275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1503 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2842  FAD linked oxidase domain protein  96.3 
 
 
864 aa  1753    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0215386 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1694  FAD-binding protein  55.85 
 
 
894 aa  994    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1503  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
864 aa  1803    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1411  FAD linked oxidase domain-containing protein  63.35 
 
 
891 aa  1130    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1510  FAD linked oxidase domain-containing protein  97.23 
 
 
614 aa  1248    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1539  FAD linked oxidase domain-containing protein  99.65 
 
 
864 aa  1799    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416598  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2583  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.47 
 
 
896 aa  994    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.15241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2650  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.47 
 
 
896 aa  992    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2758  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.17 
 
 
896 aa  996    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1512  FAD-binding protein  91.54 
 
 
274 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.592661  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000469  probable oxidoreductase  44.98 
 
 
563 aa  467  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0940249  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3854  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.82 
 
 
574 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3156  FAD linked oxidase-like protein  33.92 
 
 
577 aa  277  5e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  23.66 
 
 
448 aa  129  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  31.05 
 
 
463 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.65 
 
 
474 aa  119  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.89 
 
 
449 aa  119  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  35.52 
 
 
479 aa  118  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.28 
 
 
461 aa  117  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  35.52 
 
 
479 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  31.38 
 
 
462 aa  115  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  31.91 
 
 
462 aa  115  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  31.98 
 
 
461 aa  114  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.96 
 
 
444 aa  114  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.2 
 
 
481 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  33.5 
 
 
461 aa  113  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  31.75 
 
 
463 aa  112  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  28.63 
 
 
479 aa  112  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  30.69 
 
 
448 aa  110  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  29.95 
 
 
468 aa  109  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  27.96 
 
 
474 aa  108  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.53 
 
 
461 aa  107  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.07 
 
 
464 aa  106  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.29 
 
 
469 aa  105  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  28.18 
 
 
478 aa  105  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  31.22 
 
 
448 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  30.43 
 
 
458 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10388  glucooligosaccharide oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14340)  27.83 
 
 
471 aa  102  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451589  normal  0.284571 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.18 
 
 
479 aa  101  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 
461 aa  100  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  33.04 
 
 
532 aa  100  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  31.48 
 
 
465 aa  99.8  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  30.96 
 
 
465 aa  99.8  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  28.65 
 
 
473 aa  99.4  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  28.8 
 
 
499 aa  98.2  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.8 
 
 
465 aa  98.2  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08964  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
470 aa  97.8  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.22 
 
 
478 aa  96.3  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  35.76 
 
 
446 aa  95.5  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  27 
 
 
473 aa  94.7  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.09 
 
 
472 aa  92.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.91 
 
 
466 aa  92.4  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  31.15 
 
 
456 aa  92  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  32.42 
 
 
487 aa  91.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  31.68 
 
 
444 aa  91.3  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  31.84 
 
 
460 aa  90.9  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  27.84 
 
 
705 aa  90.5  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2435  oxidoreductase, FAD-binding, putative  33.15 
 
 
471 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0684957  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  34.07 
 
 
456 aa  90.9  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  31.22 
 
 
469 aa  89.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  32.07 
 
 
462 aa  89  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0639  FAD linked oxidase domain protein  30.11 
 
 
454 aa  89  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  30.2 
 
 
444 aa  89  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0518  histidine kinase  34.88 
 
 
501 aa  88.6  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  30.81 
 
 
465 aa  88.6  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  34.36 
 
 
480 aa  88.6  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  29.19 
 
 
459 aa  88.2  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  31.69 
 
 
466 aa  88.2  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2543  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.95 
 
 
456 aa  88.2  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  28.29 
 
 
466 aa  87.8  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.81 
 
 
490 aa  87.8  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06807  conserved hypothetical protein  30.18 
 
 
982 aa  87  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.522291  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3628  FAD linked oxidase domain protein  30.56 
 
 
451 aa  87.4  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  33.55 
 
 
449 aa  86.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3943  FAD linked oxidase domain protein  29.28 
 
 
448 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 
451 aa  86.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  30.41 
 
 
477 aa  85.9  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1824  FAD linked oxidase domain protein  35.66 
 
 
439 aa  85.9  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  29.52 
 
 
752 aa  84.7  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  29.14 
 
 
459 aa  84.3  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2448  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.38 
 
 
476 aa  84  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.370857  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01787  conserved hypothetical protein  31.64 
 
 
479 aa  82.8  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.433483  normal  0.55935 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2404  FAD linked oxidase domain protein  32.83 
 
 
495 aa  83.2  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  hitchhiker  0.00629594 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.67 
 
 
484 aa  82.8  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03399  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17690)  32.77 
 
 
461 aa  82.4  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.31125 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  34.36 
 
 
764 aa  81.6  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10062  oxidoreductase  34.78 
 
 
479 aa  81.6  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.761932 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05550  conserved hypothetical protein  33.75 
 
 
482 aa  80.5  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.16 
 
 
448 aa  79.7  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3907  twin-arginine translocation pathway signal  30.68 
 
 
489 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  32.07 
 
 
461 aa  79  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11802  oxidoreductase  29.05 
 
 
446 aa  79  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547261 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1145  FAD/FMN-containing dehydrogenase  28.29 
 
 
456 aa  79  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  28.65 
 
 
596 aa  78.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  30.27 
 
 
602 aa  78.6  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09231  FAD binding oxidoreductase CpoX1 (AFU_orthologue; AFUA_2G18050)  30.58 
 
 
575 aa  78.2  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.89 
 
 
462 aa  77.8  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  31.18 
 
 
470 aa  77.4  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.56 
 
 
462 aa  76.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.72 
 
 
726 aa  76.3  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>