726 aa  234  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  38.01 
 
 
469 aa  233  4.0000000000000004e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  35.33 
 
 
459 aa  232  9e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  37.72 
 
 
479 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  38.53 
 
 
460 aa  227  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  38.63 
 
 
456 aa  225  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  37.8 
 
 
479 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  34.9 
 
 
458 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.97 
 
 
472 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  36.62 
 
 
499 aa  223  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  37.5 
 
 
479 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  33.77 
 
 
461 aa  222  9e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  38.14 
 
 
461 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.47 
 
 
464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  38.53 
 
 
466 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.58 
 
 
465 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  37.8 
 
 
461 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.42 
 
 
461 aa  211  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0127  FAD linked oxidase domain protein  36.79 
 
 
775 aa  209  7e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.48716 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.84 
 
 
479 aa  209  9e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  34.47 
 
 
478 aa  206  8e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  37.8 
 
 
465 aa  205  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  33.77 
 
 
473 aa  205  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  36.32 
 
 
468 aa  204  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  32.43 
 
 
462 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  36.8 
 
 
469 aa  201  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  35.93 
 
 
465 aa  200  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  32.19 
 
 
462 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  35.75 
 
 
456 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  34.29 
 
 
463 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  36.5 
 
 
465 aa  196  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.87 
 
 
472 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.97 
 
 
478 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  32.97 
 
 
473 aa  194  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  36.56 
 
 
456 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1145  FAD/FMN-containing dehydrogenase  27.65 
 
 
456 aa  189  7e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  36.6 
 
 
476 aa  189  9e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  32.9 
 
 
602 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  35.04 
 
 
477 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  35.5 
 
 
470 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.79 
 
 
448 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  34.05 
 
 
465 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  35.82 
 
 
477 aa  180  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  36.38 
 
 
449 aa  180  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.86 
 
 
444 aa  179  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  34.91 
 
 
465 aa  176  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  34.55 
 
 
466 aa  175  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  28.44 
 
 
448 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.61 
 
 
481 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4344  FAD linked oxidase domain protein  34.81 
 
 
450 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.577793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  35.03 
 
 
436 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.09 
 
 
462 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.41 
 
 
460 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  34.22 
 
 
474 aa  163  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  31.94 
 
 
596 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.48 
 
 
451 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.53 
 
 
462 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  32.53 
 
 
462 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.62 
 
 
484 aa  160  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  31.02 
 
 
462 aa  159  8e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  32.68 
 
 
480 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2404  FAD linked oxidase domain protein  34.16 
 
 
495 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  hitchhiker  0.00629594 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.18 
 
 
462 aa  157  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11743  oxidoreductase  34.76 
 
 
461 aa  156  7e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0117669  normal  0.752588 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  35.11 
 
 
467 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  33.26 
 
 
487 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1620  FAD linked oxidase domain protein  31.69 
 
 
465 aa  153  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.12 
 
 
466 aa  153  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3628  FAD linked oxidase domain protein  34.13 
 
 
451 aa  153  8e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  34.14 
 
 
532 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1621  FAD linked oxidase domain protein  35.29 
 
 
468 aa  144  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0518  histidine kinase  30.09 
 
 
501 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  29.27 
 
 
473 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.4 
 
 
490 aa  139  7.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  27.27 
 
 
444 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  27.27 
 
 
444 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7186  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.01 
 
 
473 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7882  FAD/FMN-containing dehydrogenase  32.91 
 
 
436 aa  136  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2907  FAD linked oxidase domain protein  30.5 
 
 
470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.777851  normal  0.173158 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09308  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G00730)  32.24 
 
 
473 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.25 
 
 
492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02387  conserved hypothetical protein  32.71 
 
 
502 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.870175 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3943  FAD linked oxidase domain protein  29.53 
 
 
448 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.16 
 
 
449 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.03 
 
 
474 aa  126  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.07 
 
 
490 aa  126  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  30.5 
 
 
459 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>