298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0061 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
474 aa  937    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.37 
 
 
484 aa  518  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1620  FAD linked oxidase domain protein  52 
 
 
465 aa  402  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.53 
 
 
460 aa  253  7e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6967  oxidoreductase, FAD-dependent  38.55 
 
 
460 aa  253  8.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.581883 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  39.11 
 
 
436 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  36.75 
 
 
462 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.75 
 
 
462 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.75 
 
 
462 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  34.32 
 
 
462 aa  237  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7186  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.72 
 
 
473 aa  229  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  37.04 
 
 
467 aa  215  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  33.77 
 
 
596 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.02 
 
 
462 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1621  FAD linked oxidase domain protein  38.98 
 
 
468 aa  211  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 
469 aa  200  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.28 
 
 
461 aa  197  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  31.39 
 
 
461 aa  197  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  31.85 
 
 
479 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  36.08 
 
 
449 aa  193  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  35.51 
 
 
459 aa  194  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7882  FAD/FMN-containing dehydrogenase  34.68 
 
 
436 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.27 
 
 
472 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  30.06 
 
 
461 aa  189  7e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  31.57 
 
 
499 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  31.68 
 
 
479 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.21 
 
 
444 aa  186  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  31.18 
 
 
479 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  32.01 
 
 
468 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  34.91 
 
 
465 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  30.25 
 
 
459 aa  180  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.48 
 
 
461 aa  179  8e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2907  FAD linked oxidase domain protein  34.75 
 
 
470 aa  179  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.777851  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.92 
 
 
464 aa  179  9e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2915  FAD linked oxidase domain protein  37.81 
 
 
455 aa  177  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000548663  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  32.03 
 
 
478 aa  176  7e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  34.14 
 
 
465 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.5 
 
 
479 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  29.78 
 
 
473 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  30.18 
 
 
463 aa  171  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1824  FAD linked oxidase domain protein  34.15 
 
 
439 aa  170  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  29.82 
 
 
458 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  29.26 
 
 
474 aa  169  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  32.16 
 
 
465 aa  166  9e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3564  FAD linked oxidase domain protein  37.27 
 
 
460 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.293473  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0394  FAD linked oxidase domain protein  34.17 
 
 
441 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  30.42 
 
 
465 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  29.93 
 
 
473 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  31.83 
 
 
456 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  30 
 
 
461 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  30.79 
 
 
465 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.61 
 
 
478 aa  160  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  27.17 
 
 
448 aa  159  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  33.41 
 
 
446 aa  159  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.54 
 
 
474 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  32.74 
 
 
477 aa  157  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  30.66 
 
 
466 aa  157  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  33.04 
 
 
476 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  32.04 
 
 
463 aa  155  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11743  oxidoreductase  33.48 
 
 
461 aa  155  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0117669  normal  0.752588 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  32.97 
 
 
466 aa  154  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31 
 
 
469 aa  152  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  30.51 
 
 
470 aa  152  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  29.2 
 
 
602 aa  151  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  31.47 
 
 
477 aa  150  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.18 
 
 
465 aa  150  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  30.15 
 
 
456 aa  150  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2688  FAD linked oxidase domain protein  31.41 
 
 
452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.70388  normal  0.409872 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  30.87 
 
 
460 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  29.02 
 
 
473 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  39.9 
 
 
462 aa  140  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.63 
 
 
448 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.5 
 
 
472 aa  137  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  38.94 
 
 
462 aa  136  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  28.67 
 
 
456 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  32.43 
 
 
758 aa  134  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  25.17 
 
 
705 aa  130  6e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2207  FAD linked oxidase domain protein  31.96 
 
 
456 aa  127  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  39.08 
 
 
461 aa  123  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  32.74 
 
 
447 aa  120  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4344  FAD linked oxidase domain protein  31.51 
 
 
450 aa  119  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.577793 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2149  FAD linked oxidase domain protein  33.97 
 
 
458 aa  117  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  31.76 
 
 
532 aa  117  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.44 
 
 
451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  29.13 
 
 
480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  27.74 
 
 
752 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10388  glucooligosaccharide oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14340)  27.62 
 
 
471 aa  114  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451589  normal  0.284571 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.73 
 
 
449 aa  113  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.49 
 
 
490 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.67 
 
 
466 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  28.95 
 
 
753 aa  109  9.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  28.23 
 
 
487 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  30.64 
 
 
764 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  25 
 
 
444 aa  106  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0318  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  36.04 
 
 
491 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000970405  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.8 
 
 
481 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  25.72 
 
 
444 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.14 
 
 
726 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.22 
 
 
492 aa  103  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  28.8 
 
 
754 aa  103  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>