192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3156 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3156  FAD linked oxidase-like protein  100 
 
 		 577 aa  1210    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3854  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.8 
 
 		 574 aa  458  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2758  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.76 
 
 		 896 aa  286  7e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2650  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.05 
 
 		 896 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1510  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.5 
 
 		 614 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2583  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.58 
 
 		 896 aa  280  7e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.15241 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2842  FAD linked oxidase domain protein  33.92 
 
 		 864 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0215386 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1539  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.92 
 
 		 864 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1503  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.92 
 
 		 864 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1694  FAD-binding protein  32.47 
 
 		 894 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000469  probable oxidoreductase  32.79 
 
 		 563 aa  273  8.000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0940249  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1411  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.41 
 
 		 891 aa  264  3e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  30.4 
 
 		 479 aa  114  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  33.33 
 
 		 461 aa  110  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.73 
 
 		 449 aa  108  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.66 
 
 		 474 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  22.66 
 
 		 448 aa  107  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  32.88 
 
 		 478 aa  107  8e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.51 
 
 		 479 aa  104  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  32.59 
 
 		 499 aa  103  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  31.03 
 
 		 462 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  30.05 
 
 		 462 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  32.2 
 
 		 463 aa  100  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  30.39 
 
 		 479 aa  99  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  29.9 
 
 		 479 aa  99  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  28.98 
 
 		 473 aa  98.2  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  32.91 
 
 		 461 aa  97.8  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  23.65 
 
 		 448 aa  96.7  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  31.86 
 
 		 468 aa  95.5  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  29.22 
 
 		 474 aa  95.5  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1145  FAD/FMN-containing dehydrogenase  27.99 
 
 		 456 aa  95.1  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.02 
 
 		 472 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.9 
 
 		 464 aa  94  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  30.33 
 
 		 463 aa  92.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  28.41 
 
 		 473 aa  91.7  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  30.25 
 
 		 487 aa  90.9  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  28.26 
 
 		 465 aa  90.9  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.5 
 
 		 444 aa  90.9  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  26.57 
 
 		 705 aa  90.1  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  30.88 
 
 		 458 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.9 
 
 		 461 aa  89.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2435  oxidoreductase, FAD-binding, putative  33.02 
 
 		 471 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0684957  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.12 
 
 		 461 aa  89.4  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  31.22 
 
 		 459 aa  88.6  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.7 
 
 		 469 aa  87.4  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  23.65 
 
 		 448 aa  87  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  31.71 
 
 		 444 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.58 
 
 		 466 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  26.87 
 
 		 752 aa  85.1  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  29.73 
 
 		 469 aa  84.7  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.55 
 
 		 484 aa  84.3  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.9 
 
 		 490 aa  83.2  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.79 
 
 		 478 aa  83.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.57 
 
 		 451 aa  82.4  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2448  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.82 
 
 		 476 aa  82  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.370857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  29.83 
 
 		 532 aa  82  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  31.13 
 
 		 465 aa  82  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  26.73 
 
 		 734 aa  82  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0318  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  27.54 
 
 		 491 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000970405  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.41 
 
 		 492 aa  80.5  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  28.23 
 
 		 764 aa  80.5  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  29.27 
 
 		 444 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  27.13 
 
 		 465 aa  79.7  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  30.54 
 
 		 466 aa  80.1  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.39 
 
 		 481 aa  79.7  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4792  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.3 
 
 		 462 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  30.27 
 
 		 477 aa  78.6  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  25.93 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  29.91 
 
 		 461 aa  77.4  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.57 
 
 		 726 aa  76.6  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  27.57 
 
 		 470 aa  75.1  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  24.46 
 
 		 477 aa  75.5  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10062  oxidoreductase  33.33 
 
 		 479 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761932 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07081  conserved hypothetical protein  28.02 
 
 		 574 aa  74.3  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.206599 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05550  conserved hypothetical protein  26.44 
 
 		 482 aa  74.3  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  28.63 
 
 		 446 aa  74.3  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  31.66 
 
 		 473 aa  73.9  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  29.39 
 
 		 465 aa  73.9  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  25.73 
 
 		 754 aa  73.6  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  31.31 
 
 		 449 aa  72.8  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  25.62 
 
 		 467 aa  72.4  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  28.91 
 
 		 456 aa  72  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7186  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.71 
 
 		 473 aa  71.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  30 
 
 		 602 aa  71.2  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0127  FAD linked oxidase domain protein  28.44 
 
 		 775 aa  70.9  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.48716 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05846  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14630)  29.26 
 
 		 472 aa  70.5  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.85 
 
 		 490 aa  70.5  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7289  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.49 
 
 		 542 aa  69.3  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0772845  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.13 
 
 		 465 aa  69.3  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  29.75 
 
 		 480 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.53 
 
 		 462 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  29.58 
 
 		 460 aa  67.4  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0639  FAD linked oxidase domain protein  25 
 
 		 454 aa  67.4  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  29.56 
 
 		 476 aa  67.4  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  26.34 
 
 		 474 aa  67.4  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1620  FAD linked oxidase domain protein  28.44 
 
 		 465 aa  67  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0518  histidine kinase  30.48 
 
 		 501 aa  66.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  24.53 
 
 		 436 aa  66.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  30.88 
 
 		 466 aa  65.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1824  FAD linked oxidase domain protein  29.95 
 
 		 439 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>